程芳婷
- 作品数：2 被引量：23H指数：2
- 供职机构：西北大学生命科学学院西部资源生物与生物技术教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金陕西省自然科学基金陕西省教育厅科研计划项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 地黄属核基因与叶绿体基因DNA条形码比较研究被引量：7
- 2017年
- 目的比较单拷贝核基因、叶绿体基因及ITS等DNA条形码在地黄属的物种分辨率,探讨地黄属种间亲缘关系。方法利用距离法与建树法分析了地黄属植物13个居群的12个单拷贝核基因、6个叶绿体基因以及ITS片段物种鉴定成功率,构建了地黄属系统发育树。结果叶绿体matk和rbc L、单拷贝核基因物种分辨率普遍较低,多基因联合分析有助于物种鉴定成功率的提高。在NJ树中,地黄-茄叶地黄聚为一支,其他物种都是单系群,裂叶地黄位于系统发育树基部。结论 ITS是地黄属物种鉴定的核心条形码,psb A-trnH、trnL-F、trnM-V、trnS-G可以作为备选方案,核基因RR255与R257可用作地黄专用鉴定条形码。四倍体地黄起源方式有待进一步澄清。
- 李建芳黄静程芳婷杜优刘占林
- 关键词：地黄属DNA条形码核基因叶绿体基因亲缘关系
- 地黄属植物的DNA条形码研究被引量：17
- 2015年
- 地黄属（Rehmannia）为玄参科（Scrophulariaceae）药用植物,广泛分布于中国中东部及北部地区。由于地黄属植物经历了快速成种,导致其属内物种间形态性状差异较小,运用传统的形态学分类方法已难以准确地鉴定物种,近年来迅速发展起来的DNA条形码技术为快速、准确地鉴别物种提供了新思路。本研究选用3个叶绿体DNA非编码区片段（trn L-trn F、trn M-trn V和trn S-trn G）及核基因ITS片段,运用PWG-distance和TreeBuilding两种方法对地黄属5个物种75个个体进行了DNA条形码分析。结果表明：单个叶绿体DNA片段或核基因ITS片段对地黄属物种的鉴别率较低（0%~20%）,组合的叶绿体DNA片段分辨能力虽然高于单个DNA片段,但并不能将地黄属5个物种完全区分开;trn S-trn G＋ITS片段组合的分辨率可达100%,能够将地黄属5个物种准确区分,与所有叶绿体DNA片段和核基因ITS片段组合（trn L-trn F＋trn M-trn V＋trn S-trn G＋ITS）的辨别率相同,因此推荐trn S-trn G＋ITS作为地黄属植物的标准条形码。此外,利用DNA条形码鉴别物种时,可采用叶绿体DNA片段和核DNA片段组合的方法来提高物种鉴定的成功率。
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- 关键词：DNA条形码地黄属叶绿体DNA分辨率
