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吴璟莉: 作品数：74 被引量：162H指数：7; 供职机构：广西师范大学更多>>; 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金国家自然科学基金广西高等教育教学改革工程项目更多>>; 相关领域：自动化与计算机技术文化科学生物学轻工技术与工程更多>>

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一种多元聚合酶链反应的引物集选择算法被引量：1: 2008年; 多元聚合酶链反应(multiplex PCR,MP-PCR)是一种运用多对引物同时扩增多条DNA序列或一条DNA序列上多个区域的生物学实验方法.引物集设计对于实验的成功至关重要.由于引物合成是实验成本的主要来源,且引物需要满足许多约束条件,因此设计满足多约束条件的最小引物集是保证实验成功、降低实验成本的有效手段.首先给出多约束最小引物集选择问题(minimum primer set selection problem with multiple constraints,MPSSPMC)的数学模型,通过引入新颖的遗传算子,提出一种求解该问题的单亲遗传算法MG-PGA.实验结果表明MG-PGA在满足多约束条件下能获得较小的引物集,为MP-PCR引物设计提供了一种有效的解决方法.; 吴璟莉陈建二王建新; 关键词：引物设计贪心算法单亲遗传算法

数据库优化设计方法初探被引量：17: 2005年; 从范式优化、索引优化、表的优化及查询优化探讨数据库优化设计的方法,并对它们的综合使用进行分析。数据库优化设计时,在逻辑设计阶段,要根据范式优化及表优化中的要求设计数据库逻辑结构,对两者的利弊进行权衡,选出折衷的方案,既可以避免不一致性和数据异常现象,又不影响整体的性能;在数据库物理设计阶段,要根据索引优化中的要求在有关属性或属性的组合上建立索引,以优化数据库物理结构;在数据库查询阶段,采用在条件子句中使用索引,嵌套查询,迟早执行选择操作,迟早消除不满足条件的记录,分组计数和避免困难的正规表达式6种优化策略,可大大提高查询效率。; 吴璟莉刘仁辉何冬黎; 关键词：索引优化设计数据库数据库查询逻辑结构嵌套查询子句

纤维肌痛综合征生物标记物的筛选及免疫细胞浸润分析: 2025年; 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义。目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛综合征潜在的诊断相关标志基因,并分析其免疫细胞浸润特征。方法:对来自基因表达综合数据库(GEO)的纤维肌痛综合征数据集转录谱进行差异分析和WGCNA分析,整合筛选出差异共表达基因,进一步采用机器学习套索回归(LASSO)算法、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)机器学习算法来识别核心生物标志物,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线以评估诊断价值。最后,采用单样本基因集富集分析(ssGSEA)和基因集富集分析(GSEA)评估纤维肌痛综合征的免疫细胞浸润情况及通路富集。结果与结论:①对GSE67311数据集按照log2|(FC)|>0,P<0.05的条件进行差异分析后获得8个下调的差异表达基因;进行WGCNA分析后获得正相关性最高(r=0.22,P=0.04)的模块(MEdarkviolet)内含基因497个,负相关性最高(r=-0.41,P=6×10-5)的模块(MEsalmon2)内含基因19个;将差异表达基因与WGCNA的2个高相关性模块基因取交集,获得7个基因。②对上述7个基因进行LASSO回归算法筛选出4个基因,进行SVM-RFE机器学习算法筛选出5个基因,两者取交集后确定了3个核心基因,分别为重组1号染色体开放阅读框150蛋白(germinal center associated signaling and motility like,GCSAML)、整合素β8(Integrin beta-8,ITGB8)和羧肽酶A3(carboxypeptidase A3,CPA3);绘制3个核心基因的ROC曲线下面积分别为0.744,0.739,0.734,提示均具有很好的诊断价值,可作为纤维肌痛综合征的生物标志物。③免疫浸润分析结果显示,与对照组相比纤维肌痛综合征患者记忆B细胞、CD56 bright NK细胞和肥大细胞显著下调(P<0.05),且与上述3个生物标志物显著正相关(P; 刘雅妮杨静欢陆慧慧易玉芳李智翔欧阳福吴璟莉魏兵; 关键词：纤维肌痛综合征生物信息学

求解自行车共享系统静态再平衡问题的单亲遗传算法被引量：5: 2020年; 自行车共享系统具有改善城市交通出行结构,减少交通污染等优点。各站点自行车数量相对平衡对于提高共享系统的利用率非常重要,自行车共享系统再平衡问题应运而生。该问题属于NP难问题。2017,年Fábio等提出求解单车多访问静态再平衡问题的ILS算法,获得了较好的结果,但是该算法结构较为复杂,修复算子耗费大量时间,且修复后得到劣质解的概率较大,影响了优化结果。针对该问题,提出基于单亲遗传算法的求解方法P-SMSBR,设计了较为简练的优化过程,运用十进制编码表示运载车路径方案,引入7种变异算子参与演化,并采用精英策略增强算法的搜索能力。利用大量模拟数据和真实数据对算法性能进行测试,实验结果表明,P-SMSBR算法具有较好的优化效果,能够在较短的时间内获得较ILS算法更短的运载车路径方案,且随着站点数的增多,P-SMSBR算法优势更加显著,是一种求解自行车共享系统静态再平衡问题的有效方法。; 冯炳超吴璟莉; 关键词：单亲遗传算法

基于弱一致性模型识别关键蛋白质的方法: 本发明公开了一种基于弱一致性模型识别关键蛋白质的方法，包括如下步骤：1）设置弱一致性的条件；2）弱一致性模型评估。这种方法识别效率和实用价值高，为关键蛋白质的识别提供了新思路。; 李高仕胡志鹏吴璟莉罗新龙

慕课背景下的大学计算机基础课程混合教学模式被引量：19: 2019年; 分析大学计算机基础的课程特色和区域教学现状,提出慕课背景下基于专业特征分类的大学计算机基础混合教学模式,结合广西师范大学的实例,阐述线上线下混合教学模式的设计和实践过程,最后说明教学效果。; 王利娥刘红翼吴璟莉张灿龙朱新华邓福欣张兰芳; 关键词：大学计算机基础混合教学模式

求解三倍体个体单体型重建问题的遗传算法被引量：1: 2014年; 针对最少错误更正(the minimum error correction,MEC)模型,对三倍体个体单体型重建问题进行研究,提出一种基于遗传算法的三倍体个体单体型重建算法GTIHR.该算法采用一种新颖的染色体编码方法和一种有效的爬山算子.这种较短的染色体编码方式能够构造较小的解空间,以便于算法快速收敛到较优解.此外,爬山算子通过为染色体编码注入随机信息来避免早熟现象,并充分利用SNP片段中的有效信息来逐步修正染色体编码取值.实验利用鸟枪法测序模拟片段生成器CELSIM生成片段数据.与以往求解算法的比较分析结果显示,GTIHR算法能够获得更高重建率的单体型,具有较强的实用价值.; 吴璟莉王兆灿; 关键词：单核苷酸多态性三倍体单体型遗传算法

一种用带权SNP片断重建单体型的启发式算法: 2008年; 近年来,单体型检测问题已经得到了广泛的研究,成为计算生物学最热门的领域之一.本文对个体单体型重建问题进行研究,提出一种基于带权最少字符修改模型重建单体型的启发式算法HAW.HAW算法首先生成一对初始单体型,然后通过对初始单体型的不断扩充完成重建.实验结果表明HAW算法能有效求解模型,得到较以往算法更高的重建率,且算法运行速度较快,具有很高的实用价值.; 吴璟莉陈建二王建新; 关键词：单核苷酸多态性单体型

高校计算机专业实习群建设思考被引量：1: 2017年; 文章对高等学校计算机专业教育的实习群建设问题进行研究,分析建设的必要性,阐述其建设要素,从完善实习体系、精选实习内容、优化实习模式和强化实习指导等4个方面提出高校计算机专业实习群建设方略。; 吴璟莉; 关键词：高校计算机

基于优化解集合的个体单体型重建方法: 本发明公开了一种基于优化解集合的个体单体型重建方法，包括以下步骤：预处理单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)矩阵，去掉对重建工作没有帮助的冗余信息，得到只含杂合位点的SN...; 王建新吴璟莉; 文献传递

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