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陈作舟: 作品数：13 被引量：47H指数：5; 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金浙江大学校科研和教改项目浙江省自然科学基金更多>>; 相关领域：生物学农业科学机械工程一般工业技术更多>>

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寒冷驯化的斑马鱼细胞通过DNA甲基化调控寒冷诱导基因: DNA甲基化是一种重要的表观遗传调控机制,在细胞分化、增殖和死亡等生物学过程中起着重要作用。然而,DNA甲基化在鱼类寒冷驯化过程中发挥功能的机制尚不清楚。在本研究中,将培养于28℃(常规培养温度)的斑马鱼(Danio r...; 韩兵社李文豪陈作舟时应娣许琼琼罗军涛李小霞张俊芳陈良标; 关键词：斑马鱼; 文献传递

高冷凝温度下两级喷射式制冷系统研究: 日益增长的能源消耗如今已成为严峻的社会发展瓶颈。如果可以推广利用余热驱动的制冷系统，可以有效减少化石燃料的消耗以及温室气体的排放。喷射式制冷系统可以有效利用余热或太阳能，是理想的环保型制冷系统之一。不仅如此，喷射式制冷系...; 陈作舟; 关键词：废热利用引射系数; 文献传递

GoPipe:批量序列的Gene Ontology注释和统计分析(英文)被引量：16: 2005年; 随着后基因组时代的到来,批量的测序,特别是EST的测序,逐渐成为普通实验室的日常工作. 这些新的序列往往需要进行批量的Gene Ontology (GO)的注释及随后的统计分析. 但是目前除了Goblet以外,并没有软件适合对未知序列进行批量的GO注释,而GoBlet因为具有上载量的限制,以及仅仅利用BLAST作为预测工具,所以仍有许多不足之处. 开发了一个软件包GoPipe,通过整合BLAST和InterProScan的结果来进行序列注释,并提供了进一步作统计比较的工具. 主程序接收任意个BLAST和InterProScan的结果文件,并依次进行文本分析、数据整合、去除冗余、统计分析和显示等工作. 还提供了统计的工具来比较不同输入对GO的分布来挖掘生物学意义. 另外,在交集工作模式下,程序取InterProScan和BLAST结果的交集,在测试数据集中,其精确度达到99.1%,这大大超过了InterProScan本身对GO预测的精确度,而敏感度只是稍微下降. 较高的精确度、较快的速度和较大的灵活性使它成为对未知序列进行批量Gene Ontology注释的理想的工具. 上述软件包可以在网站(http://gopipe.fishgenome.org/ ) 免费获得或者与作者联系获取.; 陈作舟薛成海朱晟周丰丰XUEFENG BRUCE LING刘国平陈良标; 关键词：功能基因组学 EST BLAST

筛选机制与细胞衰老的DNA损伤假说被引量：10: 2001年; 生物界存在某些筛选机制 ,它将DNA损伤较小的细胞筛选出来 ,产生后代。主要有两类模式———机制 1和机制 2 ,分别以细菌和人的成纤维细胞为代表 ,那些具有筛选机制 1的细胞 (如 :细菌、生殖、癌细胞 )能无限传代 ,而体细胞则不能。这两类筛选机制背后有更深刻的原因 ,而细胞的癌变正是从机制 2退化为机制 1的过程。; 陈作舟; 关键词：细胞衰老 DNA损伤细胞凋亡

一种无泵喷射式制冷系统: 本实用新型公开了一种无泵喷射式制冷系统，包括发生器、一级喷射器、二级喷射器、冷凝器、蒸发器、第一储液罐、第二储液罐、第一切换阀、第二切换阀、第三切换阀和节流元件；一级喷射器依次与二级喷射器、冷凝器、节流元件、蒸发器串联组...; 罗江玉陈作舟唐黎明; 文献传递

寒冷驯化的斑马鱼细胞通过DNA甲基化调控寒冷诱导基因: DNA 甲基化是重要的表观调控机制之一,在细胞分化、增殖和死亡等生物学过程中起着重要作用。然而,DNA 甲基化在鱼类寒冷驯化过程中发挥功能的机制尚不清楚。在本研究中,将培养于28℃(正常温度)的斑马鱼(Danio rer...; 张俊芳李文豪陈作舟韩兵社时应娣许琼琼罗军涛李小霞陈良标; 关键词：斑马鱼

应用KEGG进行跨物种转录组比较的生物信息方法: 2016年; 本文简单的介绍了一个应用KEGG进行跨物种转录组比较的生物信息方法; 陈作舟; 关键词：生物信息转录组基因组基因表达

基于微阵列数据的基因网络预测方法研究进展被引量：6: 2005年; DNA微阵列技术可同时定量测定成千上万个基因在生物样本中的表达水平,从这一技术获得的全基因组范围表达数据为揭示基因间复杂调控关系提供了可能。研究人员试图通过数学和计算方法来构建遗传互作的模型,这些基因调控网络模型有聚类法、布尔网络、贝叶斯网络、微分方程等。文章对网络重建计算方法的研究现状进行了较为全面的综述,比较了不同模型的优缺点,并对该领域进一步的研究趋势进行了展望。; 王明怡夏顺仁陈作舟; 关键词：基因网络微阵列聚类微分方程贝叶斯网络

一个Chip-seq的生物信息分析流程: 2016年; 本文简单的介绍了一个Chip-seq的生物信息分析流程的设计和实现。; 陈作舟张俊芳; 关键词：生物信息 CHIP-SEQ 基因组

EST转录组功能差异的数据挖掘系统及应用: 大规模的cDNA测序得到了数量庞大的EST序列，这些EST序列代表了不同物种不同组织在不同环境和生理状态下的基因表达情况，为比较转录组学的研究提供了宝贵的资源。为了将转录组比较所得的差异表达的基因转化为对生物学意义的更深...; 陈作舟; 关键词：转录组 EST 数据挖掘; 文献传递