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张玉滨
作品数:
1
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供职机构:
上海大学理学院
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发文基金:
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
理学
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合作作者
赵洁苑
上海大学理学院
龚云路
上海大学理学院
王翼飞
上海大学理学院
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2010
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MiRfilter:一个预测病毒microRNA的计算工具
2010年
采用生物信息学方法开发了一个预测病毒miRNA的计算机程序MiRfilter,通过提取已知的病毒miRNA的生物学特征,规定参数及参数范围,并以此为筛选标准,预测潜在的病毒miRNA.用EBV和RLCV两种病毒的正负样本对MiRfilter的预测精度进行检测.MiRfilter从39个EBV已知的miRNA中正确识别了30个,从116个负数据中检测到9个假阳性数据;从20个RLCV的miRNA中正确识别了15个,从108个负数据中检测到2个假阳性数据.用取自果蝇和线虫预测区域的186个负数据检测MiRfilter的特异性,在186个负数据中没有预测出假阳性序列.
张玉滨
赵洁苑
龚云路
王翼飞
关键词:
生物基因组
发夹结构
生物学特征
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