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刘士勇
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10
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供职机构:
华中科技大学
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相关领域:
文化科学
医药卫生
自动化与计算机技术
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合作作者
张晓利
华中科技大学
谢娟
华中科技大学
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10篇
华中科技大学
作者
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刘士勇
3篇
张晓利
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谢娟
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第六届全国生...
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1篇
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1篇
2018
2篇
2017
1篇
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一种RNA编码潜能的预测方法
本发明属于基因注释领域,更具体地,涉及一种RNA编码潜能的预测方法。该方法(命名为CPPred)通过整合多个序列特征,特别是本发明使用CTD来描述RNA的全局分布;然后,以候选特征之间的冗余度和相关性作为标准,并结合递增...
刘士勇
童晓雪
文献传递
将大分子复合物结构映射到基因组和突变数据库的方法
本发明公开了一种将大分子复合物结构映射到基因组和突变数据库的方法。本发明包括计算蛋白质‑大分子(蛋白质/RNA/DNA)间的距离,得到复合物结构的结合位点;将蛋白质/RNA/DNA映射到基因组上;将得到的基因组坐标映射到...
刘士勇
谢娟
文献传递
一种与核糖核酸结合的蛋白质的预测方法
本发明公开了一种与核糖核酸结合的蛋白质(RBP)的预测方法。首先根据氨基酸的特性,获取样本蛋白的候选特征总集;然后以候选特征之间的相关度和/或冗余度为标准,从候选特征总集中选取<Image file="DDA000112...
刘士勇
张晓利
文献传递
一种蛋白质-RNA复合物结构预测方法
本发明公开了一种蛋白质‑RNA复合物结构预测方法,具体涉及一种基于模板构建蛋白质‑RNA相互作用模型的方法,首先通过从PDB数据库中挑选出439个的蛋白质‑RNA的模板库,然后使用蛋白质(RNA)的结构比对所有的模板复合...
刘士勇
郑进芳
文献传递
Another SVM-based predictor for RNA-binding protein prediction
Background: RNA binding proteins (RBPs) play critical roles in various cellular processes.Computational approa...
张晓利
刘士勇
关键词:
RNA-BINDING
PREDICTION
VECTOR
MACHINE
一种蛋白质‑RNA复合物结构预测方法
本发明公开了一种蛋白质‑RNA复合物结构预测方法,具体涉及一种基于模板构建蛋白质‑RNA相互作用模型的方法,首先通过从PDB数据库中挑选出439个的蛋白质‑RNA的模板库,然后使用蛋白质(RNA)的结构比对所有的模板复合...
刘士勇
郑进芳
将大分子复合物结构映射到基因组和突变数据库的方法
本发明公开了一种将大分子复合物结构映射到基因组和突变数据库的方法。本发明包括计算蛋白质‑大分子(蛋白质/RNA/DNA)间的距离,得到复合物结构的结合位点;将蛋白质/RNA/DNA映射到基因组上;将得到的基因组坐标映射到...
刘士勇
谢娟
文献传递
一种与核糖核酸结合的蛋白质的预测方法
本发明公开了一种与核糖核酸结合的蛋白质(RBP)的预测方法。首先根据氨基酸的特性,获取样本蛋白的候选特征总集;然后以候选特征之间的相关度和/或冗余度为标准,从候选特征总集中选取<Image file="DDA000112...
刘士勇
张晓利
一种RNA结构比对方法
本发明公开了一种RNA比对方法。该方法包括获得RNA初始比对结果;根据RMscore进行打分;计算比对上的核苷酸的空间距离,直到小于<Image file="DDA0001549148630000011.GIF" he=...
刘士勇
郑进芳
文献传递
一种RNA编码潜能的预测方法
本发明属于基因注释领域,更具体地,涉及一种RNA编码潜能的预测方法。该方法(命名为CPPred)通过整合多个序列特征,特别是本发明使用CTD来描述RNA的全局分布;然后,以候选特征之间的冗余度和相关性作为标准,并结合递增...
刘士勇
童晓雪
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