赵莎
- 作品数：4 被引量：68H指数：4
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所国家濒危药材繁育工程实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金科技基础性工作专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 党参药材及其混伪品的ITS/ITS2条形码鉴定研究被引量：24
- 2013年
- 为简便有效地鉴定党参药材及其混伪品并验证ITS/ITS2序列作为DNA条形码鉴定药材的稳定性和准确性,本研究选用党参药材及其混伪品作为研究对象,对33份药材样本提取基因组DNA,通过PCR扩增ITS序列,采用比对法、最小距离法对序列鉴定能力进行评估。通过序列比对,分析变异位点信息确定不同的单倍型并计算种内和种间K2P距离。ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型的HMMer(Hidden Markov Model)注释方法获得。结果表明,党参药材3个基原物种ITS序列长度为654-655 bp,ITS2序列长度均为239 bp,ITS/ITS2序列种内平均K2P遗传距离均远小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离,因此ITS/ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别党参药材及其混伪品,为其鉴定提供新的技术手段。
- 赵莎辛天怡侯典云庞晓慧程睿旸高建平
- 关键词：党参ITSITS2分子鉴定条形码
- 基于ITS2条形码鉴定柴胡与大叶柴胡被引量：24
- 2014年
- 为准确鉴定柴胡与大叶柴胡,该研究共48份柴胡、大叶柴胡药材,扩增ITS2序列并进行测序,采用CodonCode Aligner软件进行序列拼接,用软件MEGA5.0分析比对确定不同的单倍型,并基于K2P模型进行遗传距离等分析。采用相似性搜索法、最近距离法、构建邻接树(NJ树)法对柴胡与大叶柴胡进行鉴定。结果显示柴胡与大叶柴胡种间最小K2P距离为0.049,远远大于柴胡种内最大K2P距离0.013。NJ树显示大叶柴胡独自聚为一支,可明显与柴胡区分。因此应用ITS2条形码可以准确鉴定柴胡及大叶柴胡。
- 于俊林赵莎任明波钱齐妮庞晓慧
- 关键词：大叶柴胡柴胡ITS2DNA条形码
- 应用ITS2条形码鉴定中药材合欢皮、合欢花及其混伪品被引量：18
- 2014年
- 为准确鉴别中药材合欢皮、合欢花及其混伪品,该研究应用ITS2条形码对46份药材及其混伪品进行鉴定研究。通过对样本进行基因组DNA提取,PCR扩增和双向测序获得ITS2序列。所得序列经CodonCode Aligner拼接后,基于隐马尔可夫模型的HMMer注释方法去除两端5.8S和28S区段,用软件MEGA5.0对序列进行分析比对,并基于K2P模型进行遗传距离分析。采用相似性搜索法、最近距离法、构建NJ树对序列鉴定能力进行评估。结果表明,药材基原物种合欢的ITS2序列种内最大K2P遗传距离均远小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离;应用相似性搜索法分析结果表明ITS2序列可准确鉴定合欢药材及其混伪品;NJ树显示合欢药材与其混伪品可明显区分开,表现出良好的单系性。因此,应用ITS2条形码可稳定、准确地鉴别合欢药材及其混伪品。
- 赵莎庞晓慧宋经元陈士林
- 关键词：合欢皮合欢花ITS2DNA条形码
- 基于ITS2序列鉴定市售地骨皮药材及其混伪品被引量：12
- 2015年
- 目的基于中药材DNA条形码分子鉴定法鉴定市售地骨皮药材及其混伪品。方法本实验对象共计137份，依照中药材DNA条形码分子鉴定法标准操作流程（DNAbarcodingSOP）获取各样本ITS2序列，构建地骨皮药材及其混伪品DNA条形码数据库，对市售地骨皮药材及饮片进行鉴定。结果地骨皮药材ITS2序列长度为212—230bp，能够明显区分地骨皮药材及其混伪品。50％市售药材及饮片能够获得可用于分析的条形码序列，应用地骨皮药材及其混伪品DNA条形码数据库鉴定结果显示所得序列均为枸杞。结论ITS2序列能够作为地骨皮药材及其混伪品鉴定的DNA条形码，本实验所建立的地骨皮药材及其混伪品DNA条形码数据库能够用于市售地骨皮药材及饮片的鉴定。
- 辛天怡赵莎宋经元
- 关键词：地骨皮DNA条形码
