陈凌
- 作品数：2 被引量：12H指数：2
- 供职机构：内蒙古大学更多>>
- 发文基金：内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 兴安落叶松Ty1-copia型逆转座子逆转录酶序列的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2015年
- 为深入了解兴安落叶松的基因组构成及其逆转座子基因的特征,本研究克隆了其逆转座子逆转录酶序列,并进行了生物信息学分析。根据Tyl-copia型逆转座子逆转录酶的保守序列设计简并引物,并利用PCR技术获得了26条逆转座子逆转录酶序列。这些序列去除引物后的核苷酸长度范围为237~251 bp,序列间相似度为55.9%~90.9%,可被分为6个家族。氨基酸预测结果显示,有3条序列存在移框突变,9条序列存在终止密码子突变。系统进化分析显示,所克隆的17条没有发生终止密码子突变的序列分别与处于不同进化阶段的其他植物的Tyl-copia型逆转录酶具有共同的起源。研究结果证实兴安落叶松含有类型丰富的Tyl-copia型逆转座子,可为该物种逆转座子基因资源的开发和利用提供依据。
- 李雪辉陈凌马钰昆林晓飞白玉娥张国盛张文波
- 关键词：兴安落叶松逆转录酶
- 兴安落叶松Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶的多样性分析被引量：10
- 2016年
- 为分析兴安落叶松（Larix gmelinii Rupr.）逆转座子的特点及其多样性与系统进化关系,本研究利用兼并-PCR技术克隆了27条Ty3-gypsy型逆转座子逆转录酶基因序列。这些核苷酸序列长度变化范围为376~417 bp,同源性范围为55.9%~91.4%,具有较高的异质性。系统聚类分析发现,这27条核苷酸序列被分为7个组。翻译成氨基酸后,其中有8条序列出现了终止密码子突变,有2条序列出现了移框突变。将其氨基酸序列与已登录的其它物种的Ty3-gypsy型逆转座子逆转录酶进行聚类分析发现,兴安落叶松的Ty3-gypsy型逆转座子与枣、黄瓜、可可树等同类型的逆转座子逆转录酶有较近的亲缘关系。以上研究表明兴安落叶松的逆转座子具有高度的多样性,可为分析兴安落叶松基因组构成及遗传多样性提供实验依据。
- 张文波陈凌李雪辉白玉娥林晓飞
- 关键词：兴安落叶松逆转录酶
