殷倩茜
- 作品数：5 被引量：76H指数：5
- 供职机构：大连水产学院生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划黑龙江水产研究所基本科研业务费专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 黑斑狗鱼部分基因组文库构建和微卫星位点的筛选(英文)被引量：9
- 2008年
- 采用磁珠富集与放射性杂交相结合的方法开发黑斑狗鱼(Esoxreieherti Dybowski)基因组微卫星资源。基因组DNA经Sau3AⅠ限制性内切酶消化后,选取400―900bp的片段进行PCR全基因组扩增,并利用生物素标记的(CA)12、(GA)12探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与pGEM-T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后利用γ-32P标记的放射性同位素探针进行第二次杂交。结果,共获得微卫星基因组文库1600个菌,杂交前菌落PCR检测阳性克隆率为90.91%;杂交后得到的阳性克隆为1300个,占87.25%。从中挑出196个进行测序,192(97.96%)个含有微卫星序列。在得到的微卫星序列中,重复单元除CA/GT、GA/CT外,还观察到单碱基、四碱基、五碱基重复单元。根据侧翼序列应用引物设计软件PrimerPremier5.0设计引物70对,选择合成32对,通过优化PCR反应条件,结果有28对引物可扩增出清晰可重复的目的条带。本研究旨在对黑斑狗鱼基因组资源的开发利用起到一定的促进作用,并为黑斑狗鱼养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等奠定基础。
- 王洪哲殷倩茜冯志纲李大宇孙效文李婵
- 关键词：黑斑狗鱼微卫星磁珠富集
- 微卫星分子标记对德国镜鲤两家系遗传多样性的比较分析被引量：12
- 2008年
- 利用35个微卫星分子标记对黑龙江松浦实验站2个家系德国镜鲤的观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）和有效等位基因数（Ae）等进行遗传检测，根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离，x^2检验估计Hardy—Weinberg平衡，并与其亲本的各项遗传指标进行比较。2个家系共检测到108个等位基因，平均每个基因座扩增得到3．0857个等位基因，片段长度在136～383 bp之间。结果显示，2个家系的多态性指标均适中，多态信息含量分别为0．4376、0．3254，多态性扩增的基因座的有效等位基因数在1．0339～4．6997个不等，平均有效等位基因数依次为2，2706、1．8432，无偏期望杂合度在0．1831～0．8006之间，平均值分别为0，5123、0．3881。但连锁不平衡分析表明，这2个家系在较大的选择压力下，已偏离Hardy—Weinberg平衡，讨论了出现这种现象的可能原因。
- 殷倩茜李大宇王洪哲曹顶臣鲁翠云孙效文梁利群
- 关键词：镜鲤微卫星
- 黄颡鱼(Pelteobagrus eupogon)不同生态地理分布群体遗传多样性的微卫星分析被引量：38
- 2009年
- 利用40个黄颡鱼微卫星分子标记对吉林省月亮湖野生黄颡鱼(YL,30尾)、四川野生黄颡鱼(SC,30尾)、黑龙江省哈尔滨市松花江段黄颡鱼(SH,18尾)、湖北省荆州市长湖野生黄颡鱼子代(YY,30尾)及其亲本(QQ,30尾)、天津市换新国家级原良种场黄颡鱼1号(TJ,30尾)6个黄颡鱼群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,x2检验估计Hardy-Weinberg平衡,采用近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化及其来源。同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA进化树。6个群体共检测到5042个扩增片段,长度在150—650bp,40个基因座扩增出等位基因数从1—8个不等,共计143个等位基因,平均每个基因座扩增得到3.575个等位基因。结果显示:(1)6个黄颡鱼群体的多态性指标均适中,PIC在0.00—0.79之间,平均值为0.40、0.37、0.35、0.39、0.35和0.19,有效等位基因数(Ae)1.00—5.44个不等,平均有效等位基因数依次为2.05、2.30、1.93、2.07、1.93和1.47,无偏期望杂合度(He)在0.00—0.83之间,平均值为0.45、0.46、0.36、0.46、0.41和0.23;(2)遗传相似系数YY与QQ遗传相似度最高(0.9947),TJ与SC遗传相似系数最低(0.4846),聚类结果与地理分布呈一定相关性。
- 李大宇殷倩茜侯宁孙效文梁利群
- 关键词：黄颡鱼微卫星
- 微卫星DNA标记分析野生鲤鱼群体的遗传多样性(英文)被引量：13
- 2007年
- 利用30个微卫星分子标记对海南鲤(HN)、长江鲤(CY)、月亮湖鲤(YL)、黑龙江鲤(FY)、呼伦湖鲤(ZL)、贝尔湖鲤(BR)6个野生鲤鱼群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,χ2检验估计Hardy-Weinberg平衡,用近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化及其来源。同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA进化树。6个群体共检测到8,136个扩增片段,长度在125bp～414bp,30个基因座扩增出等位基因数从3～13个不等,共计210个等位基因,平均每个基因座扩增得到7个等位基因。结果显示:(1)6个野鲤群体的多态性指标均适中,多态信息含量依次0.44、0.52、0.53、0.57、0.63和0.64,有效等位基因数1.04～4.72个不等,平均有效等位基因数依次为2.19、2.60、2.42、2.43、2.45和2.33,无偏期望杂合度平均值为0.50、0.59、0.56、0.56、0.57和0.54;(2)遗传相似系数BR与ZL最高(0.8511),BR与HN最低(0.6688),聚类结果与地理分布呈一定相关性。
- 李大宇康大海殷倩茜孙效文梁利群
- 关键词：分子标记微卫星鲤鱼
- 两个镜鲤半同胞家系的遗传多样性及经济性状分析被引量：7
- 2009年
- 在两个镜鲤半同胞家系中,各随机选取47尾作为实验鱼,测量体重、体长、全长等数量性状,利用24个微卫星分子标记对其进行遗传检测,共检测到57个等位基因,每个基因座的等位基因数为1—6个不等,平均等位基因3.21个,片段长度在134—371bp之间,有效等位基因数Ne为1.00—2.89,平均观察杂合度Ho为0.00—0.83,平均期望杂合度He为0.00—0.66,平均多态信息含量PIC为0.00—0.58。结果表明:2个家系的遗传多样性处于中度水平,但连锁不平衡分析表明这两个家系在较大的选择压力下,已严重偏离Hardy-Wenberg平衡。利用SPSS程序下的GLM过程对24个微卫星位点与主要经济性状的相关性进行分析,结果发现:HLJ519、HLJ848、HLJ855、HLJE84个微卫星位点对镜鲤体重显著影响(p<0.05),其中,位点HLJ519、HLJ848、HLJ855还对体长和全长存在显著影响(p<0.05)。对这些位点基因型所对应的表型均值进行了多重比较,找到了一些对主要经济性状有利的基因型。
- 王洪哲张研殷倩茜曹顶臣孙效文梁利群
- 关键词：微卫星标记镜鲤经济性状
