魏可鹏
- 作品数：7 被引量：32H指数：4
- 供职机构：南京农业大学无锡渔业学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目公益性行业(农业)科研专项国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 建鲤IGFBP1基因的克隆及与增重相关的SNP位点分析被引量：8
- 2012年
- 旨为查找建鲤(Cyprinus carpio var.jian)胰岛素样生长因子结合蛋白1(Insulin-like growth factor binding pro-teins 1,IGFBP1)基因上与增重相关的SNP位点。利用基因克隆,Clustal W比较8个个体的DNA序列,筛选SNP位点。并采用PCR-RFLP方法检测了其中2个位点(1b-E1-A210G,1b-E3-C108T)在913尾建鲤(♂469,♀444)中的基因型分布。成功分离得到了建鲤IGFBP1的2条DNA序列,并在1a、1b上分别找到7个和24个SNPs位点,其中,1a外显子上有2个,1b外显子上有4个。检测的2个位点与增重的相关性分析表明:2位点均与雄鱼增重呈极显著相关(P<0.01),其中,增重快的基因型在鱼种阶段分别为GG型和CC型,在成鱼阶段分别为AG型和CC型。与雌鱼鱼种阶段增重相关的位点为A210G,其AG型增重极显著快于AA型(P<0.01),与雌鱼成鱼阶段增重相关的位点为C108T,其CC型、CT型增重极显著快于TT型(P<0.01)。对组合成的9种双倍型与增重的相关性分析表明:雌雄鱼中双倍型D4、D5、D7个体生长显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)快于双倍型D6、D9个体,D4、D5、D7双倍型个体在整个样品中占60%,还存在改良空间。试验检测的2个位点A210G、C108T可作为建鲤增重相关的分子标记应用于育种实践。
- 魏可鹏俞菊华李红霞李建林唐永凯夏正龙
- 关键词：建鲤SNP增重
- 建鲤IGFBP3基因多态性对生长的影响被引量：6
- 2012年
- 胰岛素样生长因子结合蛋白3(insulin-like growth factor binding protein,IGFBP3)是调节动物生长和代谢的重要基因。本实验查找了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)IGFBP3s基因上的SNP位点。使用PCR-RFLP检测了其中5个位点(IGFBP3a-I3_G-253T、IGFBP3b-I2_G30T、IGFBP3b-I3_A-341G、IGFBP3b-E4_C54T、IGFBP3b-E4_C72G)在931尾(485♂,446♀)建鲤中的基因型分布。基因型与增重的相关性分析结果显示,5个位点均与雌性鱼种阶段增重呈极显著(P<0.01)或显著(P<0.05)相关,增重快个体的基因型分别为TT型、GG型、AG型、CC型和CG型;与雄性鱼种阶段增重显著(P<0.05)相关的只有G30T,其中GG型个体增重显著较TT型快;C72G和A-341G两个位点与雌、雄成鱼增重呈极显著(P<0.01)或显著(P<0.05)相关,C72G的CG型增重显著快于CC型和GG型个体,A-341G的AG型和GG型雄性个体增重显著(P<0.05)较AA型快,但雌鱼中增重最快个体的基因型为AG型;此外,与雌性成鱼增重相关的位点还有G30T,其GG型和GT型增重显著(P<0.05)快于TT型个体,在雄性成鱼中也是GG型鱼长得较快,只是不显著;G-253T的GT型雄性成鱼增重极显著(P<0.01)快于GG和TT型个体,但在雌鱼中没有这种趋势。在雌雄鱼中均增重快的个体是G30T的GG型、A-341G的AG型和C72G的CG型,可以作为今后分子育种的标记。分析表明随富集标记个数的增多,增重也随之增大,这与数量性状特性相符。
- 魏可鹏俞菊华李红霞李建林唐永凯
- 关键词：建鲤胰岛素样生长因子结合蛋白3单核苷酸多态性增重
- 建鲤生长激素促泌素受体2(GHSR2s)基因序列、转录变体和GHSRs表达分析
- 2013年
- 应用RT-PCR及PCR分离到鲤鱼2个jlGHSR2s基因,jlGHSR2a和2b,分别编码366,367个氨基酸,相似性高达98%,和金鱼、斑马鱼GHSR2的相似性高达95%。jlGHSR2s基因的内含子位于起始密码子793 bp后,2a和2b内含子的长度和序列均存在明显差异。试验首次发现了jlGHSR2a的转录变体(Variant)jlGHSR2a',由选择性剪切靠近内含子的57 bp外显子1和保留靠近外显子2的28 bp内含子构成,编码350个氨基酸,缺失最后2个跨膜区,剪切序列两端碱基为CT-AC。荧光定量RT-PCR结果表明,jlGHSRs在脑和精巢表达量最高,1s在检测的组织均有表达,但2s在其他组织表达量很少。jlGHSRs的转录变体1s'和2a'的表达量与1s和2s有一定的正相关性,但1s/1s'在各组织不一致,比值最高出现在肝脏,其次是肌肉、肠和脑,精巢和卵巢最低。生长对脑中jlGHS-R1s的表达量没有显著影响,但生长慢的个体肝和肠中jlGHSR1s的表达量比生长快的高,1s/1s'也有明显升高;肌肉中则相反,1s/1s'在雄鱼肌肉中减小明显。饥饿使雌鱼脑、雌鱼前肠和雌雄鱼后肠jlGHSR1s的表达量显著降低,对其余组织中的表达则不显著。生长快慢或饥饿对脑中jlGHSR2s的表达量均没有显著影响。结果表明,jlGHSR1s的表达量与生长有明显的相关性。
- 李红霞李建林唐永凯俞菊华阮瑞霞魏可鹏夏正龙董在杰
- 关键词：建鲤
- 建鲤IGFBP1、IGFBP3基因多态性对增重的影响
- 动物的生长主要由生长激素(growth hormone, GH)-胰岛素样生长因子(insulin-like growth factor, IGF)生长内分泌轴调控。胰岛素样生长因子结合蛋白(insulin-like g...
- 魏可鹏
- 关键词：建鲤胰岛素样生长因子结合蛋白单核苷酸多态性增重
- 文献传递
- Na~＋-K~＋-ATPase α1基因全长cDNA的克隆及序列分析和表达被引量：4
- 2012年
- 为了解Na+-K+-ATPase α1基因的分子结构及其在建鲤盐度调控过程中起到的作用,采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)的方法分离克隆了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)Na+-K+-ATPase α1基因全长cDNA,得到3 397 bp的全长cDNA,包括3 081 bp的开放阅读框(ORF),232 bp的5-末端非编码区(UTR)以及219 bp的3-末端非编码区(UTR)。对推测的该基因氨基酸序列进行同源性比对和系统分析显示:建鲤与其他鱼类该基因的氨基酸序列相似度为90.22%~95.52%,与斑马鱼(Danio rerio)相似度最高(95.52%),与虱目鱼(Chanos chanos)相似度偏低,其次是平鲷(Rhabdosargus sarba)、萨罗罗非鱼(Sarotherodon melanotheron)、底鳉(Fundulus heteroclitus)、黑鲷(Acanthopagrus schlegelii)、马苏大马哈鱼(Oncorhynchus masou)和虹鳟(Oncorhynchus mykiss),与大西洋鲑(Salmo salar)的相似度最低(90.22%),与非洲爪蟾(Xenopus laevis)和人(Homo sapiens)的相似度分别为89.62%和89.51%。以上结果表明,不同物种间的Na+-K+-ATPaseα1基因的氨基酸序列极为保守。用实时定量PCR(RT-PCR)检测该基因在建鲤鳃、肾、肠、肝、脑和脾的相对表达量,其中脑最高,其次是鳃、脾、肾、肠,肝最低,这表明脑、鳃和脾是建鲤Na+-K+-ATPase α1基因主要的表达器官。本研究旨为进一步探索建鲤的盐度调控机制奠定分子基础。
- 刘珊李冰张成锋魏可鹏朱健
- 关键词：建鲤克隆
- 吉富罗非鱼两种生长激素受体基因的分离及与增重相关的SNPs位点被引量：13
- 2011年
- 实验分离了吉富罗非鱼(Oreochromis niloticus)两种生长激素受体基因GHR1和GHR2的全长cDNA以及GHR1阅读框中外显子2～9、GHR2阅读框外显子2～8的DNA序列。在GHR1和GHR2分别找到6个和16个SNPs位点,其中只有2个位点在外显子部分。使用PCR-RFLP方法检测了5个家系共120尾吉富罗非鱼在8个SNPs(GHR1内含子3_A612G、内含子3_A989T、内含子7_A599C;GHR2内含子3_C330T、内含子3_A645G、内含子3_G687T、内含子3_A967G、内含子7_C107T)的基因型。不同基因型与雌、雄吉富罗非鱼增重的相关性分析显示,GHR1内含子3_A612G及内含子3_A989T与雄鱼增重极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,杂合型个体增重最大,在雌鱼群体中有类似趋势,但差异不显著;内含子7_A599C与雄鱼、雌鱼增重分别呈现极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,CC型雌雄鱼增重均大于AA型;GHR2上只有内含子3_G687T与雌鱼增重显著相关(P<0.05),GT型个体增重显著大于GG型。检测了60个家系共356尾吉富罗非鱼在3_A612G、3_A989T、7_A599C和3_G687T的基因型与增重性状的相关性,结果具有相同趋势,因样本少、遗传背景多样,导致差异性显著降低。实时定量PCR结果显示,GHR1在雄鱼肝的表达量是雌鱼的1.36倍;除肾外,GHR2在雄鱼各组织的表达量均低于雌鱼,这部分解释了GHR1和GHR2基因上SNP位点对雌、雄吉富罗非鱼增重的不同影响。此外,GHR1、GHR2对生长影响程度的不同,导致只在GHR2上找到1个SNP位点对增重有影响。
- 阮瑞霞俞菊华李红霞李建林唐永凯魏可鹏
- 关键词：吉富罗非鱼生长激素受体单核苷酸多态性增重
- 建鲤IGF-Ⅰa基因的SNPs位点筛选及其与增重的相关性分析被引量：9
- 2012年
- 机体生长主要受到促生长激素释放激素—生长激素—胰岛素样生长因子(GHRH-GH-IGFs)生长轴调控,类胰岛素生长因子IGF-Ⅰ是生长激素(GH)发挥生物学功能的重要传导因子。实验特异性扩增了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)IGF-Ⅰa基因的5个外显子和3个内含子(内含子1、内含子3和内含子4)。通过比对10尾建鲤的序列,共找到SNPs位点8个。使用PCR-RFLP方法检测了5个家系共372尾建鲤的内含子1_C175G,12个家系共987尾的内含子1_A993G和内含子4_A511C 3个位点。内含子1_C175G雌雄个体均以GG型频率为最高,分别是0.44和0.43;此位点在幼鱼和成鱼时期与雌、雄建鲤增重均无相关性;内含子1_A993G雌雄个体均以AG型频率最高,分别是0.76和0.72;此位点在成鱼阶段与雄性建鲤增重呈显著相关(P<0.05);内含子4_A511C在雌雄个体中均以CC型频率最高,分别是0.48和0.47;其在幼鱼和成鱼阶段均与增重存在极显著的相关性(P<0.01)。本次试验表明在建鲤体内,IGF-I基因在不同生长阶段的表达量不同,且处于同一生长阶段的雌雄个体间的表达也存在差异。内含子1_A993G、内含子4_A511C均与建鲤增重存在相关性,可以考虑作为建鲤分子育种的相关依据。研究亮点:胰岛素样生长因子是一类与生长密切相关的促生长因子。近年来,在鸡、羊、牛等畜禽类动物生长相关分子标记筛选方面已有较多研究并取得一些阳性结果。IGFs多态性及经济性状相关性在鱼类方面报道不多,在鲤方面还没有开展,本文首次自建鲤基因组DNA中分离了IGF-Ⅰa基因,查找了潜在的SNPs位点,并使用可靠的PCR-RFLP方法检测了群体基因型分布,通过与增重的相关分析,筛选到了两个与增重显著相关的SNP位点,为建鲤的分子育种奠定了基础。
- 李红霞刘楠楠浦天宁魏可鹏俞菊华李建林唐永凯
- 关键词：建鲤SNPS增重
