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sgRNAcas9软件图形用户界面开发及应用被引量：3: 2015年; CRISPR/Cas9系统介导的基因组编辑技术是新一代功能强大的基因修饰技术。然而，脱靶效应（Off-target effects）是目前CRISPR/Cas9技术面临的最大问题。因此，设计脱靶风险低的sgRNA（single guide RNA）就成为关键。sgRNAcas9是一款专门用于sgRNA设计和评估脱靶效应的软件包。针对其核心运行程序，我们利用Java程序语言开发了其图形用户界面。此外，依据脱靶位点碱基数和 sgRNA 种子序列（seed sequences）的特异性，通过设置不同的风险等级对sgRNA的脱靶效应进行评估。随后，利用此软件设计了34124条靶向人、小鼠、大鼠、猪和鸡中共4691个microRNA（miRNA）前体的sgRNAs。此外，随机挑选了一个靶向人miR-206前体的sgRNA进行脱靶效应评估和验证。结果发现，sgRNAcas9软件人机交互界面友好，大多数miRNA前体可通过该软件寻找到 sgRNA，且他们的 GC%含量范围集中于40%~-60%。利用 sgRNAcas9软件设计的靶向 miR-206的 sgRNA，其基因组编辑活性和脱靶位点可被实验验证。本研究表明 sgRNAcas9图形用户界面软件能针对任意物种设计特异性的sgRNA，其可在BiooTools（http：//www.biootools.com/）网站下载。; 赵长志张懿李广磊陈济良李京津任瑞敏倪攀赵书红谢胜松; 关键词：计算机辅助设计

MyoD诱导转分化中CTCF介导染色质互作的特征与功能研究: 细胞转分化是一种将分化到终末端的细胞直接转变为另一种细胞的过程，是细胞重编程的一种方式，也是生物体发育和再生过程中自然发生的一种细胞变化现象。近年来，研究人员根据此现象在体外进行模拟，通过过表达某些重编程因子或使用小分子...; 任瑞敏; 关键词：细胞转分化

猪RNA聚合酶Ⅱ单克隆抗体的制备与应用: 2021年; 旨在制备猪RNA聚合酶Ⅱ的单克隆抗体并进行初步应用。本研究采用生物信息方法预测免疫原,将其化学合成后免疫5只4~8周龄Bal b/c雌性小鼠,对免疫后呈现阳性的小鼠进行细胞融合试验,取其脾细胞与骨髓瘤细胞进行融合并获得能稳定分泌抗RNA PolⅡ的杂交瘤细胞。鉴定结果显示,RNA PolⅡ单克隆抗体的重链为IgG 2A型,轻链为Kappa型。利用间接ELISA方法对杂交瘤细胞进行筛选和亚克隆,获得了8株稳定分泌RNA PolⅡ单克隆抗体的杂交瘤细胞株。将其初步应用到染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)技术,并与商业化抗体的富集性进行比较,结果表明,本研究得到的单克隆抗体富集性更强。本研究获得的猪RNA PolⅡ单克隆抗体可为表观遗传学的研究提供理论基础,并且提供重要的生物学材料。; 田小欢刘茹刘茹任瑞敏孙艳任瑞敏余梅; 关键词：单克隆抗体杂交瘤细胞

一种猪骨骼肌卫星细胞的培养基PM+及其应用: 本发明属于动物细胞培养技术领域，具体涉及一种猪骨骼肌卫星细胞的培养PM+及其应用。所述的猪骨骼肌卫星细胞培养的培养基PM+，按重量/体积计的成分如下所述：培养基PM+总体积为1L，添加胎牛血清(FBS)20％；细胞培养添...; 曹建华王昇任瑞敏黄英赵书红; 文献传递

两条特异性靶向猪Pax7基因的sgRNA导向序列及应用: 本发明属于动物基因工程技术领域，具体涉及两条特异性靶向猪Pax7基因的sgRNA导向序列及应用。本发明在猪Pax7基因起始密码子ATG附近位置设计了4个sgRNA导向序列，利用CRISPR/Cas9系统，从中挑选出能够特...; 王恒任瑞敏蒋云琪尹彬旭廖胤龙蔡豪朱桂玉; 文献传递

一种猪组织染色质免疫沉淀处理方法: 本发明属于家畜免疫学技术领域，具体涉及一种猪组织染色质免疫沉淀处理方法。该方法简称为ChIP。本发明专门针对猪组织进行优化设计，采用组织裂解液与Dounce研磨器相结合，开发适合猪组织匀浆的方法、步骤和流程，使组织裂解充...; 曹建华任瑞敏黄英孙艳王昇赵书红; 文献传递

一种猪骨骼肌卫星细胞的培养基PM+及其应用: 本发明属于动物细胞培养技术领域，具体涉及一种猪骨骼肌卫星细胞的培养PM+及其应用。所述的猪骨骼肌卫星细胞培养的培养基PM+，按重量/体积计的成分如下所述：培养基PM+总体积为1L，添加胎牛血清(FBS)20％；细胞培养添...; 曹建华王昇任瑞敏黄英赵书红; 文献传递

两条特异性靶向猪Pax7基因的sgRNA导向序列及应用: 本发明属于动物基因工程技术领域，具体涉及两条特异性靶向猪Pax7基因的sgRNA导向序列及应用。本发明在猪Pax7基因起始密码子ATG附近位置设计了4个sgRNA导向序列，利用CRISPR/Cas9系统，从中挑选出能够特...; 王恒任瑞敏蒋云琪尹彬旭廖胤龙蔡豪朱桂玉

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任瑞敏