苏萌
- 作品数:24 被引量:50H指数:4
- 供职机构:承德医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金河北省自然科学基金高层次人才科研启动基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学农业科学生物学更多>>
- 家蚕cyp450基因家族密码子的用法分析被引量:2
- 2017年
- 为了研究家蚕cyp450基因家族的密码子用法及影响密码子使用模式的主要因子,试验采用多种软件分析家蚕cyp450基因家族的碱基组成、序列同源性、密码子偏好性,得到统计cyp450基因家族密码子使用偏好性的各项参数,并对各项指数进行相关性分析。结果表明:家蚕cyp450基因家族位于AT丰度高的基因组区域,倾向于使用富含A、T且A、T结尾的密码子,整个基因组的同义密码子使用偏好性较弱;cyp450基因家族的序列同源性很低,大多数值在40%左右。突变压力在密码子的三个位置作用程度相关性不显著。说明自然选择引起的碱基组成变化在家蚕cyp450基因家族密码子使用中起主要作用。
- 王晖高妍夏杨帆苏萌张东豪宋永学李季生
- 关键词:家蚕密码子用法自然选择
- 高通量测序确定肠道病毒A71型感染致宿主细胞miRNA表达谱的改变被引量:2
- 2022年
- 目的确定肠道病毒A71型(Enterovirus-A71,EV-A71)感染人扁桃体上皮细胞后miRNA表达谱的改变。方法EV-A71以感染复数为1感染人扁桃体上皮细胞6 h后,采用Trizol提取总RNA,构建小RNA文库,在Illumina NextSeq 500平台进行高通量测序,处理数据后确定差异表达的已知和新型miRNA种类及其靶基因,进行基因本体和信号途径分析;使用psRNATarget预测具有潜在结合EV-A71基因组的差异表达的miRNA种类。实时定量RT-PCR检测差异表达miRNA的变化倍数。结果通过高通量测序共鉴定61个已知差异表达的miRNA(下调21个、上调40个)和559个新型miRNA,新型miRNA具有典型的前miRNA的二级发卡结构。实时定量RT-PCR确定hsa-miR-517b-3p和hsa-miR-199a-5p的变化倍数与高通量测序结果基本一致。差异表达miRNA靶基因涉及到不同的生物学过程和信号途径。共鉴定出24个差异表达的miRNA(5个已知miRNA,19个新型miRNA)具有与EV-A71结合的潜在"种子序列"。结论EV-A71感染人扁桃体上皮细胞后引起miRNA表达谱的显著改变,且差异表达的miRNA可能靶向结合EV-A71基因组进而调控EV-A71复制。
- 孙萍萍柳雪李丹任晴苏萌郭文平杜娈英王蒋丽谢广成
- 关键词:MIRNA高通量测序
- 甘磷酸胆碱对霍乱弧菌转录调控因子AphB活性的影响被引量:1
- 2016年
- 霍乱(Cholera)是一种急性、烈性的腹泻性疾病,霍乱弧菌(Vibriocholerae)为该病的病原体。霍乱弧菌对毒力基因进行调控依赖于复杂的调控系统,ToxR是该系统中重要的调控因子,系统中还需要重要的膜蛋白TcpP的参与。
- 苏萌杜娈英王卉钟增涛高妍夏
- 关键词:转录调控因子霍乱弧菌磷酸胆碱活性腹泻性疾病毒力基因
- 氧压抑制霍乱弧菌毒力表达的机制研究被引量:1
- 2020年
- 目的外界环境因素会对霍乱弧菌的毒力表达产生影响,AphB作为霍乱弧菌毒力调控网络中的关键因子,受氧压抑制作用明显。本实验旨在研究氧压抑制AphB活性的关键位点及机制。方法利用诱变菌株XL1Red对aphB基因进行随机突变,获得突变子文库;将受到AphB调控的tcpP基因的启动子区域与lux报告基因相融合,获得检测用报告质粒;取含有aphB突变基因及报告质粒的菌株在有氧条件下进行培养,通过检测Lux值筛选目标突变株;利用细菌双杂交系统,进一步研究筛选到的突变位点感受氧压的机制。结果筛选到的突变株S267L、M113I和M244I在有氧条件下均表现出高转录调控活性,分别是WT(野生型)的22.8、173.3、30.2倍(P<0.001)。霍乱弧菌验证S267L、M113I是WT的8.2、13.3倍,M244I是WT的14.8倍(P<0.01)。细菌双杂交实验结果表明M113I通过改变蛋白聚合能力从而抵抗氧压的抑制作用。结论S267、M113和M244为氧压抑制AphB活性的关键位点。
- 苏萌谢广成王卉钟增涛杜娈英
- 关键词:霍乱弧菌突变株
- 浅谈人工智能助力下的课程思政创新发展
- 2022年
- 课程思政是落实立德树人根本任务,综合推进价值塑造、知识传授、能力培养,帮助学生塑造正确的世界观、人生观、价值观的战略举措,其建设与发展在当代教育中具有重要意义。人工智能的持续发展为各行各业都带来了新的变化,产生着越来越大的推动作用,教育正是受益者之一。将人工智能与课程思政的建设进行结合,可以使课程思政产生个性化、陪伴性、关联性的新发展,但人工智能助力课程思政实现新发展的前提是人工智能处于合理的监管之下。
- 苏萌李牧乘
- 关键词:人工智能
- 人鼻病毒1B感染致人肺支气管上皮细胞代谢组改变的研究被引量:2
- 2021年
- 目的探讨人鼻病毒1B(human rhinovirus 1B,HRV1B)感染对人肺支气管上皮细胞BEAS-2B代谢组改变的影响。方法HRV1B感染BEAS-2B细胞6 h和12 h后,采用非靶向代谢组学技术研究BEAS-2B细胞代谢组的改变情况。结果HRV1B感染BEAS-2B细胞6 h和12 h分别有93个差异显著代谢产物(differentially significant metabolites,DSMs)(上调47个DSMs、下调46个DSMs)和88个DSMs(上调37个DSMs、下调51个DSMs);HRV1B感染动力学(HRV1B 6 h∶12 h)过程中共鉴定到30个DSMs(上调12个DSMs、下调18个DSMs)。3组中未知DSMs占据比例均较大。脂肪酸、脂质、氨基酸、核苷酸和糖类的比例与HRV1B的感染时间呈现正相关,邻苯二甲酸二异壬酯等为HRV1B感染BEAS-2B细胞后的共同DSMs。结论HRV1B感染致BEAS-2B细胞的脂肪酸、脂质、氨基酸、核苷酸和糖类代谢物发生明显改变。
- 苏萌李丹孙萍萍王春阳王蒋丽王宏章青杜娈英谢广成
- 333例社区获得性肺炎住院儿童中人偏肺病毒和博卡病毒的分子流行及临床特征被引量:7
- 2019年
- 目的了解人偏肺病毒和博卡病毒在肺炎住院儿童中的分子流行及临床特征。方法2017年11月至2018年5月收集因社区获得性肺炎在承德医学院第二临床学院儿科住院儿童的咽拭子标本333份,并收集患者的临床信息。血清学检测腺病毒,呼吸道合胞病毒,流感病毒,副流感病毒的IgM抗体,RT-PCR或PCR检测人偏肺病毒,人博卡病毒,腺病毒,呼吸道合胞病毒和人冠状病毒。结果血清学检测显示43例患者为乙型流感病毒IgM阳性、19例患者为副流感病毒IgM阳性、3例患者为呼吸道合胞病毒IgM阳性、2例患者为腺病毒IgM阳性。PCR或RT-PCR结果显示80例患者为人偏肺病毒感染(其中71例为单独感染、8例为共感染、1例为三重感染)、22例患者为人博卡病毒感染(其中14例为单独感染、7例为共感染、1例为三重感染)、6例患者为腺病毒感染(其中4例为单独感染、1例为共感染、1例为三重感染)、呼吸道合胞病毒和人冠状病毒感染患者各1例且为单独感染。80例人偏肺病毒感染患者中5岁以下患者为39例(11.7%)、5岁以上患者为41例(12.3%)。重症组病毒阳性率为45.0%(18/40),轻症组病毒阳性率为27. 99%(82/293),重症组病毒阳性率高于轻症组(P= 0.042)。重症患者在年龄(P = 0.000)、发热高峰(P = 0.035)、住院时间(P = 0.000),中性粒细胞比例(P = 0.000)和淋巴细胞比例(P = 0.000)与轻症患者相比有显著差异。结论多种呼吸道病毒感染可引起社区获得性肺炎、应加强对人偏肺病毒和人博卡病毒的流行监测。
- 王倩苏萌李丹杜娈英章青王宏刘建英谢广成
- 关键词:社区获得性肺炎人偏肺病毒人博卡病毒住院儿童
- 肠道病毒71型感染UT-SCC-60A对细胞周期阻滞和细胞凋亡发生的研究
- 2018年
- 目的研究肠道病毒71型感染人扁桃体上皮细胞UT-SCC-60A后对细胞周期阻滞和细胞凋亡发生情况。方法以人扁桃体上皮细胞UT-SCC-60A为细胞模型,CCK8试剂盒和流式细胞仪检测Ev71感染UT-SCC-60A后细胞增殖抑制率、凋亡发生和细胞周期阻滞情况。结果EV71对UT-SCC-60A呈现感染时间依赖性抑制,感染48h后抑制率达92.6%;不同剂量的EV71感染均能够显著抑制UT-SCC-60A增殖。EV71感染使UT-SCC-60A以剂量依赖性发生以早期凋亡为主的细胞凋亡,EV71以感染复数为0.5和1感染12h后,早期凋亡细胞比例分别为21.4%和27.1%。EV71感染UT-SCC-60A后使细胞周期阻滞在S期且G0/G1比例下降,EV71以感染复数为1感染12h后,S期比例由对照组的19.0%上升至31.1%,G0/G1期比例由59.8%下降至45.9%。结论Ev71通过使UT-SCC-60A发生S期阻滞来抑制细胞增殖且诱导以早期凋亡为主的细胞凋亡。
- 谢广成李丹苏萌于莉潘静丹王宏章青杜娈英段招军
- 关键词:细胞凋亡细胞周期
- 案例法教学在医学微生物学课程中的应用被引量:10
- 2017年
- 医学微生物学不仅是微生物学中重要的一门基础学科,也是连接临床医学、预防医学的一门重要桥梁课程。传统的教学方法以教师讲授,学生接受为主,难以激发学生对医学微生物的学习兴趣,通过案例法教学可以把理论与实践有机的结合,启发学生的思维,提高学生分析问题、解决问题的能力,有利于教学质量的提高。
- 郭亚春苏萌周晓慧杜娈英方艳辉刘金霞
- 关键词:医学微生物学案例法教学教学改革
- 浅谈自媒体微动画与教育演示的新融合--以微生物动画演示为例被引量:1
- 2017年
- 自媒体时代已经全面来临,其独特的审美特征潜移默化地影响着我们的生活,同时微博微视频等"微言大义"的新形式也海量填充着我们的视野。教育演示作为教育的外在手段受科技影响十分严重,而自媒体时代也成为微动画的发展与传播的沃土,所以二者也可以产生出新的融合。
- 李牧乘苏萌
- 关键词:自媒体审美动画