刘庆全
- 作品数:3 被引量:4H指数:1
- 供职机构:复旦大学更多>>
- 发文基金:公益性行业(农业)科研专项上海市科技兴农重点攻关项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 淞江鲈HSP70基因cDNA部分序列克隆及其组织表达差异被引量:1
- 2013年
- 为了研究HSP70(heat shock protein 70)是否可作为淞江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)养殖中的应激监测分子指标,根据鲤鱼热应激蛋白70基因序列(AYl20894)设计并合成引物,以淞江鲈肝脏组织总RNA为模板,获得淞江鲈HSP70基因cDNA部分序列,长度为480bp,GenBank登陆号为KC342053.序列分析结果显示此序列与红笛鲷(Lutjanus sanguineus)等有较高的同源性.同时,应用所获淞江鲈HSP70基因部分序列,以淞江鲈β-actin基因的序列(HM449124)为内参,利用荧光定量PCR技术,检测淞江鲈肌肉、肠、脑、皮肤、性腺、肝脏、心脏、鳃、鳍9个组织的表达差异.结果表明,HSP70在淞江鲈9个组织中普遍表达,其中在鳍中表达量最高,在性腺、鳃、脑、肌肉、肝脏、皮肤、肠中的表达量依次递减,在心脏中表达量最低.在鳍中HSP70的表达量可能成为衡量淞江鲈应激程度的指标.
- 刘庆全罗武松郑映荷许耀高峰秦志浩倪雯雯王金秋
- 关键词:热应激蛋白70克隆荧光定量
- 淞江鲈肝脏组织cDNA文库的构建与部分EST测序
- 2015年
- 以成年雌性淞江鲈肝脏组织为材料,用TRIzol Reagent试剂提取总RNA.以总RNA为模板,先用逆转录酶合成cDNA第一链,再通过LD-PCR合成cDNA第二链,所得双链DNA分子用SfiⅠ酶切处理后,连接到同样经SfiⅠ酶切处理的改良pUC19载体上,获得重组质粒.将重组质粒导入大肠杆菌DH5α感受态细胞中,建成质粒cDNA文库.经鉴定,该文库库容为1.5×106,重组率为94.5%,平均插入片段长度为1.1kb,插入片段大小分布为0.5~2.0kb.从文库中随机挑选2 200个克隆进行5’端单向测序,剔除不合格序列后,得2 002条高质量表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)序列,提交dbEST数据库.经筛选,从这些EST序列中共发现471个基因,分别对其进行了KOG功能分类预测(216个蛋白被注释上21种KOG分类)、KEGG注释(186个基因注释上175个KO,139个基因注释上195个pathway)和GO功能分类注释(312个蛋白被注释上GO分类).
- 许耀刘庆全罗武松秦志浩王金秋
- 关键词:肝脏CDNA文库EST序列
- 淞江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)HSP70全序列的克隆及其表达的初步研究
- 淞江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel),英文名:Roughskin sculpin,隶属于鮋形目(Scorpaeniformes),杜父鱼科(Cottidae),淞江鲈属(Trachider...
- 刘庆全
- 关键词:热应激蛋白规模化养殖
- 文献传递