李晓博
- 作品数：3 被引量：11H指数：2
- 供职机构：天津药物研究院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项天津市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 分子动力学模拟法研究丹参酮II_A与胆固醇酯转运蛋白的相互作用模式
- 2013年
- 目的通过研究丹参酮IIA与胆固醇酯转运蛋白(CETP)的相互作用,探索其对CETP的影响模式。方法基于晶体结构构建丹参酮IIA与CETP多种形式的复合结构,并以此为起始结构进行分子动力学模拟,模拟软件为Gromacs 4.0,力场Gromos 96 53a6,温度300 K,模拟时间20 ns,记录轨迹,分析CETP整体形状和局部结构变化,考察丹参酮IIA与CETP的相互作用能量。结果磷酯酰胆碱出口区和空腔都装满后CETP结构比较刚性,单装空腔CETP结构容易变化。对应于CETP框架结构的形态变化,在与不同配体复合形式下CETP两侧的出口区和磷酯酰胆碱出口区以及空腔差异较大,丹参酮IIA与CETP相互作用较强的情况出现在2个磷酯酰胆碱出口位置和空腔左侧位置。结论 CETP是一个结构比较容易变化的载体蛋白,受装载配体结构和数量的影响容易发生相应变化,丹参酮IIA可能具有通过与磷酯酰胆碱或胆固醇酯共同作用影响CETP的形态,从而抑制其转运的能力。
- 张洁谭初兵徐为人李晓博汤立达
- 关键词：丹参酮IIA胆固醇酯转运蛋白相互作用转运分子动力学
- 分子动力学模拟法研究糖类衍生物与钠-葡萄糖协同转运蛋白2的相互作用被引量：3
- 2013年
- 目的利用分子动力学模拟方法研究糖类衍生物与钠-葡萄糖协同转运蛋白2(SGLT2)相互作用过程,探索SGLT2抑制剂的微观作用机制和构效关系。方法同源模建SGLT2的结构,利用GROMACS程序包进行SGLT2、SGLT2和葡萄糖复合物、SGLT2与糖类衍生物的复合物等8个结构的模拟计算,通过轨迹分析配体与SGLT2之间及分解结构的相互作用能,考察关键残基和配体的均方根涨落(RMSF)。结果分子动力学模拟得到的配体与受体的相互作用能比对接得分有更高的实验结果相关性和筛选能力。SGLT2参与相互作用的关键残基为H80、K154、D158、Y290,较重要的残基可能为N75和F453,辅助性残基可能为W291、Q295和S393。配体之间具有比较一致的构象,片段A和C对受体结合具有更重要的作用。A片段构象固定,C片段的体积、刚性和极性增加可以增加结合强度。结论分子动力学模拟结果能够较好地表现配体与SGLT2之间的相互作用,对于设计SGLT2抑制剂类新药具有较明确的指导作用。
- 陈娇王玉丽徐为人李晓博赵桂龙汤立达
- 关键词：相互作用能
- 新型肺动脉高压治疗药物马西替坦被引量：8
- 2014年
- 肺动脉高压是严重威胁人类健康的心血管疾病,药物是其主要治疗手段。Actelion公司开发的用于肺动脉高压的新型药物马西替坦(macitentan)是内皮素受体A(ET A)和内皮素受体B(ET B)的双重拮抗剂。临床前研究和临床试验结果表明马西替坦能有效延缓肺动脉高压患者的的疾病进展,延长患者的生存期,改善患者的生活质量,且肝肾毒性低,药物相互作用少。文中对其药理作用、药动学、临床评价及安全性做一综述。
- 潘晓菲谭初兵时丽丽李晓博汤立达
- 关键词：内皮素受体拮抗剂肺动脉高压
