刘佳
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 供职机构：中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金三亚市院地科技合作项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- Magnetospira sp. QH-2 MamK蛋白的结构和系统进化分析
- 2016年
- Magnetospira sp.QH-2是一株分离自黄海潮间带的海洋趋磁螺菌,该菌磁小体排列不整齐,并且磁小体链内某些区域排列疏松,推测与其磁小体岛上的mam K编码的Mam K蛋白相关。mam K开放阅读框大小为1086 bp,编码361个氨基酸,Mam K蛋白属于NBD_sugar-kinase_HSP70_actin超家族,为非跨膜蛋白;此外,还利用生物信息学工具预测Mam K蛋白二级和三级结构。系统进化分析显示Mam K蛋白的系统进化和16S r RNA基因的系统进化有一定差异,推测磁小体岛的获得可能与菌种的进化是独立的两个过程;淡水与海水中的趋磁螺菌虽然形态相似,但系统进化地位有一定差异,可能是两者不同生境下适应性演化的结果。
- 滕兆洁张文燕刘佳董逸陈一然潘红苗杜海舰王明玲徐丛肖天
- 关键词：系统进化RRNA基因
- 三亚天涯海角潮间带趋磁细菌特性被引量：2
- 2016年
- 在三亚天涯海角潮间带沉积物中发现了一定量的海洋趋磁细菌,最大丰度可达100个/cm3。透射电子显微镜（TEM）观察发现该区域趋磁细菌绝大多数为趋磁球菌。磁小体形状单一,皆为棱柱形；磁小体排列方式多样,以链状排列为主,包括单链、双链,也有少数成簇排列。高分辨率透射电子显微镜（HRTEM）与 X-射线能谱仪（EDXS）结果表明,磁小体成分为 Fe3O4。趋磁细菌的铁含量平均为2.05%（0.70%-7.53%）。通过16S rRNA基因文库的构建与测序,在78个阳性克隆中得到了16个趋磁细菌序列,分属9个OTU。系统发育分析结果表明,其中8个OTU属于α-变形菌纲,1个OTU属于γ-变形菌纲。在全部9个OTU中,有8个OTU与已知趋磁细菌序列的相似性低于97%,有5个OTU与已知趋磁细菌序列的相似性低于93%,说明该区域存在可观的趋磁细菌资源。
- 徐丛陈海涛张文燕陈一然董逸潘红苗杜海舰王明玲刘佳滕兆洁肖天
- 关键词：潮间带趋磁细菌多样性磁小体RRNA基因
