黄可君
- 作品数：5 被引量：5H指数：2
- 供职机构：华侨大学化工学院更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学理学电气工程更多>>
- 乙醇脱氢酶底物分子对接的优化被引量：2
- 2013年
- 通过分子对接的方法,探寻乙醇脱氢酶催化底物脱氢时酶与底物分子的特定位点间存在作用力及其与底物亲和力之间的相关性.研究结果表明:影响乙醇脱氢酶催化底物与酶相互作用的主要因素并非是分子量或者分子间氢键的键能,而是分子间总的作用力及分子间形成氢键的个数,其相关系数可达0.63;辅酶及金属离子对酶与底物结合的抑制常数及结合位点具有十分显著的影响.
- 黄可君张光亚
- 关键词：乙醇脱氢酶分子对接分子间作用力
- ELPs相变及其与木聚糖酶相互作用的分子动力学模拟
- 近年来，类弹性蛋白多肽（Elastin-like polypeptides，ELPs）的可逆相变特性逐渐开始受到学术界的关注，基于此，可逆相转换循环（Inverse transitioncycling,ITC）的技术已经...
- 黄可君
- 关键词：木聚糖酶分子动力学模拟融合蛋白可逆相变
- 文献传递
- 不同嗜盐机制微生物蛋白质组特性及其识别
- 2014年
- 选取两种不同嗜盐机制微生物蛋白质组,并将其同非嗜盐微生物蛋白质组进行比较.研究结果发现:积累无机盐的蛋白质氨基酸组成与非嗜盐相差明显,而积累细胞相容性物质的嗜盐蛋白则差异较小,后者分子中His和分子量较小的氨基酸均显著多于非嗜盐蛋白,而Ala则相反;两种类型蛋白质中酸性氨基酸和碱性氨基酸的差值均显著高于非嗜盐蛋白.基于此,使用一种新型Person通用核函数的支持向量机对3种类型蛋白进行识别,其精度可达84.1%,优于其他核函数的支持向量机及其他机器学习算法.
- 葛慧华黄可君张光亚
- 关键词：嗜盐微生物蛋白质组氨基酸支持向量机
- 以分子动力组学的方法探究嗜盐酶的嗜盐机理被引量：3
- 2013年
- 通过分子动力组学的方法,从原子尺度上分析4组嗜盐酶及其同源非嗜盐酶的分子动力学特性.结果发现:嗜盐酶所形成的盐桥和氢键明显多于非嗜盐酶,嗜盐酶的溶剂可及性表面要小于非嗜盐酶.通过比较嗜盐与非嗜盐的均方根偏差、回旋半径及末端距等参数,发现嗜盐酶的结构较非嗜盐酶更具刚性.同时,非嗜盐酶多个部位的氨基酸残基柔性比嗜盐酶的要大很多.研究表明:能形成较多的盐桥、氢键,较小的溶剂可及性表面和整体结构的刚性,很可能是嗜盐酶在高盐环境中维持其结构稳定的主要原因.
- 王四华黄可君张光亚
- 关键词：分子动力学模拟
- 木聚糖酶与单壁碳纳米管的吸附分子动力学模拟
- 2013年
- 通过分子动力学模拟的方法,从原子尺度研究木聚糖酶与单壁碳纳米管(SWNTs)相互吸附的动力学过程和酶分子特性.通过观察动力学轨迹和定量分析,发现SWNTs和酶分子逐渐靠近最后稳定的吸附在一起,且酶分子的不同部位与SWNTs吸附动力学过程存在差异.SWNTs表面的原子构象在吸附过程中经历了不同程度的调整,且蛋白质整体构象因受到SWNTs的影响也有所改变.CNT1体系中芳香族氨基酸TRP120和TYR122的芳香环正好与SWNTs表面平行,CNT2体系中蛋白质的C端最终吸附在SWNTs表面,使得酶和SWNTs结合的更加稳定.综合考虑认为CNT2体系为最佳吸附体系.
- 王四华黄可君张光亚
- 关键词：碳纳米管分子动力学木聚糖酶物理吸附
