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姜秀明

作品数：5 被引量：122H指数：5
供职机构：东北农业大学园艺学院更多>>
发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目黑龙江省杰出青年科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学农业科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 3篇生物学
  • 2篇农业科学

主题

  • 5篇转录
  • 5篇转录因子
  • 3篇番茄
  • 3篇GRAS
  • 2篇植物
  • 2篇植物转录因子
  • 2篇生物信息
  • 2篇生物信息学
  • 2篇基因
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇生物学
  • 1篇生物学功能
  • 1篇转录因子家族
  • 1篇系统进化
  • 1篇结构特点
  • 1篇进化
  • 1篇克隆
  • 1篇基因家族
  • 1篇基因克隆
  • 1篇家族

机构

  • 5篇东北农业大学

作者

  • 5篇许向阳
  • 5篇姜秀明
  • 1篇李景富

传媒

  • 2篇分子植物育种
  • 2篇基因组学与应...
  • 1篇中国农学通报

年份

  • 5篇2016
共 5 条 记 录，以下是 1-5
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排序方式：
番茄NAC基因家族的系统进化及表达分析被引量：11
2016年
本研究挖掘番茄(Solanum lycopersicum)中NAC转录因子家族成员104个,为研究番茄NAC转录因子在响应生物及非生物胁迫中的调控作用提供理论基础,也为番茄NAC转录因子的全基因组分析提供了依据。通过SOL数据库下载番茄NAC、NAM基因及蛋白序列,根据NAC保守域序列号PF01849、PF02365,利用HMMER 3.0软件鉴定番茄NAC基因。再利用保守结构域预测软件Pfam和SMART对候选序列进行筛选鉴定。使用DNAMAN5.0、Web Logo、MEGA5.2、GSDS2.0、Map Inspect、Ex Pasy和Swiss-Model等软件对获选番茄NAC转录因子进行生物信息学分析。通过RT-PCR技术检测番茄NAC转录因子在不同组织中的表达情况。本实验通过生物信息学方法对番茄中NAC基因家族成员进行了预测及分析。预测及分析结果显示,番茄NAC基因家族包含104个蛋白质,通过分组鉴定和进化树分析将番茄NAC基因家族分为12个亚族,番茄特有的TNAC亚族成员最多为28个。本实验对挖掘到的104个NAC转录因子的分子量、等电点、保守结构域及蛋白质二、三级结构进行了预测及分析。本实验选取12个NAC转录因子家族成员进行RT-PCR技术检测,获得其在根、茎、叶、花、果中的表达情况,半定量结果显示,7个Sl NAC基因在根、茎、叶、花、果(红熟)中均有表达,并呈现出多种表达模式。番茄NAC转录因子家族在结构上高度保守,并参与番茄生长发育、生物及非生物胁迫的调控过程。
姜秀明牛义岭许向阳
关键词：番茄NAC生物信息学转录因子
植物转录因子GRAS蛋白的研究进展被引量：8
2016年
GRAS转录因子是植物特有的转录因子,已在多种植物中被发现,且GRAS蛋白具有其特有的功能结构域,根据对模式植物拟南芥和水稻的GRAS基因家族进行进化分析,可将GRAS基因家族划分为8个亚族:LISCL、PATI、SCL3、DELLA、SCR、SHR、LS和HAM,各个亚族调控不同的功能区域。已发现GRAS蛋白广泛参与植物的生长发育、信号转导、逆境胁迫等生理过程,本综述就GRAS蛋白的结构特征及相应的功能特性和最新的研究进展进行归纳总结。
牛义岭姜秀明许向阳李景富
关键词：转录因子GRAS
番茄GRAS转录因子家族基因SIGLD1的克隆及VIGS载体构建被引量：18
2016年
本研究以醋栗番茄（LA2184）为材料，运用生物信息学方法和PCR技术，预测SIGLDl基因与番茄抗冷的相关性，设计SIGLDI基因的特异性引物，克隆出片段长度为413bp的序列。以番茄八氢番茄红素脱氢酶（phytoenedesaturase，PDS）基因作为阳性对照，该基因克隆片段长度为427bp。系统进化树显示，SIGLDI基因与拟南芥中已发表过的抗冷基因聚类在一起，利用RT．PCR技术，检测SIGLDI基因在不同冷处理时间点上的表达量，发现SIGLDI基因在3～6h的表达量最高，说明该基因在番茄的抗冷过程中发挥重要作用。本研究成功构建出SIGLDI、PDS基因的病毒诱导基因沉默的重组载体。构建的pTRV2-SIGLDI、pTRV2-PDS重组载体将为下一步研究番茄中SIGLDI基因的功能验证奠定实验基础。
牛义岭姜秀明许向阳
关键词：番茄基因克隆
番茄GRAS转录因子家族的生物信息学分析被引量：5
2016年
笔者旨在进一步了解番茄GRAS基因家族的结构特征和进化信息,为GRAS转录因子的后续研究提供理论基础。利用HMMER 3.0软件,通过从Pfam蛋白数据库中下载的GRAS保守域(PF03514),来鉴定番茄GRAS基因。采用MEGA5.2、Web Logo 3、DNAMAN 5.0、Map Inspect和MEME等软件对其蛋白序列进行生物信息学分析。采用RT-PCR技术检测番茄GRAS基因在番茄根、茎、叶、花和果实中的表达情况。番茄基因组共挖掘出53条GRAS转录子基因,划分为I、II、III、IV、V、VI、VII、VIII 8个亚族。系统进化树结果显示V和VI组中GRAS家族成员最多,且拟南芥的GRAS基因家族中基因功能类似的基因聚类的在一起,则可能同组内番茄GRAS基因家族成员也具有类似功能;染色体定位分析显示GRAS基因在12条染色体中呈不均匀分布;根据Web Logo 3.0对GRAS基因家族的结构域蛋白分析,结果显示GRAS基因家族的蛋白序列并不都是高度保守的;保守元件分析表明番茄GRAS基因家族成员是部分高度保守的。番茄GRAS基因家族大部分成员结构是高度保守,可能参与调控番茄生长和发育等过程。
牛义岭姜秀明许向阳
关键词：番茄GRAS转录因子基因家族生物信息学
植物转录因子MYB基因家族的研究进展被引量：82
2016年
植物转录因子MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)是近年来发现的一类与调控植物生长发育、生理代谢、细胞的形态和模式建成等生理过程有关的一类转录因子,在植物中普遍存在,同时也是植物中最大的转录家族之一,MYB转录因子在植物的代谢和调控中发挥重要作用。大多数MYB蛋白在N端含有一段氨基酸残基组成的Myb结构域,根据这个高度保守的结构域的结构特征可将MYB转录因子分为四类:1R-MYB/MYB-related;R2R3-MYB;3R-MYB;4R-MYB(4个R1/R2的重复)。MYB转录因子具有多种生物学功能,广泛参与植物根、茎、叶、花的生长发育,与此同时,MYB基因家族对干旱、盐渍、冷害等非生物胁迫过程也有响应,此外MYB转录因子还与某些经济作物的品质好坏密切相关。本综述主要对MYB转录因子的结构特点、生物学特性、调控机理等方面归纳总结前人的研究成果,详细阐述国内外相关研究进展,以期为后续研究做相关参考。
牛义岭姜秀明许向阳
关键词：MYB转录因子结构特点生物学功能
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