董鹏生
- 作品数：8 被引量：67H指数：4
- 供职机构：上海海洋大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划科技部科技型中小企业技术创新项目上海市科委科研计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 中华绒螯蟹3水系野生和选育群体遗传结构的微卫星分析
- 利用29个微卫星标记,对3个水系(长江、黄河、辽河)中华绒螯蟹的6个野生和选育群体进行遗传多样性及遗传结构分析.共检测到943个等位基因,各位点平均等位基因数为32.5个.遗传多样性分析显示,29个微卫星位点的平均多态信...
- 刘皓刘青吴旭干何杰董鹏生成永旭
- 不同提取方法和不同组织对中华绒螯蟹DNA提取效果的比较研究被引量：4
- 2014年
- 为了优化中华绒螯蟹基因组DNA提取方法,采用酚-氯仿法和试剂盒法分别对中华绒螯蟹的鳃、肌肉、血淋巴液和刚毛4种组织进行DNA提取,并从纯度、浓度、片段完整性及微卫星标记PCR扩增效果4个方面评价提取DNA的质量。结果显示:酚-氯仿法提取的DNA片段比试剂盒法提取的更完整,且DNA浓度较高,但纯度稍低;无论何种提取方法,刚毛和血淋巴液中的DNA纯度都高于鳃和肌肉,4种组织中的DNA含量依次为鳃>肌肉>刚毛>血淋巴液,未剪碎刚毛中未能提取到基因组DNA;微卫星标记的电泳结果表明,两种提取方法下4种组织中提取的DNA均可满足微卫星标记的应用要求。综上,本研究建立了一种简便的非损伤性中华绒螯蟹的采样及其DNA提取方法,这对于进行中华绒螯蟹遗传育种和分子标记研究等方面具有一定的积极作用。
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- 关键词：中华绒螯蟹DNA提取
- 长江水系中华绒螯蟹野生和人工繁殖大眼幼体的遗传多样性分析被引量：8
- 2017年
- 长江水系中华绒螯蟹是我国最重要的河蟹养殖群体,通常认为长江野生大眼幼体在成蟹阶段具有一定的生长优势,但是长江流域河蟹增殖放流和养殖群体逃逸可能对其野生大眼幼体遗传多样性造成一定的影响,尚未见相关报道。因此,本研究利用29对微卫星标记对河蟹长江水系野生和人工繁殖大眼幼体的亲缘关系及遗传多样性进行了分析。两群体大眼幼体均表现出较高的杂合水平,两个种群Ho分别为0.729 9和0.750 0,无显著差异(p>0.05)。两群体总近交系数(Fit)为0.171 2,群体内近交系数(Fis)为0.165 9,群体间分化系数(Fst)为0.006 4;分子方差分析(AMOVA)显示,99.7%的遗传变异来自种群内个体间,0.3%来源于种群间的变异,遗传分化程度较低;各位点的基因流Nm平均值为38.739 9,说明两种群基因交流频繁;群间平均遗传距离仅为0.106 7。瓶颈效应和遗传结构分析显示,两个群体近期经历过瓶颈效应,群体间间遗传混杂,不能分出有效理论种群数。综上所述,长江口河蟹野生大眼幼体的SSR遗传多样性稍高于人工繁殖群体,两者的遗传分化程度较低,这暗示两群体间存在基因交流。
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- 关键词：中华绒螯蟹长江水系微卫星分析
- 长江、黄河和辽河水系中华绒螯蟹野生和养殖群体遗传变异的微卫星分析
- 我国中华绒螯蟹(以下简称河蟹)养殖主要集中在长江、黄河和辽河流域,经过多年的人工养殖、跨流域引种和增殖放流等活动可能会对其遗传特性造成一定的影响,因此本研究利用29个微卫星标记对3个水系的野生和养殖群体进行了遗传特征分析...
- 刘青刘皓吴旭干何杰董鹏生王幼鹏成永旭
- 关键词：中华绒螯蟹地理种群微卫星种群结构
- 中华绒螯蟹两种微卫星DNA分型方法的应用比较被引量：5
- 2015年
- 为对比荧光标记毛细管电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳在微卫星等位基因分型上的效果,试验选择6对微卫星引物,对60个中华绒螯蟹个体基因组DNA进行PCR扩增,荧光标记法共检测出等位基因129个,平均每个位点21.5个等位变异,聚丙烯酰胺凝胶电泳共检测出等位基因174个,平均每个位点29个等位变异。对位点Esin67的PCR产物分别进行重复检测,发现荧光标记法的重复率为100%,而聚丙烯酰胺凝电泳法两次结果存在较大差异,证实了荧光标记法检测的可靠性显著高于聚丙烯酰胺凝胶电泳。对两种方法的检测效率和经济成本的分析表明,荧光标记法虽然成本较高,但效率高于聚丙烯酰胺凝胶电泳法。建立单重PCR的多重毛细管电泳技术是提高效率、降低成本的有效途径。
- 刘皓刘青吴旭干何杰董鹏生成永旭
- 关键词：中华绒螯蟹微卫星PAGE荧光标记
- 基于转录组学技术探究中华绒螯蟹胚胎发育期间的基因和通路表达特征
- 甲壳动物作为无脊椎动物最大的类群之一，具有丰富的生物多样性以及复杂的生活史。而胚胎阶段作为甲壳动物重要的发育时期，其经历了一系列的基因发育调控和表达模式的变化，然而，到目前为止，相关甲壳动物胚胎发育阶段的分子生物学机理研...
- 董鹏生
- 关键词：中华绒螯蟹胚胎发育转录组学信号通路
- 文献传递
- 中华绒螯蟹一龄性早熟和二龄成熟家系扣蟹阶段生长和早熟的比较研究被引量：18
- 2016年
- 河蟹一龄性早熟是扣蟹养殖过程中的一个重要问题,通过构建一龄性早熟和二龄正常性成熟河蟹家系,综合评估了两种家系子一代在扣蟹养殖阶段的生长、早熟率、成活率、产量、早熟蟹和正常扣蟹的平均体质量及其规格分布等参数,结果显示：（1）除215日龄雄体甲壳长外,一龄早熟家系扣蟹在155和215日龄的体质量、甲壳长、甲壳宽、增重率（WGR）和特定生长率（SGR）均显著低于二龄成熟家系（P〈0.05）;（2）整体上两种家系子代的成活率和产量均无显著差异,尽管一龄早熟家系子代雄体的早熟率略高于二龄成熟家系,但是两者的差异不显著,一龄早熟家系子代雌体无一龄早熟现象,二龄成熟家系子代雌体的早熟率是其雄体的两倍;（3）两种家系后代中正常扣蟹各规格比例基本呈正态分布,雌雄体主要集中于3~6 g和6~9 g两个体质量范围,无论雌体还是雄体,二龄成熟家系的大规格扣蟹（体质量〉6 g）比例较高,一龄早熟家系的小规格扣蟹（体质量〈6 g）比例较高。综上,河蟹二龄成熟家系子代在扣蟹阶段的生长性能优于一龄早熟家系子代,两者的一龄性早熟情况也有所不同,需要进一步研究河蟹一龄性早熟的生理机制和性别差异。
- 董鹏生刘青吴旭干何杰常国亮丁怀宇王幼鹏成永旭
- 关键词：中华绒螯蟹性早熟扣蟹养殖性能
- 长江、黄河和辽河水系中华绒螯蟹野生和养殖群体遗传变异的微卫星分析被引量：44
- 2015年
- 我国中华绒螯蟹(以下简称河蟹)养殖主要集中在长江、黄河和辽河流域,经过多年的人工养殖、跨流域引种和增殖放流等活动可能会对其遗传特性造成一定的影响,因此本研究利用29个微卫星标记对3个水系的野生和养殖群体进行了遗传特征分析。结果表明:(1)6个群体均表现出较高的遗传杂合度水平(Ho=0.702—0.744),香农信息指数(I)显示6群体的遗传多样性水平依次为:长江野生>长江养殖>黄河野生>辽河养殖>黄河养殖>辽河野生。(2)分子方差分析(AMOVA)结果显示,来源于种群内个体间和个体内部的变异分别为14.02%和85.88%,群体间的遗传分化处于较低水平(FST<0.05);(3)瓶颈效应和遗传结构分析显示,所有群体近期均经历过有效种群的降低,且6种群内个体的遗传组成混杂。综上所述,三水系野生和养殖群体均具有较高的遗传多样性,长江和黄河野生群体的遗传多样性略高于养殖群体;三水系河蟹野生群体的遗传分化与地理距离具有一定的相关性,长江养殖群体、黄河野生及养殖群体间的遗传分化较小可能与其跨流域引种及养殖群体逃逸造成其种质混杂有关。
- 刘青刘皓吴旭干何杰董鹏生王幼鹏成永旭
- 关键词：中华绒螯蟹地理种群微卫星种群结构
