李菲
- 作品数：31 被引量：93H指数：5
- 供职机构：贵州师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金贵州省科学技术基金博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程化学工程更多>>
- 大学生对进化树的常见误解
- 2018年
- 进化是生命科学的核心,是每一位生物学大学生必须理解和透彻掌握的课题.然而,进化的几个核心方面并非与人们的直观感觉一致.许多研究表明,学生对微观进化中的关键概念,如自然选择等,持有错误观念.文章讨论了大学生对进化树的常见错误观念,并提出了教学过程中应注意的问题.
- 李菲
- 关键词：进化树
- 杜鹃花属序列中微卫星位点特征分析和引物开发被引量：3
- 2018年
- 杜鹃是杜鹃花科(Ericaceae)杜鹃花属(Rhododendron spp.)的灌木植物。野生种质资源主要分部于我国四川、云南、贵州及长江流域各省,中国北方的大兴安岭、小兴安岭地区等也有分布。中国的杜鹃种类约占全世界种类的70%。杜鹃花是重要的花卉植物,也兼有保健食品、化妆品、药物开发及生物研究等价值。SSR标记是植物品种鉴定中最广泛使用的理想分子标记。在杜鹃花种质资源的系统分类、品种资源搜集、整理等方面,相关的研究还比较欠缺。杜鹃花属内种类繁多,至今在系统划分和某些种类的归属上仍然众说纷纭。我们鉴定了NCBI数据库公开杜鹃花属基因组序列的SSR序列位点;分析了杜鹃花属基因组序列中SSR位点的基序、重复数、碱基组成的特征;并设计了1 643对杜鹃花属SSR扩增引物。本研究是第一个杜鹃花属基因组序列SSR位点特征系统分析的尝试。本研究设计的SSR引物可满足所有常见杜鹃花品系的遗传关系分析,对促进杜鹃花野生种质资源保护、新品种培育,具有重要的意义。
- 龚记熠刘欢张习敏孙威李菲
- 关键词：杜鹃花SSR分子标记
- 高砷煤矿周围旱作土壤重金属污染特征及农作物健康风险评价被引量：13
- 2023年
- 为了掌握高砷煤矿周边旱作农田重金属污染状况,运用单因子污染指数法、内梅罗综合污染指数法和地积累指数法对高砷煤矿周边旱作土壤重金属(As、Cd、Hg、Cu、Zn)进行污染风险评价,并采用富集系数法、目标危害商数法和致癌风险指数法对农作物和人体健康风险进行评价。结果表明:调查区域土壤综合污染指数均值为2.12,属中度污染水平;土壤中As、Cd、Hg、Zn、Cu的含量均值分别为全国土壤背景值的7.91、2.57、5.26、1.53、3.44倍;As和Hg的污染等级高且范围广,Cu污染等级低但污染范围广,Cd的污染等级较低且范围较小,Zn基本无污染。富集系数法评价结果显示,作物对5种重金属的吸收能力表现为Cd>Zn>Cu>Hg>As。农作物健康风险评价结果显示,5种农作物的健康风险主要为非致癌风险,As是可食用农作物(除玉米外)的主要致癌风险因子和非致癌风险因子,Cd是烟草的主要致癌风险因子和非致癌风险因子。食用本地农作物对人体造成的健康风险依次为As>Cd>Hg>Cu>Zn。研究表明:研究区域土壤处于中度污染水平,As的风险较高;可食农作物中重金属的潜在健康风险主要源于As,且对儿童造成的健康风险明显高于成人;烟草的健康风险主要源于Cd;农作物中辣椒和烟草的健康风险最高。
- 欧灵芝胡鸣明安德章唐明唐明秦樊鑫孙媛媛
- 关键词：旱作土壤作物重金属污染砷
- 拟南芥响应高钙的miRNAs的筛选与鉴定(英文)被引量：1
- 2020年
- 院喀斯特地区土壤中钙含量较高。土壤钙含量过高会抑制植物生长,进而影响农作物产量和质量。目前,对植物应答和耐受高钙胁迫的机理研究还不深入。miRNAs在植物对生物和非生物胁迫的响应中起重要调控作用。本文应用转录组测序,对高钙响应拟南芥根部miRNAs进行分析,筛选到受高钙胁迫显著影响的12个miRNAs,并对其靶基因进行了预测和分析。实时定量PCR分析证实,大部分差异表达miRNAs和其靶基因表达负相关。本研究为进一步揭示miRNAs在植物响应高钙胁迫过程中的调控作用奠定了基础。
- 李菲石天龙龚记熠张习敏汤晓辛乙引
- 关键词：拟南芥MIRNA靶基因
- 根际益生菌挥发性有机物对拟南芥根部基因表达的影响分析
- 2020年
- 细菌挥发性有机物影响植物生理过程的分子机理,是近年研究的热点。研究已经证明,B.amyloliquefaciens GB03挥发性有机物影响拟南芥生长、发育调控和对逆境的响应等多个生理过程。但目前还没有对B.amyloliquefaciens GB03挥发性有机物对拟南芥根部基因表达影响的完整和系统分析。本研究通过高通量转录组测序,筛选出受到根际促生细菌GB03挥发性有机物处理影响的拟南芥功能基因和通路,并对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,获得GB03挥发性有机物影响拟南芥生理过程的分子调控网络。本研究对根际促生细菌挥发性有机物对拟南芥基因表达影响的RNAseq结果与分析进行了报道,此结果对揭示根际促生细菌调控植物生理过程的分子机理,有极大的促进作用。
- 李菲李霞刘杰张习敏何小红乙引
- 关键词：挥发性有机物拟南芥转录组
- 高纯度金钗石斛生物碱提取工艺的开发被引量：3
- 2021年
- 通过设置不同pH、温度、酶解时间、酶用量和乙醇浓度等梯度条件,确定酶法提取生物碱的最适条件为酶用量7 mg酶/g石斛粉、缓冲液pH=5、酶解温度40℃、酶解时间2 h;提取条件在75%的乙醇、固液比为1∶12,碱化后在pH=8时,效果最好。将乙醚重结晶3次母液合并,以20 kg石斛作为原料,可获得20 g以上纯度为98.4%的产物,经气质联用法(GC-MS)鉴定提取物为石斛碱。结论:酶法提取生物碱的效果较好,可用于金钗石斛总生物碱的分离纯化。该方法简单快速,稳定高效,具有潜在工业生产价值,为金钗石斛总生物碱的工业化生产提供了实验依据。
- 张丽君李菲洪鲲张宇斌乙引
- 关键词：金钗石斛石斛碱酶法提取
- 旋蒴苣苔CDPK基因家族鉴定与特征分析被引量：1
- 2022年
- 钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是植物特有的一类丝氨酸/苏氨酸型蛋白激酶。CDPK在介导植物生长发育和逆境信号转导中具有重要作用。大多数高等植物无法耐受极度脱水状态,然而旋蒴苣苔进化出独特的耐脱水机制,能够耐受体内水分丧失90%以上,且复水后迅速恢复生活状态。为揭示旋蒴苣苔CDPK基因在生长发育与抗旱防御机制中的作用,本研究基于旋蒴苣苔基因组数据,在全基因组水平利用生物信息学工具对CDPK基因家族成员进行鉴定,并对其系统进化、基因结构、染色体定位等进行分析并对部分基因进行功能预测。本研究鉴定了旋蒴苣苔CDPK基因家族,并对其进行相关分析,为在基因组范围内研究CDPK基因在旋蒴苣苔抗旱逆境响应中的功能提供了理论基础。
- 石天龙李欲柯洪鲲龚纪熠李菲
- 关键词：CDPK生物信息学
- 复苏植物旋蒴苣苔早期光诱导蛋白的特征分析被引量：3
- 2019年
- 随着全球气候变暖,旱胁迫越来越成为粮食生产的严重威胁。探索复苏植物耐受极端旱胁迫的机理,积累抗旱相关基因资源,对于植物适应逆境的基础研究,和农业可持续发展,均有重要的作用。旋蒴苣苔(B. hygrometrica)广泛分布于我国山区,是复苏植物的代表性物种,而且有高质量的全基因组序列可以分析利用。本研究对旋蒴苣苔(B. hygrometrica)基因组中的早期光诱导蛋白(ELIPs)基因家族进行挖掘和分析。旋蒴苣苔(B. hygrometrica)基因组中早期光诱导蛋白(ELIPs)基因的数目远高于其他植物(拟南芥,水稻,辣椒,番茄)。系统发育分析显示,早期光诱导蛋白(ELIPs)基因序列具有很高的植物特异性。这说明,早期光诱导蛋白(ELIPs)基因对不同植物进化和适应各自的生长环境具有重要的作用。对处于不同程度干旱状态的旋蒴苣苔(B. hygrometrica)叶片的基因表达分析,表明一部分早期光诱导蛋白(ELIPs)基因表现出很强的对旱处理的响应。不同的早期光诱导蛋白(ELIPs)基因表现出三种不同的响应模式。这些结果表明,旋蒴苣苔(B. hygrometrica)早期光诱导蛋白(ELIPs)基因参与植株应对旱胁迫,而且有精细的调控机制控制不同早期光诱导蛋白(ELIPs)基因的表达量。
- 李菲张习敏王野影乙引
- 关键词：复苏植物干旱胁迫
- 番茄水通道蛋白基因家族的生物信息学分析被引量：8
- 2018年
- 植物水通道蛋白不仅仅在根系输送水分,而是具有底物和细胞定位的多样性的基因家族,因而对植物生理和发育过程,包括种子发芽、侧根发生、碳固定和营养吸收等都有重要的贡献。番茄基因组中共有44个水通道蛋白基因。这些基因可分为TIP、PIP、NIP和SIP 4个亚家族。这4个亚家族具有不同的功能和亚细胞定位。在番茄十号染色体水通道蛋白聚集位点上的5个基因与一号染色体上的一个基因是直系同源水通道蛋白,相似度都很高,同属于PIP亚家族。番茄水通道蛋白大多在根部表达量较高,在茎、叶、花等部位表达较低。不过Solyc03g096290.2.1和Solyc01g094690.2.1基因在花中表达量最高。此外,有个别基因表达量稳定在较高的水平,包括Solyc06g074820.2.1和Solyc08g081190.2.1。这些基因的功能可能不仅是吸收和转运水分,是否有其他的转运底物,在植物抗逆和发育过程中是否有调控作用,是下一步研究的重点。番茄全基因组中的水通道蛋白进行检索和分析,对番茄分子生物学研究和种质改良都有重要的意义。
- 李菲何小红李育柯乙引
- 关键词：番茄水孔蛋白系统进化特异表达
- 蒺藜苜蓿和天蓝苜蓿热激因子(HSF)家族的筛选与功能分析被引量：1
- 2017年
- 全球气候变化构成了对全球重要农作物和世界食品安全的主要威胁。植物生物学家和育种者迫切需要改善当前种质,开发出能够在胁迫条件下有高水平表现的新品种。热应激转录因子(Hsfs)是植物热激反应(Heat Shock Response)的中心环节,通过调节大量功能基因的转录来控制HSR的信号传导和代谢反应。利用蒺藜苜蓿基因组序列和基因芯片数据,我们筛选出蒺藜苜蓿HSFs转录因子基因家族,对蒺藜苜蓿HSFs基因家族进行基因结构、染色体位置和系统进化关系分析,并对蒺藜苜蓿HSFs基因响应生物和非生物胁迫过程中的功能进行预测。此外,我们还对天蓝苜蓿的叶片转录组进行高通量测序,并分析了天蓝苜蓿叶片中存在的HSFs基因序列。我们的结果显示,蒺藜苜蓿基因组中有23个HSF基因,这些基因参与蒺藜苜蓿对生物和非生物胁迫的响应,不仅对于苜蓿改良,对于农作物的改良也会有巨大的应用潜力。
- 李菲何小红张习敏龚记熠乙引
- 关键词：蒺藜苜蓿HSF转录因子逆境
