邱莹
- 作品数：4 被引量：6H指数：1
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- 猪流感病毒H3N2亚型济南株HA、NA、NP基因的克隆与序列分析
- 2010年
- 根据GenBank中流感病毒H3N2亚型HA、NA、NP基因序列,分别设计扩增HA、NA、NP基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒（SIV）H3N2济南株（SW/SD/JT/07（H3N2））HA、NA、NP基因,分别将RT-PCR产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析。结果显示,SW/SD/JT/07（H3N2）HA基因长度约为1 701 bp,编码566个氨基酸,与参考毒株的同源性为65.2%~81.8%;HA0切割位点序列为PENQTR↓G,属非高致病性毒株;SW/SD/JT/07（H3N2）HA蛋白有7个糖基化位点,由于碱基突变缺少了1个糖基化位点,表明其抗原性及其生物学特性发生变化。SW/SD/JT/07（H3N2）与所有参考毒株HA蛋白上的受体结合位点的氨基酸很保守,即98、134、136、138、226位分别为Tyr、Gly、Ser、Ala、Asn。SW/SD/JT/07（H3N2）NA基因长为1 413 bp,编码470个氨基酸,与参考毒株的同源性为65.1%~91.8%,NA基因系统发生分析表明SW/SD/JT/07（H3N2）与禽流感病毒H3N2亚型亲缘关系最近。SW/SD/JT/07NA（H3N2）NA蛋白与参考毒株的颈区63、64、65位置均无氨基酸缺失现象,可推测其对病毒的复制能力不会有很大影响。SW/SD/JT/07（H3N2）NP基因长为1 565 bp,编码498个氨基酸。与参考毒株的同源性为79.8%~87.8%,NP基因系统发生树分析结果表明,2002年、2004年暴发的西班牙流感同源性较高,亲缘关系较近,而与中国内地广东株同源性小,亲缘关系较远。
- 朱晓林凌宗帅邱莹谢之景赵宏坤姜世金张兴晓
- 关键词：猪流感病毒HA基因NA基因NP基因
- 猪细小病毒NS1基因和VP2基因的克隆与序列分析被引量：5
- 2009年
- 根据GeneBank上发表的猪细小病毒（PPV）的基因组序列,分别设计扩增非结构蛋白NS1基因和结构蛋白VP2基因的特异性引物,采用PCR方法扩增PPV泰安株（PPV-TA）NS1基因和VP2基因。结果表明,PPV-TANS1基因长1989 bp,编码662个氨基酸,与参考PPVNS1基因核苷酸同源性在98.3%～99.9%之间。PPV-TA NS1蛋白有3个糖基化位点分别是356NIS、446NFS、513NLT,除PPV Tomau/1/02在356位缺失了一个糖基化位点之外,PPV-TA与其他PPV参考毒株一致;这表明不同毒株NS1蛋白调节功能可能有差异。PPV-TA NS1蛋白的潜在磷酸化位点是Thr435和Ser473,与PPV参考毒株相同。NS1基因系统发生分析表明,PPV-TA与PPV china亲缘关系最近。PPV-TAVP2基因长1740 bp,编码579个氨基酸,与PPV参考毒株VP2基因核苷酸同源性在98.3%～99.8%之间。PPV-TA VP2蛋白的378D、383H、436S氨基酸残基决定了PPV的组织嗜性,与PPV-NADL-2和PPV-china相同,这表明这3个毒株的组织嗜性是一致的。但与其他PPV参考毒株有差异,这表明不同毒株在动物体内的组织分布是有差别的。PPV-TA VP2蛋白有9个线性抗原位点,与PPV NADL-2和PPV china的线性抗原位点是一致的,这表明具有相同的抗原特性。VP2基因系统发生分析表明,PPV-TA与PPV NADL-2亲缘关系较近。
- 邱莹胡传伟朱晓林谢之景赵宏坤姜世金张兴晓陈甜甜
- 关键词：猪细小病毒NS1基因VP2基因
- 猪流感病毒H9N2亚型济南株HA、NA基因的克隆与序列分析被引量：1
- 2010年
- 根据GenBank中流感病毒H9N2亚型HA基因与NA基因序列,分别设计扩增HA基因与NA基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒H9N2济南株(SW/SD/JT/07)HA基因和NA基因,分别将RT-PCR扩增产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析。结果表明,SW/SD/JT/07 HA基因长度为1701bp,编码566个氨基酸,HA0切割位点序列为R-S-S-R-G,属非高致病性毒株;HA蛋白有8个糖基化位点,与参考毒株糖基化位点数一致;HA蛋白有5个受体结合位点,其中在190位氨基酸与其余参考毒株存在差异。SW/SD/JT/07 NA基因长度为1413bp,编码470个氨基酸,NA蛋白基质结合部与参考毒株一致,高度保守;NA蛋白有5个抗原位点,在325位为D其余参考毒株均为N,SW/SD/JT/07与DC/HB/W1/04,CK/GS/2/99在398位为E,其余参考毒株为D或N;SW/SD/JT/07 NA蛋白与CK/SH/F/98,DC/HB/W1/04,CK/GS/2/99,SW/GD/WXL/04,SW/SD/W4/03,SW/YN/Simao2/07一样在茎区63,64,65位发生氨基酸缺失。SW/SD/JT/07 HA基因与参考毒株的同源性82.5%～98.6%,NA基因与参考毒株的同源性82.2%～99.1%。SW/SD/JT/07 HA基因与NA基因系统发生树分析表明,SW/SD/JT/07与AIV H9N2亚型亲缘关系密切。
- 朱晓林凌宗帅邱莹谢之景赵宏坤姜世金张兴晓
- 关键词：猪流感病毒H9N2亚型HA基因NA基因
- 猪细小病毒的分离鉴定及NS1基因、VP2基因的克隆测序分析
- 猪细小病毒（Porcince parvovirus，PPV）是引起母猪繁殖障碍的主要病原体之一，感染妊娠前期的母猪后主要引起母猪流产、胚胎死亡、胎儿畸形、木乃伊化、弱胎及不孕等危害，给养猪业造成了重大损失。本研究对泰安地...
- 邱莹
- 关键词：PPV克隆测序
