刘江涛
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：贵州师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金贵州省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 基于酶序列数据库的本地化构建及应用
- 2017年
- 细胞内的代谢网络包含成千上万个化学反应,每个化学反应都有一个特定的酶催化。在整个生物系统中,存在着成千上万个的酶,这些酶支配着生物的新陈代谢、营养和能量转换等催化过程,与生命过程密切相关。为此在国内外生物信息学数据库的基础上,利用java的jsoup的软件包获取到网页中代谢网络中酶的数据,构建酶的本地化信息数据库。方便研究人员查询物种的代谢网络中酶的基础信息,重构代谢网络。
- 刘江涛周文卫申铁
- 关键词：代谢网络数据库
- 鸟王茶转录组测序及其初步分析和应用
- 鸟王茶是目前全国罕见的有碑文记载的朝廷贡茶，有着悠久的历史和深厚的文化积淀，为贵州省特有的珍稀品种，其可作为远缘杂交、基因嫁接、基因累加等高科技育种材料，以进行突破性育种，是选育优良茶树品种不可替代的基因源。在茶树起源、...
- 刘江涛
- 关键词：基因测序位点分析生物数学
- 鸟王茶转录组中SSR位点信息分析被引量：2
- 2017年
- 为开发鸟王茶分子标记技术,对使用高通量测序所获得的鸟王茶转录组原始数据,经过软件Trinity拼接,共获得161 561条Unigenes,使用软件MISA进行SSR位点搜索,共得到51 453个SSR,分布于36 691条Unigenes中,总长度为554 050bp,发生频率为31.85%,平均分布频率是1/1.79kb,平均长度为10.77bp。在鸟王茶转录组SSR中,二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占总SSRs的45.05%和13.86%。鸟王茶转录组SSR种类共有223种重复基元类型,其中优势重复基元是A/T、AG/CT、AC/GT它们所占比例分别是:36%、32%、13%,这3种重复基元,占总SSRs的比例是81%。
- 刘江涛曹烁黎瑞源申铁
- 关键词：转录组SSR
