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莫凡
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
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发文基金:
上海市科委纳米专项基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
林标扬
上海交通大学系统生物医学研究院
徐学敏
上海交通大学系统生物医学研究院
张政希
上海交通大学系统生物医学研究院
郭妍
上海交通大学系统生物医学研究院
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2009
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基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析
被引量:1
2009年
从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA,构建小RNA的cDNA文库,然后用illum ina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序。从测序获得的序列数据中去除冗余数据后,与已知人类m iRNA序列数据库进行比对,获得IGROV-1/CP细胞m iRNA表达谱。以所获的序列长度与已知人类m iRNA数据库中序列长度差异不大于2和无碱基错配为限制条件,共找到53种已知m iRNA。按在cDNA文库测序中的出现频率计算,出现频率不大于10的低拷贝m iRNA最多,占检测到所有m iRNA种类的56.6%。说明illum ina通用测序技术能够在检测细胞内的各种小RNA序列的同时反应相对丰度信息,该研究利用上述新技术获得了顺铂耐药性IGROV-1/CP细胞系m iRNA表达种类和相对丰度的实验数据。
张政希
莫凡
郭妍
徐学敏
林标扬
李伟
关键词:
卵巢癌
顺铂耐药性
MIRNA
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