林森
- 作品数：28 被引量：85H指数：6
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金四川省科技创新产业链示范工程更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 牦牛KLF8基因剪切体克隆及组织表达分析
- 2017年
- 为了阐明KLF8基因在牦牛不同组织中的表达水平,试验采用RT-PCR方法克隆KLF8基因剪切体序列,利用荧光定量PCR技术检测该基因在不同组织中的表达丰度。结果表明:获得牦牛KLF8基因剪切体序列长度为1 246 bp(Gen Bank登录号为KX964629),其中CDS为963 bp,编码320个氨基酸,与牛(登录号为XP_010820342.1)的氨基酸同源性达99.69%,无信号肽剪切位点和跨膜结构域,具有KLFs家族保守的锌指功能结构域;KLF8基因在牦牛的脂肪组织中存在高水平表达,极显著高于其他组织(P<0.01)。
- 林森林亚秋林亚秋柏雪柏雪江明锋
- 关键词：牦牛剪切体克隆
- 牦牛KLF2基因功能区克隆及组织表达分析
- 旨在克隆牦牛KLF2(Krupple-like transcription factor2,Kruppel样转录因子2)基因功能区序列,阐明其组织表达规律,并揭示基因与肌内脂肪含量的相关性.以麦洼牦牛为试验动物,利用RT...
- 林森林亚秋柏雪左璐璐江明锋王永
- 关键词：牦牛遗传育种基因克隆
- 泸宁鸡MyoD基因的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2016年
- 为了研究MyoD基因在鸡生长发育与肉质形成中的作用,以泸宁鸡为研究对象,采用RT-PCR技术克隆MyoD基因序列,并利用生物信息学的方法,对其氨基酸同源性、理化性质等进行分析和预测。结果表明：泸宁鸡MyoD基因序列长度为988 bp,其编码的蛋白含299个氨基酸残基,具有碱性螺旋-环-螺旋结构（b HLH）;根据MyoD基因比对,构建的进化树显示泸宁鸡与人等哺乳动物的同源性为63%-67%,与原鸡、绿头鸭、游隼的同源性为94%-99%。
- 龚静林森徐亚欧贺庆华林亚秋
- 关键词：基因克隆生物信息学
- 山羊Wnt10b基因生物学特征及组织细胞表达模式分析
- <正>引言/目的动物脂肪沉积与肉质性状密切相关,过量的脂肪沉积会影响动物产品的风味和品质,适量的肌内脂肪含量可调节肉的嫩度、风味与多汁性[1],因此近年来畜牧工作者对动物脂肪沉积关键基因的功能研究备受关注。Wnt10b是...
- 林森林亚秋朱江江李倩王永
- 关键词：山羊生物学特征基因表达
- 文献传递
- 藏山羊PID1基因克隆及组织表达分析
- 2016年
- 研究旨在获得藏山羊磷酸酪氨酸互作结构域(phosphotyrosine interaction domain containing l,PID1)基因序列,并进一步分析该基因的生物学特性以及揭示其组织表达规律。以藏山羊为材料,利用RT-PCR技术克隆PID1基因,利用荧光定量PCR检测其组织表达特性。结果表明,藏山羊PID1基因CDS区为654bp,编码217个氨基酸,为无跨膜结构的酸性不溶类蛋白。同源性分析表明,藏山羊与山羊的同源性较高为99%,且处在进化树的同一个分支上。PID1在藏山羊的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌等组织中均检测到表达,但在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01)。研究获得了藏山羊PID1基因序列,其在脂肪组织中的表达水平最高。
- 吕明林森朱江江王永梅寒廖红海李倩林亚秋
- 关键词：藏山羊基因克隆
- 山羊Wnt10b基因生物学特征及组织细胞表达模式分析被引量：4
- 2017年
- 为了获得山羊Wnt10b基因序列,并阐明其组织表达谱及在前体脂肪细胞和成肌细胞分化过程中的表达模式。本研究利用胶原酶消化法获得山羊皮下和肌内前体脂肪细胞,利用组织块法获得成肌细胞;采用RT-PCR方法克隆山羊Wnt10b基因序列,荧光定量PCR技术检测该基因在各组织、前体脂肪细胞与成肌细胞诱导分化过程中的表达情况。由分析可知,获得山羊Wnt10b基因序列1 232 bp(Gen Bank登陆号:KU950832),其中CDS为1 176 bp,5'UTR 44 bp和3'UTR 12 bp,编码391个氨基酸残基,山羊Wnt10b氨基酸序列与绵羊的氨基酸序列同源性达98%;Wnt10b m RNA在山羊脂肪组织中表达水平最高,极显著高于其他组织(p<0.01);Wnt10b m RNA随着山羊肌内前体脂肪细胞和成肌细胞的分化表达呈上升趋势,但其在皮下前体脂肪细胞中的表达模式却相反。结果表明,山羊Wnt10b基因在脂肪组织中表达水平最高,可能在脂肪沉积和脂代谢中发挥重要的调控作用,但在皮下和肌内前体脂肪细胞成脂分化的表达模式不同,提示该基因在山羊不同部位脂肪沉积中可能发挥不同的调控作用。
- 林森林亚秋林亚秋李倩李倩
- 关键词：山羊前体脂肪细胞脂肪沉积
- 山羊GPR1基因的克隆及表达特征分析被引量：5
- 2016年
- 本文旨在克隆山羊GPR1基因,对其进行序列分析,并研究组织表达。以简州大耳羊为试验材料,应用RT-PCR方法克隆山羊GPR1基因并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR构建组织表达谱。结果表明：山羊GPR1基因编码区长度为987 bp（Gen Bank登录号：KT347601）,编码蛋白为稳定疏水蛋白;存在7个跨膜结构域,在69~304氨基酸序列属于G蛋白偶联受体家族保守结构域（Pfam：7tm-1）;荧光定量PCR分析表明,GPR1在24月龄山羊心、肝、脾、肺、肾、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌中均有不同程度的表达,其中肺脏中表达量最高且极显著高于其他组织（P〈0.01）,脂肪、脾、肝和心次之,股二头肌中表达量最低;GPR1基因在1~3月龄与24月龄表达变化趋势相同,由背最长肌、股二头肌和臂三头肌呈现逐渐上升的趋势,而8~10月龄则呈现相反的变化趋势。该实验结果为进一步研究GPR基因提供理论基础。
- 廖红海林亚秋朱江江李倩王永林森张小玉
- 关键词：山羊克隆生物信息学分析
- 山羊CCRL2基因的分子克隆和表达分析
- 2017年
- 本研究旨在克隆山羊趋化因子(C-C基序)受体2(chemokine(C C motif)receptor-like 2,CCRL2)基因序列,并研究其组织和时序表达谱。以简州大耳羊为试验材料,应用RT-PCR方法克隆CCRL2基因并进行生物信息学分析,qPCR方法构建该基因在山羊不同组织表达谱和不同月龄背最长肌、股二头肌和臂三头肌中的表达水平,并将基因表达与IMF含量进行相关分析。结果显示:克隆得到山羊CCRL2基因(GenBank登录号:KT165378)长度为1 143bp,编码区长度为1 047bp;qPCR分析表明,CCRL2mRNA在24月龄山羊心、肝、脾、肺、肾、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌中均有不同程度的表达,其中脾表达量最高(P<0.01);时序表达中,CCRL2基因在股二头肌和臂三头肌中的表达量均在8~10月龄极显著高于1~3和24月龄(P<0.01),在背最长肌中则为24月龄极显著高于1~3和8~10月龄(P<0.01);相关分析显示,股二头肌中CCRL2基因mRNA表达量与IMF含量呈极显著负相关(P<0.01)。CCRL2基因可能参与山羊IMF沉积作用。
- 廖红海林亚秋朱江江李倩李倩张小玉林森王永
- 关键词：山羊克隆表达谱肌内脂肪
- 山羊肌内前体脂肪细胞诱导分化过程中内参基因的表达稳定性分析被引量：30
- 2018年
- 旨在通过比较9个内参基因在山羊肌内前体脂肪细胞诱导分化不同时期的表达水平进而最终确定适合山羊肌内前体脂肪细胞分化调控研究最佳的内参基因。本研究利用胶原酶消化法获得山羊肌内前体脂肪细胞,并以分别诱导0、1、2、3、5和6d的细胞为研究对象,利用荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qPCR)技术和geNorm、NormFinder和BestKeeper程序来检测和分析9个候选内参基因(GAPDH、PPIA、18S rRNA、PPIB、UXT、RPLP0、ACTB、EIF3K和TBP)表达的稳定性,并以KLF3和KLF12的实际表达水平进行校正分析。geNorm和NormFinder程序分析表明,UXT稳定性相对最好;而BestKeeper程序分析发现,PPIB表达相对最平稳;3种软件分析结果均表明,同时使用UXT和PPIB可以准确校正在山羊肌内前体脂肪细胞诱导分化不同时期目标基因的表达;通过对KLF3和KLF12表达量的分析发现,选用筛选结果中最稳定(UXT和PPIB、UXT)和最不稳定(EIF3K和18S rRNA)的内参基因进行归一化分析结果有差异。在山羊肌内前体脂肪细胞诱导分化过程中,UXT基因是适合于山羊肌内前体脂肪细胞的成脂诱导分化研究最稳定有效的内参基因,同时使用UXT和PPIB作为内参基因能够获得更加精确的目标基因表达结果,这为后续山羊前体脂肪细胞分化调控相关基因的功能研究奠定了基础。
- 许晴林森朱江江王永王永
- 关键词：山羊内参基因实时荧光定量PCR
- 藏山羊KLF6基因克隆及组织表达分析被引量：2
- 2018年
- 本试验旨在获得藏山羊KLF6基因序列,并分析其序列生物学特征,同时阐明该基因在不同组织中的表达情况。利用RT-PCR技术克隆藏山羊KLF6基因序列,利用实时荧光定量PCR检测其在藏山羊各个组织中的表达丰度。结果表明,获得藏山羊KLF6基因序列1012 bp（登录号：KY677697）,其中包括5＇UTR序列3 bp和3＇UTR序列154 bp,CDS为855 bp,编码284个氨基酸,为无信号肽序列和跨膜结构域的稳定亲水酸性蛋白。KLF6基因在藏山羊的肺脏组织中表达水平最高,极显著高于其他组织（p〈0.01）,在脾脏和脂肪组织中也存在较高水平的表达。本研究为进一步阐明KLF6基因在藏山羊中的生物学功能奠定了基础。
- 池永东王永朱江江林森林森林亚秋
- 关键词：藏山羊KLF6基因克隆
