徐峰
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 供职机构：天津国际生物医药联合研究院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金天津市科技支撑计划天津市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 基于结构的利用分布式计算的虚拟筛选（英文）被引量：1
- 2015年
- 药物虚拟筛选的方法被广泛应用于从百万数量级的类药分子数据库中挑选出潜在的活性候选化合物,相比较于传统的流程可以显著降低研发成本和时间。为此,我们建立了一个大型分布式计算阵列,本论文详细说明了阵列系统的建立方法和对应的虚拟筛选流程。通过对以极光激酶A为药物筛选靶点的测试,我们从数据库中得到了包含已知的高活性分子等多个候选化合物,验证了系统的可行性。
- 谭善阳王泰一王珲徐峰
- 关键词：分布式计算
- 人源神经降压素受体-1稳转细胞系的建立及其应用
- 2014年
- 神经降压素受体-1(neurotensin receptor-1,NTR1)是G蛋白偶联受体家族的成员,调节细胞内钙离子的水平。NTR1与多种疾病的发生发展密切相关。为寻找与NTR1相关的拮抗剂,建立了稳定表达人源NTR1蛋白的中国仓鼠卵巢细胞系CHO/NTR1。将重组质粒利用脂质体转染的方法转入CHO细胞,加入G418抗生素进行筛选,采用Western blotting和钙离子浓度检测来评判CHO/NTR1细胞系是否构建成功。通过钙离子浓度检测,可以得到NTR1的天然配体神经降压素(neurotensin,NT)的EC50值和NTR1的已知拮抗剂SR48692的IC50值。结果提示,人源CHO/NTR1稳转细胞系可以用来研究NTR1的生物学特征和进一步筛选NTR1的拮抗剂与激动剂。
- 张果孙涛刘慧娟牛国君徐峰
- 关键词：CHO
- 基于公共sRNAs库的病毒检测分析研究
- 2014年
- 以公共的small RNAs(sRNAs)新一代测序数据为材料,通过生物信息学的分析方法检测生物实验系统样品中存在的病毒,讨论病毒与宿主间的关系,病毒的种属特性,进而指导生物实验设计.从GEO Datasets数据库下载917个已发表的sRNAs高通量测序数据,通过生物信息学分析共检测出来自334个样品库的2,107条高度同源的病毒序列和2,930条疑似的病毒序列.这些病毒主要是正链RNA病毒、反转录病毒和双链DNA病毒,集中在花椰菜花叶病毒科、反转录病毒科、杆状病毒科和芜菁黄花叶病毒目.
- 王亚静王珲王敏徐峰
- 关键词：病毒检测SMALLRNAS病毒分类抗病毒免疫下一代测序
