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殷志明
作品数:
1
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供职机构:
西南大学生物技术学院
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发文基金:
国家自然科学基金
国家重点基础研究发展计划
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相关领域:
生物学
农业科学
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合作作者
周春燕
西南大学生物技术学院
李俊龙
西南大学生物技术学院
查幸福
西南大学生物技术学院
夏庆友
西南大学生物技术学院
向仲怀
西南大学生物技术学院
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作者
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向仲怀
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夏庆友
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查幸福
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李俊龙
1篇
周春燕
1篇
殷志明
传媒
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蚕业科学
年份
1篇
2014
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家蚕全基因组启动子预测及基于芯片表达谱的精巢偏向表达启动子顺式元件分析
2014年
启动子是基因的重要组成部分,决定mRNA的转录,从而实现生物的有序发育过程。基于家蚕基因组和全长cDNA序列数据,鉴定了1 341条家蚕启动子序列。序列分析显示,在启动子-500~200 bp区间的GC、AT含量分别出现了1次和2次高峰值。TATA框(TATA-box)、起始子(Inr)、CAAT框(CAAT-box)和GC框(GC-box)等元件分别在256、453、200、334个启动子中被鉴定出,前3种元件集中分布于启动子-500~200 bp区间,第4种元件主要分布在-1 600^-300 bp上游较远处。进一步利用家蚕芯片表达谱数据发现23个启动子为精巢偏向表达基因的启动子。顺式元件分析这些精巢偏向表达启动子中含有6个高频率基序(motif),其中3个motif在精巢偏向表达启动子中的出现频率显著高于对照组,暗示这3个motif在精巢偏向表达基因的转录调控中可能起着重要作用。
查幸福
殷志明
周春燕
李俊龙
张李颖
向仲怀
夏庆友
关键词:
家蚕基因组
启动子
顺式元件
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