陈洁
- 作品数：5 被引量：12H指数：2
- 供职机构：三亚市疾病预防控制中心更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 海南省琼南地区2012—2021年手足口病病原学特征分析被引量：5
- 2022年
- 目的 分析海南省琼南地区2012—2021年手足口病的病原学特征,为琼南地区手足口病防控措施的制定提供依据。方法 收集手足口病患者咽拭子或肛拭子标本共3 359份,采用荧光定量PCR进行肠道病毒核酸检测分型,使用统计软件SPSS进行统计分析。结果 3 359份标本中共检出肠道病毒(HEV)阳性标本1 588份,总阳性率为47.28%,EV71、CoxA16和其他肠道病毒构成比分别为15.37%、23.11%和61.52%,以其他肠道病毒感染为主;2012—2021年的HEV阳性率总体呈V型变化趋势,总阳性率最高为2021年,为66.77%,最低为2016年,为29.32%,不同年份各类病原构成比差异有统计学意义(χ^(2)=394.705,P<0.001);10年间,海南省琼南地区的EV71类型手足口病感染率呈逐年下降趋势,有3个监测年度以CoxA16为优势流行毒株,有7个监测年度以其他肠道病原流行为主,为61.52%;2020—2021年期间以CoxA6型(51.55%)和CoxA16型(30.70%)为主。阳性病例数主要集中在3—12月份,7月份左右为最高峰。男女性别阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=0.364,P>0.05),0~3岁年龄组阳性标本数最多,占总阳性数的84.13%。琼南地区五指山市阳性率最高,为62.61%,三亚市阳性率最低,为37.75%。肛拭子标本的阳性率高于咽拭子标本,两者差异有统计学意义(χ^(2)=78.081,P<0.001)。结论 其他肠道病原在海南省琼南地区流行逐渐增强,提示应关注、加强对开展其他肠道病毒病原学的检测和分型,有助于本地区手足口病的预防和控制。
- 黄春梅吴南卫尹江源邓瑶莫丽娟李冬梅陈洁
- 关键词：手足口病肠道病毒病原检测
- 2020-2021年琼南地区手足口病的病原谱变化被引量：1
- 2022年
- 目的分析海南南部(琼南)地区手足口病的病原谱构成及其各型别的流行趋势,为制定防治措施提供科学依据。方法收集2020—2021年手足口病患者肛拭子或咽拭子标本,用实时荧光RT-PCR法检测样本中肠道病毒核酸,用SPSS 17.0软件进行统计分析。结果2020—2021年琼南地区共采集标本532份,肠道病毒阳性355份,总阳性率为66.73%。病原构成比前3位的分别是CV-A6(51.55%)、CV-A16(30.70%)和CV-A10(8.45%),未检测到EVA71。0~<4岁年龄组病例占65.91%。2020年的优势病原是CV-A6,2021年优势病原是CV-A6和CV-A16。除陵水县以CV-A16为优势病原外,其他市县均以CV-A6为主。结论2020—2021年琼南地区手足口病的优势病原是CVA6和CV-A16,应根据本地区的气候特点和优势病原采取相应的预防控制措施。
- 黄春梅吴南卫尹江源邓瑶莫丽娟李冬梅陈洁
- 关键词：手足口病肠道病毒病原学
- 三亚市首例新冠病毒进化分支XBB.1.16的基因特征及风险因素分析
- 2024年
- 目的分析三亚市首例新冠病毒(SARS-CoV-2)XBB.1.16的基因特征并评估风险因素,为预防和控制疫情提供科学依据。方法收集三亚市2022年8月—2023年4月的260例新冠病毒感染者咽拭子样本,用RT-PCR方法检测SARS-CoV-2核酸,对ORF1ab和N基因检测Ct值小于32的样本使用Nanopore三代测序进行全基因组测序。根据测序结果将感染者分为XBB.1.16和其他进化分支,以感染者年龄、性别、社会和经济风险指数(SERI)等,人口统计和健康行为,作为风险因素,使用单变量和多变量逻辑回归推断SARS-CoV-2阳性与自变量之间的关联,并使用向前和向后逐步赤池信息准则(AIC)进行变量选择。结果基因测序显示三亚首例XBB.1.16感染者NextStrain分型为23B,覆盖率为100%。同武汉参考株(NC_045512.2)相比,核苷酸变异位点101个,氨基酸变异63个,XBB.1、XBB.1.5和XBB.1.16的突变频率>0.9,突变区为NSP6、NSP14、Spike和ORF8等。与病例密切接触、未接种疫苗和高风险社会和经济风险指数普查区是感染的危险因素。结论减少与患者密接并接种疫苗可以减少XBB.1.16等SARS-CoV-2感染。
- 李冬梅黄丽菊杨昌祖吴南卫林永通林瑶王建刘颖陈洁董冰冰
- 关键词：基因特征
- 海南省三亚市15例新冠病毒Omicron变异株BA.5.1.3亚型的基因组特征分析被引量：1
- 2023年
- 本文选取15例SARS-CoV-2感染病例的鼻咽拭子样本,采用新冠病毒全基因组三代Nanopore测序技术进行全基因组测序并对病毒的变异位点进行分析;结果显示,15株病毒均为BA.5.1.3变异株(Omicron),NextStrain进化分析为22B。15株毒株共同发现了71个核苷酸突变位点,氨基酸的变异位点有54个,其中存在相同的16个同义突变。15株毒株具有5个特有的核苷酸变异,4个特有的氨基酸变异位点,个别毒株还具有其他突变位点。这是中国境内首次发现Omicron BA.5.1.3变异株,此变异株存在引发本地的流行和暴发风险,需要严密持续的对境外输入病例进行流行病学调查和病毒基因分子特征分析。本研究构建测序方法和分析结果可用于新冠病毒的变异分析和病例溯源,对新冠疫情防控具有重要意义。
- 林永通黄春梅黄丽菊吴南卫李冬梅莫丽娟陈洁林瑶王建董冰冰
- 关键词：新型冠状病毒全基因组测序进化分析
