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三种油气指示菌定量PCR方法的建立及其在油气田土壤中的初步应用被引量：6: 2013年; 利用建立的pmoA、bmoX和alkB基因的定量PCR方法分别研究了油田和气田土壤中甲烷氧化菌、丁烷氧化茵和中链烷烃氧化茵的数量丰度，并以背景区土壤作为对照。pmoA和alkB的基因数量均随着采样深度的增加而降低了1—2个数量级。手工法提取油气田土壤DNA进行油气指示茵基因定量的结果显示，油田区和气田区土壤中pmoA和alkB基因丰度略高于背景区样品。气田区样品的bmoX基因丰度为2．75×10^5拷贝数／g，高于背景区和油田区土壤样品0．5-1个数量级。试剂盒提取的土壤DNA的基因定量结果表明，油田区样品pmoA和口凇基因丰度分别为3．09×10^4和2．56×10^6拷贝数／g，高于气田区和背景区土壤样品，且气田区样品bmoX基因丰度分别高于背景区和油田区样品1个数量级和0．5个数量级。结果表明3种油气指示菌的定量PCR技术的建立可为油气微生物勘探提供新的检测手段。; 邵明瑞许科伟汤玉平赵克斌符波刘和; 关键词：实时荧光定量PCR 甲烷氧化菌

油气田土壤DNA提取方法及油气指示菌基因定量结果的比较被引量：3: 2014年; 采用4种提取方法对油田上方6个土壤样品微生物总基因组DNA进行提取,并比较了其纯度和浓度。利用定量PCR技术定量分析各土壤中甲烷单加氧酶基因(pmoA)和丁烷单加氧酶基因(6moX)。与DNA试剂盒法相比,玻璃珠击打法、液氮研磨法、反复冻融法得到DNA纯度较低,需纯化才能进行后续的PCR扩增。液氮研磨法得到的DNA完整性、纯度和得率较其他提取方法均较好,尤其对于生物量较少的深层油田土壤DNA提取较为实用,成本较低。甲烷单加氧酶基因(pmoA)和丁烷单加氧酶基因(6moX)的定量PCR结果表明,液氮研磨法提取DNA样品的定量结果在气区和油区均出现一定的高值。液氮研磨法较其他方法更适合于油田土壤DNA的提取。下一步研究可以把丁烷氧化茵作为油气指示茵研究中的重点检测对象。; 邵明瑞杨旭刘和符波姜谦; 关键词：DNA提取土壤微生物

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邵明瑞