公共文化服务平台

许建: 作品数：33 被引量：13H指数：2; 供职机构：中国水产科学研究院更多>>; 发文基金：中国水产科学研究院基本科研业务费专项基金国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生理学更多>>

合作作者

鱼类低氧适应基因型及检测方法和用途: 本发明公开了决定鱼类低氧适应表型的核苷酸序列，碱基序列如SEQ ID NO：1所示。本发明还公开了鱼类低氧适应基因型的检测方法，包括：提取待测鱼类的基因组DNA；以基因组DNA为模板，利用如SEQ ID NO:3和4的引...; 赵紫霞许建江炎亮张研肖丽婵

一组鲟鱼SNP分子标记、鲟鱼制种评估方法及遗传评估方法: 本发明提供了一组鲟鱼SNP分子标记。本发明还提供了一种鲟鱼候选亲本遗传评估的方法。本发明还提供了一种鲟鱼候选亲本中制种亲本的评估方法，以便在鲟鱼群体遗传多样性丰富的前提下，选择优良的制种亲本；或者，在鲟鱼群体遗传多样性较...; 赵紫霞江炎亮许建张研; 文献传递

一种免疫诱导型鲤启动子的克隆与功能分析: 2017年; 为发掘适用于基因工程抗病育种的鱼类启动子,通过实时荧光定量PCR实验对鲤Rab GTP酶(Ras-associated binding-GTPases 1a3,Rab1a3)基因的表达模式进行了分析,证实该基因在鳃、头肾等与机体免疫防御功能密切相关的组织内转录水平较高,且免疫激活后转录显著增强,符合基因工程抗病育种所需的外源免疫基因转录模式。从鲤细菌人工染色体文库中,使用Rab1a3基因特异引物筛选获得包含该基因区域的文库克隆,测序获得该基因完整序列,以及上下游调控序列。通过生物信息学手段,预测到长度为1014 bp的鲤Rab1a3基因启动子序列,该启动子不具有典型的TATA盒或CpG岛特征,存在多个免疫相关转录因子结合位点。在草鱼肾组织细胞系内验证该启动子活性,结果显示,绿色荧光蛋白基因和萤火虫荧光素酶基因都能够在该启动子驱动下表达,证实该片段具有启动子活性,且启动子活性在受到免疫诱导后增强,双荧光素酶报告基因检测结果显示,该启动子活性在免疫刺激后增强至免疫刺激前的8.67倍。研究表明,鲤Rab1a3基因启动子有望被开发成为免疫诱导型的基因工程元件,驱动外源免疫基因在鱼体内适时表达,抵御外界病原感染,同时避免非必要条件下的过度表达形成生长负担。; 赵紫霞张研曹顶臣孙昭宁许建徐鹏; 关键词：启动子免疫诱导

一种快速鉴定镜鲤的方法: 本发明提供了一种快速鉴定镜鲤的方法，该方法包括以下步骤：1)提取组织DNA；2)PCR扩增；3)电泳检测。该方法运用了较少的试剂以及方便快捷容易操作的实验过程，可以在较短时间内、不处死鱼种的基础上，只需剪去少量鳍条或肌肉...; 许建崔军徐鹏; 文献传递

黄河鲤生长性状的转录组解析: 2022年; 通过对同一实验条件下黄河鲤(Cyprinus carpio)群体中体重极大和极小的样本进行转录组测序,挖掘生长相关的基因和信号通路。基于转录组数据进行差异表达基因分析,在脑、肝和肌肉组织中分别筛选出差异表达基因6519个、499个和19个。其中,脑组织中上调基因3443个,下调基因2942个;肝组织中上调基因275个,下调基因186个;肌肉组织中上调基因6个,下调基因5个。对差异表达基因进行了功能注释和通路富集分析,定位到MAPK信号通路、胰岛素(insulin)信号转导通路、Wnt信号通路、ErbB信号通路、肌动蛋白细胞骨架调节等与细胞生长、分化、代谢相关的信号通路。为了验证转录组结果的可靠性,本研究通过荧光定量PCR验证了黄河鲤脑组织中与生长密切相关的13个差异表达基因,其中mapk1、mapk7、mapk10、mapk12、wnt16、wnt8b、wnt10b显著上调(P<0.05),fgf13、ednra、notch2、tgfbr2、fgf19、lpl显著下调(P<0.05)。本研究通过组学数据分析和实验验证筛选了生长相关的基因,为深入挖掘黄河鲤生长性状调控机制和分子标记辅助育种提供了研究依据。; 李佩珍许建朱优秀冯建新江炎亮张瀚元; 关键词：生长性状差异表达基因信号通路

虹鳟免疫诱导型基因Cathelicidin2启动子功能分析: 2018年; 本研究通过实时荧光定量PCR实验对虹鳟(Oncorhynchus mykiss)Cathelicidin2(Cath2)基因的转录模式进行了分析。结果显示,该基因在鳃、头肾等与机体免疫防御功能密切相关的组织内转录,在细菌和病毒感染后,转录水平均显著升高。对基因上游调控序列进行启动子和转录因子结合位点预测,发现该启动子具有真核生物典型的TATA盒和CAAT盒结构,基因上游直至第一内含子区域内,密集存在多个免疫相关转录因子结合位点,其中,2个核因子κB(Nuclear factor kappa B,NFκB)预测结合位点均位于核心启动子正链区域。在草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肾组织细胞系内,绿色荧光蛋白和萤火虫荧光素酶基因都能够在该启动子驱动下表达,表明其具有启动子活性,且启动子活性在受到免疫诱导后增强,包括细菌脂多糖(Lipopolysaccharides,LPS)模拟的细菌感染和聚肌胞苷酸(Polyinosinic polycytidylic acid,Poly I:C)模拟的病毒感染。双荧光素酶报告基因检测显示,启动子活性在与NFκB转录因子表达时,增强至4.39倍,证明Cath2基因受NFκB通路调控。研究表明,虹鳟Cath2基因能够在多种免疫刺激诱导下表达,其启动子可以应用为免疫诱导型的基因工程元件,驱动外源免疫基因在鱼体内适时表达,抵御外界病原感染,同时,避免非必要条件下的过度表达形成生长负担。; 赵紫霞许建江炎亮白庆利蒋立坤陈葆华徐鹏; 关键词：虹鳟抗菌肽启动子转录调控

鲤trim25多拷贝基因进化和表达调控初探: 2022年; 天然免疫系统是硬骨鱼类抵抗病毒感染的主要防御系统,三重基序(tripartite motif,TRIM)蛋白家族作为天然免疫系统的重要组成部分,参与病毒感染的免疫网络调控,其中,TRIM25已被证实在多种鱼类的免疫反应中发挥重要作用。本研究对鲤(Cyprinus carpio)trim25基因的16个拷贝进行了序列进化分析、共线性分析和功能域结构分析,并比较了各拷贝在组织中的表达和顺式调控位点的差异。序列比对和系统进化分析结果均显示,位于鲤11和12号染色上、结构完整的TRIM25的2个拷贝与金线鲃(Sinocyclocheilus grahami)和斑马鱼(Danio rerio)的TRIM25蛋白结构高度相似,与鲤科鱼类以外的其他物种的结构差异较大。基因共线性结果显示,trim25基因上下游基因在不同物种的进化过程中相对保守。鲤TRIM25蛋白的结构分析显示,在鲤TRIM25的16个拷贝中,有6个拷贝具有完整功能结构域,其中,各有5个拷贝在鲤的肝与脑组织中高表达。在构建的表达数量性状基因座(eQTL)调控网络中,在肝和脑组织中分别筛选到5个和17个顺式调控trim25基因表达的单核苷酸多态性(SNP)位点。本研究对鲤trim25基因多个拷贝的序列差异进行了比较,并对鲤与其他物种TRIM25的序列、进化关系和共线性相似度进行了比较,揭示了鲤trim25各拷贝间的结构多样性和在组织中的表达情况,筛选出了可能调控trim25基因表达的SNP位点,为今后研究鲤TRIM25相关的调控和抗病研究提供了理论依据。; 朱优秀江炎亮张芹冯建新张瀚元吴碧银许建; 关键词：蛋白结构系统进化树 EQTL

鲑鳟通用型低通量单核苷酸多态性芯片的开发被引量：2: 2019年; 为开发常见鲑鳟养殖物种通用的遗传分析工具,本研究利用Affymetrix虹鳟(Oncorhynchus mykiss) 57K高通量单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,对国内代表性鲑鳟养殖群体开展了分型检测,包括山女鳟(Oncorhynchus masou masou)、银鲑(Oncorhynchus kisutch)、美洲红点鲑(Salvelinus fontinalis)、白斑红点鲑(Salvelinus leucomaenis) 4个物种,从57,501个SNP标记中筛选出96个共享多态性标记,应用Fluigidm 96.96动态芯片平台,构建了大麻哈鱼属(Oncorhynchus)和红点鲑属(Salvelinus)通用型低通量SNP芯片。该芯片分型结果准确性较高,与Affymetrix高通量芯片分型一致性达到96.55%。使用该芯片对来自6个家系的48尾银鲑个体及其候选亲本进行检测,应用Cervus 3.0.7软件进行亲权鉴定,结果能够准确重现复杂家系的真实系谱。在用于单亲本亲权鉴定时,第一亲本非排除率(Non-exclusion probability for first parent, NE-1P)为4.120×10^(–4);用于双亲本亲权鉴定时,双亲非排除率(Non-exclusion probability for parent pair, NE-PP)低至6.219×10^(–12),表明该芯片在鲑鳟养殖群体系谱鉴定应用中具有较高的准确性。使用该芯片开展4个鲑鳟养殖群体遗传结构分析,样本分群聚类结果与其所属的分类阶元相符,能够准确反映群体遗传组分构成和遗传关系。本研究构建的低通量SNP芯片在常见鲑鳟养殖物种中具有良好的通用性,将其应用于养殖群体遗传分析,能够为鲑鳟制种、育种和引种等科学决策提供基因组信息参考。; 邰如玉许建江炎亮张瀚元白庆利杨世勇徐鹏赵紫霞; 关键词：鲑科鱼类亲权鉴定

用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合: 本发明公开了一种用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合，包括：双斑东方鲀鉴定的SNP分子标记组合；菊黄东方鲀鉴定的SNP分子标记组合；星点东方鲀鉴定的SNP分子标记组合；红鳍东方鲀鉴定的SNP分子标记组合；暗纹东方鲀鉴定...; 张瀚元许建; 文献传递

用于欧鳇苗种鉴定的生物传感检测方法: 本发明公开了一种用于欧鳇苗种鉴定的生物传感检测方法，以待测苗种的DNA为模板进行探针延伸获得探针延伸产物，应用生物传感检测方法检测所述探针延伸产物是否能够通过锚定标记分子锚定至修饰有锚定受体的电极表面并产生电化学信号，若...; 赵紫霞江炎亮许建张研; 文献传递

许建

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

许建

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈