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李锦

作品数:9 被引量:28H指数:3
供职机构:石河子大学生命科学学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家大学生创新性实验计划更多>>
相关领域:生物学农业科学医药卫生文化科学更多>>

文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 4篇生物学
  • 3篇农业科学
  • 1篇医药卫生
  • 1篇文化科学

主题

  • 5篇基因
  • 4篇雪莲
  • 3篇生物信息
  • 3篇生物信息学
  • 3篇生物信息学分...
  • 3篇天山雪莲
  • 2篇基因家族
  • 1篇蛋白基因
  • 1篇叶绿
  • 1篇叶绿体
  • 1篇叶绿体基因
  • 1篇叶绿体基因组
  • 1篇营养
  • 1篇营养成分
  • 1篇营养成分分析
  • 1篇正交
  • 1篇正交试验
  • 1篇知识库
  • 1篇植物
  • 1篇植物提取

机构

  • 9篇石河子大学
  • 1篇北京大学
  • 1篇浙江大学
  • 1篇中国农业科学...

作者

  • 9篇李锦
  • 5篇祝建波
  • 2篇李永梅
  • 2篇冯玉杰
  • 2篇夏雯雯
  • 1篇闫洁
  • 1篇林忠平
  • 1篇王斐
  • 1篇朱新霞
  • 1篇邱丽娟
  • 1篇陈铭
  • 1篇李鸿彬
  • 1篇王爱英
  • 1篇李榕
  • 1篇谢双全
  • 1篇刘玉玲
  • 1篇陈贤丰

传媒

  • 2篇江苏农业学报
  • 1篇石河子大学学...
  • 1篇农业与技术
  • 1篇分子植物育种
  • 1篇现代园艺
  • 1篇植物学报
  • 1篇植物生理学报
  • 1篇教育进展

年份

  • 1篇2023
  • 2篇2022
  • 1篇2021
  • 1篇2018
  • 1篇2017
  • 3篇2016
9 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
两种不同生境植物棉花与雪莲CDPK1基因的克隆及生物信息学分析被引量:2
2016年
为了研究两种不同生境植物钙依赖性蛋白激酶基因1(CDPK1)的差异,分别从冷敏感作物陆地棉和高耐寒植物天山雪莲中克隆得到GhCDPK1和SikCDPK1基因。通过生物信息学分析发现,GhCDPK1和SikCDPK1的开放阅读框长度分别为1 764 bp和1 716 bp,各编码587和571个氨基酸。蛋白质表现为弱酸性,且不稳定,亲水;二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功;无跨膜结构域和信号肽,有多个磷酸化位点,但数量存在差异;均具有典型的CDPK保守结构域。GhCDPK1和SikCDPK1氨基酸序列同源性为79.9%,二者明显的区别在于GhCDPK1含有4个EF-hand基序,但SikCDPK1只存在2个EF-hand基序。进化分析结果表明,GhCDPK1与可可CDPK1亲缘关系最近,SikCDPK1与菊花CDPK2亲缘关系最近。
田晓涵刘玉玲李永梅李锦庞学兵祝建波朱新霞
关键词:生物信息学
高校新进教师入职培训问题分析及策略
2021年
高校教师是高校发展的核心力量,是高校长远发展的重要载体,新进教师则是高校教育长远的新生力量和继代传承,对高校未来发展影响不可忽视。新进教师的岗前教育培训与高校未来发展受到我国以及世界各国高校的关注与重视。而高校入职培训因存在课程形式单一,部分内容浅显、针对性较弱、新教师培训积极性不高以及教师角色转换缓慢等问题,是新进教师培训效果不佳最重要因素。针对这一问题,本文从培训课程内容设计与新教师的角度逐一分析问题的原因,并提出几点建议,为提高高校新教师入职培训的质量,促进高校师资力量的创新与发展提供思路。
谢全亮李锦张彦兵李榕谢双全王斐李鸿彬
关键词:入职培训角色转换
天山雪莲叶绿体基因组密码子偏好性分析被引量:7
2022年
分析天山雪莲叶绿体(cp)基因组密码子使用偏倚的一般模式和影响因素,为提高转基因植物外源基因的表达效率以及了解药用植物雪莲的基因功能研究提供了理论基础。利用生物信息学方法从雪莲叶绿体基因组中筛选出50条长度大于300 bp且以ATG为起始的蛋白编码基因为对象,找出导致密码子偏倚的影响因素。结果表明:第三位的GC平均含量为27.70%,有效密码子数(ENC)变化范围35.59~57.43之间;同义密码子相对使用度(RSCU)>1的密码子有30个,其中29个以A/U结尾;中性绘图显示GC_(3)和GC_(12)的相关系数为0.062,相关性不显著,回归曲线斜率为0.094 6;ENC-plot分析显示ENC比值位于-0.1~0.1区间的基因有37个,大部分基因沿抛物线轨迹分布,但也有几个低ENC的基因分布于曲线下方;奇偶偏好图(PR2-plot)分析显示,第3个碱基的密码子使用不平衡;对应分析结果表明,第1轴贡献率为17.61%,第2、3、4轴贡献率分别为11.59%、7.97%和5.8%,且第1轴与密码子适应指数(CAI)、密码子偏爱指数(CBI)呈负显著相关;最终确定了22个最优密码子,且均以A/U结尾。
何亚玲彭业军李锦冯斌秦玉杰王爱英祝建波
关键词:天山雪莲叶绿体基因组密码子偏好性
新疆天山雪莲转录组注解知识库被引量:2
2017年
新疆天山雪莲(Sasussured involucrata)具有较高的极端低温耐受特性,为低温耐受机制研究提供了一种非常好的模式植物。新疆天山雪莲转录组注解知识库(http://www.shengtingbiology.com/Saussurea KBase/index.jsp)是基于网络数据资源的综合性数据库,由html、Perl、Perl CGI/DBD/DBI、Java和Java Script编程所设计的前端界面和用于数据存取、注释及管理的后端数据库管理系统Postgrel SQL构成。知识库包含基因组数据、转录组原始数据、质量控制数据、GC含量、功能基因序列及注释、功能基因代谢通路、功能基因的注释统计、雪莲与其它物种的转录组或基因组比较分析数据和生物分析软件包等资源。该数据库不仅有利于低温功能基因组学及低温耐受机制研究,而且为冷耐受性状物种的分子育种提供基因资源平台和理论依据。
李锦严潘瑶钱飞箭邱宝义夏雯雯牟晓威邱丽娟林忠平陈铭祝建波陈贤丰
关键词:天山雪莲知识库转录组抗逆功能基因
能源植物橡胶草TkGGPPS基因的克隆及表达分析被引量:2
2016年
牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶(geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)是植物细胞萜类物质合成的重要调节靶点。利用RT-PCR和RACE技术首次从橡胶草(Taraxacum kok-saghyz)中克隆得到一个GGPPS基因,命名为TkGGPPS(GenBank:KT028713),TkGGPPS cDNA全长1 140 bp,编码379个氨基酸。序列分析表明,TkGGPPS基因属于类异戊二烯超家族成员,其功能可能与萜类物质的合成有关。氨基酸序列同源性比对与系统进化分析表明,TkGGPPS与向日葵Ha GGPPS的亲缘关系较近,相似性为74.67%。实时定量PCR的结果表明,TkGGPPS基因在第6周橡胶草的主根和成熟的种子中显著表达。上述结果为进一步研究橡胶草产胶代谢途径和产胶合成相关基因功能提供一定的理论指导和技术支持。
李永梅冯玉杰李锦赵李婧闫洁
关键词:橡胶草基因克隆
天山雪莲水孔蛋白基因(AQP)家族鉴定与生物信息学分析被引量:4
2016年
为研究新疆天山雪莲水孔蛋白基因(AQP)家族并对其基因家族成员进行鉴定及分类,从雪莲转录组数据库中获得了33条天山雪莲水孔蛋白基因序列,利用生物信息学软件,将其与拟南芥中38条水孔蛋白基因序列进行分析、分类和保守序列分析,结果显示天山雪莲33条AQP基因家族序列与拟南芥38条AQP基因序列一样分成4个亚族,即质膜水孔蛋白(Plasma membrane intrinsic protein,PIP)基因、液泡膜内在水孔蛋白(Tonoplast intrinsic protein,TIP)基因、类Nodulin(NOD26)膜内在水孔蛋白(NOD26-like membrane intrinsic protein,NIP)基因和膜内小基本蛋白(Small and basic membrane intrinsic protein,SIP)基因。拟南芥与天山雪莲AQP基因间具有较高的保守性。对天山雪莲AQP基因家族进行了系统进化树构建,并分析了水孔蛋白氨基酸组成成分、理化性质,预测了二级结构,发现水孔蛋白不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列间的亲水性存在一定差异,水孔蛋白的二级结构以α螺旋、β折叠、无规则卷曲为主。从这33条AQP基因序列中克隆了3个水孔蛋白基因,测序结果证明天山雪莲转录组数据库基因序列准确率较高。
夏雯雯李锦祝建波
关键词:天山雪莲生物信息学
陆地棉干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析
2023年
干扰素相关发育调节因子(interferon-related developmental regulator factor,IFRD)主要参与植物耐盐机制和-ABA-信号传导途径。为深入了解陆地棉IFRD基因家族功能,本研究通过对锦葵科植物陆地棉IFRD基因家族成员进行了染色体定位、亚细胞定位、构建进化树、基因结构可视化、motif序列检测、构建蛋白互作网络及表达模式等生物信息学分析,鉴定得到了15个陆地棉IFRD基因家族成员,分布在陆地棉的九条染色体上,根据系统发育树分析将其分为两个亚家族,亚家族Ⅰ成员与锦葵科植物同源性较高、亚家族Ⅱ成员与锦葵科和蔷薇科同源性较高;GhIFRD亚家族Ⅱ成员在陆地棉各组织中表达量比亚家族Ⅰ成员较高,推测其参与陆地棉生长发育的调控;GhIFRD亚家族Ⅰ、亚家族Ⅱ都有部分成员响应逆境胁迫。通过陆地棉蛋白互作发现陆地棉IFRD可能参与mRNA的剪切、核糖体的加工以及核糖体上蛋白起始翻译、DNA损伤修复过程。启动子分析显示:亚家族Ⅰ成员GhIFRD13具有较多的激素类调节元件与逆境响应元件,推测其在陆地棉逆境胁迫响应中起重要作用。研究表明陆地棉IFRD基因家族可能通过mRNA可变剪切、蛋白质合成参与陆地棉生长发育以及高温、低温、盐胁迫等逆境响应途径。本研究为进一步研究陆地棉IFRD基因家族功能提供了参考,为研究陆地棉响应逆境胁迫的分子机制提供了新方向。
王雨萌王泽辉张欢曹文婧林雪枫邱鑫李锦王赛赛
关键词:陆地棉基因家族生物信息学分析
不同化学防腐剂及植物提取物对组培中常见真菌抑制效果研究被引量:11
2018年
目的:研究化学防腐剂及植物提取物在单一及复配条件下对组织培养过程中常见霉菌的抑制效果,为防腐剂降低组培污染率提供依据。方法:利用涂布平板法测定单一及复配防腐剂对青霉和黑曲霉的抑制作用。结果:肉桂酸钾、尼泊金复合酯对青霉和黑曲霉抑菌效果优于丙酸钠、山梨酸钾,最小抑菌浓度(Minimal inhibitory concentrations,MIC)分别为0.040%、0.035%;大蒜提取物、阿魏提取物、薰衣草精油的抑菌效果优于孜然提取物,MIC分别为0.9%、1.4%、0.35%。与单个防腐剂相比,复合防腐剂抑菌效果更好。通过尼泊金复合酯、肉桂酸钾和大蒜提取物3因素正交试验设计,发现对青霉抑制最优组合浓度分别为0.02%、0.03%、0.2%,或0.03%、0.03%、0.15%,对黑曲霉抑制最优组合浓度分别为0.03%、0.02%、0.2%。结论:采用防腐剂与植物提取物复配方式可以抑制霉菌孢子萌发及菌丝生长,在降低组培污染率具有较好的应用前景。
杨丽李永梅杨丽霞李锦冯玉杰祝建波
关键词:化学防腐剂植物提取物霉菌正交试验MIC
新型木本饲用植物枸树和杂交枸树营养成分分析
2022年
枸树,落叶乔木,有生长发育迅速、适应性强、易栽培、耐高温、伐木周期短等优点;杂交枸树,是由中国科学院植物所专家专门培育出的新型枸树品种,是中国新兴的优良木本饲料用植物之一。本研究以枸树和杂交枸树的叶片为主要研究对象,对其基础营养成分按照饲料国标法进行测定,并与日常饲料中的基础营养成分进行了对比分析。结果发现,杂交枸树粗蛋白(24.57%)、粗灰分(17.93)和总糖(9.25%)的含量高于枸树(22.23%、16.00%、8.52%),粗纤维(16.77%)粗脂肪(2.92%)和含水量(64.40%)低于枸树(19.40%、3.04%、67.73),同时相比其他常规饲料,枸树和杂交枸树营养成分含量基本高于常规饲草。结合以上各项指标,我们可以指出枸树与杂交枸树的树叶是一类含有蛋白质、糖类的优质木本饲用植物,这将为新型木本饲用植物资源的合理开发和利用提供了了新思路、新途径。
刘晓燕李奥威赵真瑕王丽娟张晓丽李锦
关键词:营养成分
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