刘小刚
- 作品数：10 被引量：13H指数：2
- 供职机构：西南大学园艺园林学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学金属学及工艺生物学更多>>
- 重庆3个主要砂梨品种SUC基因克隆及表达分析
- 2019年
- 蔗糖转运蛋白(sucrose/H^+ cotransporters或sucrose transporters,SUCs或SUTs)在调节同化产物的分配过程中具有重要作用。为研究梨果实发育成熟过程中关键的蔗糖转运蛋白及其生理功能,以重庆市主栽3个砂梨Pyrus pyrifolia品种"翠冠""黄花""圆黄"为试材,通过转录组测序获取高表达的SUC基因,随后采用进化聚类的方法对其生理功能进行预测。结果表明,在梨果实发育过程中高表达的SUC基因只有4个,命名为PrSUC1、PrSUC2、PrSUC3和PrSUC4;其中,PrSUC2、PrSUC3和PrSUC4在3个梨品种的果实中都有表达,而PrSUC1只在"黄花"果实中表达。进一步的qPCR分析表明,这4个基因在"黄花"的枝梢、叶片、花中同样都有较高的表达。进化聚类分析发现,PrSUC3和PrSUC4能够与拟南芥中Clade I/SUT1蛋白聚类,暗示它们更有可能参与了梨果实和其他组织中蔗糖的转运。
- 王久照谭嫣马小迪刘小刚曾明
- 关键词：糖积累转录组
- 金柑CHS和CHI基因的克隆及表达分析被引量：1
- 2019年
- 为了研究查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)和查尔酮异构酶(chalcone isomerase,CHI)在金柑类黄酮合成过程中的作用,从金柑果实中克隆3个CHS和2个CHI编码基因,构建进化树进行聚类分析;同时采用紫外分光法测定类黄酮含量,并通过qRT-PCR(quantitative real time polymerase chain reaction)进行定量分析。结果表明,FmCHS1和FmCHS2与已知功能CHS紧密聚为一类,界定为CHS蛋白;FmCHS3单独聚类,界定为CHS-like蛋白。FmCHI1界定为类型ⅠCHI蛋白,具有CHI酶催化活性,参与类黄酮合成;FmCHI2界定为类型ⅣCHI蛋白,在拟南芥中与类型ⅠCHI蛋白互作,促进类黄酮合成。在金柑果实发育过程中,类黄酮含量在果皮中呈明显的下降趋势,而在果肉中呈先升后降的变化趋势。FmCHS 1和FmCHI 1在金柑果实发育中呈高表达模式,且与类黄酮积累模式最为接近。FmCHS 1和FmCHI 1可能直接参与了金柑果实类黄酮的合成;虽然FmCHI 2没有催化功能,但与FmCHI 1互作促进类黄酮的合成。
- 马小迪马小迪王久照刘小刚刘小刚
- 关键词：金柑类黄酮查尔酮合成酶查尔酮异构酶
- 用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备被引量：1
- 2015年
- 以柑橘属Swingle分类系统界定的16种柑橘物种的基因组DNA为材料,构建了研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库,进而从中随机挑选出15 000条探针用于柑橘DArT芯片的开发.柑橘物种的基因组DNA采用改良CTAB法提取并等量混合,经Eco RI和Mse I双酶切后连接接头序列,再使用选择性引物进行PCR扩增,并将扩增产物转化大肠杆菌,构建探针文库.从探针文库中随机挑选出15 000个阳性单克隆,通过PCR扩增和纯化获得了15 000条用于制备DArT芯片的DNA探针.凝胶电泳检测显示所制备的DNA探针的纯度和浓度均满足了研制DArT芯片的要求.为采用DArT芯片快速鉴定柑橘物种并研究其进化关系奠定了基础.
- 马香刘小刚李利改周志钦
- 关键词：柑橘属探针文库
- 基于转录组测序的金柑类黄酮糖基转移酶基因的初步分析被引量：3
- 2019年
- 植物体内类黄酮通常以糖基化的形式存在,其糖基化由UDP–糖基转移酶(UDPglycosyltransferase,UGT)催化完成。以‘浏阳金柑’果实为研究对象,利用UPLCG2-SQTOF技术对其类黄酮种类进行鉴定,共检测出11种类黄酮,包括C–葡萄糖苷类黄酮、C–新橙皮糖苷类黄酮和O–新橙皮糖苷类黄酮。基于转录组测序,筛选出49个金柑果实发育过程中高表达的UGT基因。进化分析显示,13个高表达的FcUGT可能参与了类黄酮的糖基化修饰过程。其中,1个FcUGT编码C–葡萄糖基转移酶,参与了C–葡萄糖苷类黄酮的修饰过程;9个FcUGT编码7–O–葡萄糖基转移酶,可能参与了O–新橙皮糖苷类黄酮的修饰过程;3个FcUGT编码1,2–鼠李糖基转移酶,可能参与了O–或C–新橙皮糖苷类黄酮的修饰过程。
- 谭嫣马小迪王久照刘小刚曾明
- 关键词：金柑类黄酮糖基转移酶基因
- 甜橙UDP-糖基转移酶基因的筛选及其功能分析被引量：2
- 2021年
- UDP-糖基转移酶在植物中通常以基因家族的形式存在,在进行植物糖基化研究时,常常难以克隆到所需的目的基因。本研究对甜橙子房、花后20 d及40 d幼果进行转录组测序,筛选出了36个高表达Cs UGT基因。36个CsUGT基因的编码蛋白在motif组成上高度相似,其中,36个CsUGT的C端普遍含有motif 1和motif 2,24个Cs UGT的N端含有motif 3。它们的氨基酸数介于345~780 aa之间,分子量介于38.52~87.55kDa之间,等电点介于4.76~7.93之间。亚细胞定位预测显示,16个CsUGT定位于细胞质,4个定位于叶绿体,1个定位于胞外基质,9个定位于细胞质膜,2个可能定位于细胞质或叶绿体,4个可能定位在细胞质膜或细胞质。进一步的进化聚类分析发现,有6个CsUGT基因的编码蛋白可能参与了激素的糖基化修饰,20个可能参与了类黄酮的糖基化修饰。
- 陈锁英刘晓曼刘小刚曾明
- 关键词：糖基化甜橙转录组
- 金柑UDP-鼠李糖合成酶基因的克隆与功能解析被引量：1
- 2022年
- 以‘浏阳金柑’为研究材料,克隆到2个UDP-鼠李糖合成酶(UDP-Rhamnose synthase,RHM)基因FcRHM1和FcRHM2的全长。FcRHM1的开放阅读框(ORF)长度为2007 bp,编码668个氨基酸,分子量为75.3 kD;FcRHM2的ORF长度为2031 bp,编码676个氨基酸,分子量为76.2 kD。多序列比对显示,FcRHM与其他植物的RHM蛋白序列高度相似。亚细胞定位显示FcRHM1和FcRHM2定位于细胞质和细胞核。原核表达及体外酶促反应结果显示,FcRHM1和FcRHM2均可将UDP-葡萄糖转化为UDP-鼠李糖。组织特异性表达显示,FcRHM1和FcRHM2在不同组织中表达量存在一定的差异。结合UDP-鼠李糖的积累模式,认为FcRHM1和FcRHM2可能都参与了UDP-鼠李糖的合成,但FcRHM1对于花和果实中UDP-鼠李糖的合成更为关键,而FcRHM2则主要负责叶片及芽的UDP-鼠李糖的合成。
- 杨禹妍段新圆何治霖邴起浩陈锁英刘晓曼曾明刘小刚
- 关键词：金柑基因功能
- 植物糖基转移酶基因的分离方法及其生物学功能研究进展被引量：5
- 2016年
- 植物糖基转移酶是植物体内广泛存在的一种进行糖基化反应的转移酶,可以对糖、蛋白质等受体化合物进行糖基化修饰,从而改变其理化性质,对植物的次生代谢和维持体内激素稳态等的生长发育以及对生物及非生物胁迫的响应具有重要的意义。综述了近几年来植物糖基转移酶研究方法及生物学功能的进展情况,并对以后的研究热点进行了展望,旨为更多植物糖基转移酶的鉴定及分离方法提供一定的借鉴,同时希望对该家族基因进一步的功能分析有所帮助。
- 罗燕刘小刚周志钦
- 关键词：糖基转移酶转录组测序全基因组分析生物学功能胁迫
- 基于分子标记技术的柑桔属植物进化与分类研究进展
- 2016年
- 简单介绍了目前国内外主要的柑桔属植物分类系统,并分析RAPD、SSR、AFLP等标记方法各自的特点及其在柑桔属植物分类与进化研究中的实际应用情况。总结了过去十余年分子技术在柑桔属研究中所取得的进展。阐述了柑桔属植物的原生种类及数目、原生种类间进化关系、柑桔属种间进化和分类关系的情况,旨在为今后的研究提供借鉴和参考。
- 伍泓昆刘小刚周志钦
- 关键词：柑桔属分子技术进化
- 水轮机下环铸钢件热应力数值模拟
- 采用有限差分/有限元集成铸件热应力分析系统对某下环铸件进行了铸造过程热应力分析,其中采用接触单元算法处理铸件/铸型接触面。提出了准固相区受拉应力作用并且不能被有效补缩时即产生热裂的热裂倾向性判据,对该下环铸件的热裂倾向进...
- 康进武刘小刚张然黄天佑柳百成
- 关键词：应力分析热裂
- 文献传递
- 数值模拟技术在大型铸件中的应用
- 大型铸件在装备制造业中具有重要地位,对国民经济建设具有重要影响。大型铸件向更大、更厚方向发展,尺寸和重量记录不断被刷新。铸件凝固过程数值模拟技术对指导大型铸件生产具有重要作用。数值模拟技术已经在大型铸件生产中得到应用,包...
- 康进武黄天佑刘小刚柳百成
- 关键词：大型铸件数值模拟
- 文献传递
