熊圣文
- 作品数:2 被引量:12H指数:2
- 供职机构:中央民族大学生命与环境科学学院更多>>
- 发文基金:中央民族大学青年教师科研基金国家自然科学基金国家大学生创新性实验计划更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 内蒙古地区蒙药冷蒿的植物资源调查被引量:5
- 2010年
- 对内蒙古呼伦贝尔、锡林郭勒草原5种生境(森林草原、草甸草原、典型草原、荒漠草原和沙地)中蒙药冷蒿资源进行实地调查,主要包括生物学特性、生境、资源面积及其利用等,为冷蒿的进一步研究提供必要的理论基础。
- 刘越王真张宝辉杨桂霞陈宝瑞辛晓平熊圣文郭永晨冯金朝黄璐琦
- 关键词:冷蒿
- 裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析被引量:7
- 2011年
- 目的为了在裂叶牵牛中开发功能性EST-SSR分子标记,分析裂叶牵牛EST-SSRs特征。方法从NCBI公共数据库中下载裂叶牵牛EST序列,运用DNAstar软件中的Seqman Pro程序,对下载序列进行拼接和聚类,去除冗余序列,利用SSRIT软件筛选重复序列长度≥20 bp的二、三、四、五、六、七、八核苷酸7种类型的SSR,统计分析裂叶牵牛EST-SSRs的特征。结果从NCBI公共数据库中下载62 388条裂叶牵牛EST序列,剔除冗余序列,得到全长为8.35×106 bp的无冗余EST序列11 569条。在这些序列中搜索出985条EST序列含有1 132个SSRs,占无冗余EST序列的9.78%,平均每7.37 kb EST出现1个SSR位点。二核苷酸重复基元SSR出现频率最高(51.06%),其次是三核苷酸(33.57%),AG/TC、GA/CT和AAG/TTC是二、三核苷酸中的优势重复基元。裂叶牵牛EST-SSRs以4~10次重复为主,基序长度主要集中于20~30 bp。结论裂叶牵牛EST-SSR的出现频率高,重复类型丰富,理论上表明这些EST-SSRs具有较高的可用性。本实验通过对裂叶牵牛EST资源的SSR信息的研究,为分子水平和生物信息学角度上开发裂叶牵牛的SSR功能性标记提供了候选序列。
- 刘越范增华孙洪波冯金朝张水仙熊圣文刘生全黄璐琦