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袁野
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
供职机构:
中国科学院北京基因组研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
国家重点基础研究发展计划
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相关领域:
生物学
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合作作者
骆迎峰
中国科学院北京基因组研究所
胡松年
中国科学院北京基因组研究所
王广策
中国科学院海洋研究所
高胜寒
中国科学院北京基因组研究所
牛建峰
中国科学院海洋研究所
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骆迎峰
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海洋科学
年份
1篇
2011
共
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条斑紫菜低覆盖度基因组草图分析
被引量:4
2011年
对条斑紫菜(Porphyra yezoensis)进行Solexa高通量测序,获得低覆盖度全基因组草图。该基因组草图大小约220 Mbp,GC质量分数53.08%;包含26 629个预测基因,其中16 409个基因具有内含子,平均每个基因含2.22个内含子;基因结构分析表明具有内含子的基因平均长度为2 214 bp,内含子平均大小319 bp;代谢通路分析表明嘌呤代谢是含有蛋白数量最多的代谢途径。本研究所得条斑紫菜低覆盖度全基因组草图快速获取了基因组大小和蛋白编码基因结构等基本信息,证明了使用Solexa高通量测序技术对条斑紫菜进行全基因组测序的可行性。
牛建峰
高胜寒
骆迎峰
袁野
王广策
胡松年
关键词:
代谢通路
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