周淦
- 作品数:2 被引量:9H指数:1
- 供职机构:华南农业大学农学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 茉莉酸甲酯诱导水稻磷酸化蛋白质组的差异表达分析
- 茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)作为一种重要的信号分子,可诱导水稻对稻瘟菌的抗病性。蛋白质可逆磷酸化作为一种主要的蛋白质翻译后修饰,在调节细胞信号转导等过程中起到了重要作用。开展MeJA诱导后水稻...
- 张健芳周淦孙冉冉李云锋王振中
- 关键词:茉莉酸甲酯水稻磷酸化蛋白质组双向电泳
- 文献传递
- 尖孢镰刀菌甜瓜专化型基因组规模分泌蛋白的预测与分析被引量:9
- 2016年
- 利用Signal P、Wo LF PSORT、TMHMM、big-PI Predictor、Target P和Secretome P等软件,对尖孢镰刀菌甜瓜专化型(Fusarium oxysporum f.sp.melonis,FOM)全基因组26 811条蛋白质氨基酸序列进行了分泌蛋白的预测分析。结果表明,FOM全基因组编码蛋白中有1 145个经典分泌蛋白,占编码蛋白总数的4.3%;有8 471个非经典分泌蛋白,占编码蛋白总数的31.6%。对经典分泌蛋白特征进行分析,发现其氨基酸长度集中在100~600个氨基酸,信号肽长度集中在17~22个氨基酸。对经典分泌蛋白的功能预测分析表明,有605个分泌蛋白获得了注释,主要涉及糖代谢、转运过程、过氧化氢代谢和生物合成等。对碳水化合物酶类(CAZymes)进行分析,结果表明有277个分泌蛋白为CAZymes,占经典分泌蛋白总数的24.2%。
- 聂燕芳周淦黄嘉瑶王振中李云锋
- 关键词:分泌蛋白信号肽