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郭秀丽
作品数:
1
被引量:48
H指数:1
供职机构:
青岛农业大学农学与植物保护学院茶叶研究所
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发文基金:
山东省科技发展计划项目
山东省自然科学基金
国家科技支撑计划
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相关领域:
农业科学
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合作作者
王玉
青岛农业大学农学与植物保护学院...
杨路成
青岛农业大学农学与植物保护学院...
丁兆堂
青岛农业大学农学与植物保护学院...
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CBF1基因
1篇
茶树
机构
1篇
青岛农业大学
作者
1篇
丁兆堂
1篇
杨路成
1篇
王玉
1篇
郭秀丽
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遗传
年份
1篇
2012
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茶树CBF1基因密码子使用特性分析
被引量:48
2012年
转录因子CBF(C-repeat-binding factor)广泛存在于各种植物中,是植物抗逆过程中一个重要的调节因子。文章运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序对茶树(Camellia sinensis)CBF1基因(CsCBF1)序列进行分析,并与茶树基因、模式植物基因组和其他植物CBF基因进行比较,对了解CsCBF1基因密码子使用特性,并为其选择合适的表达系统具有重要意义。结果表明:CsCBF1基因与70个茶树基因对密码子的使用有明显的差异,CsCBF1基因偏好使用以G/C结尾的密码子,而筛选的70个茶树基因偏好使用以A/T结尾的密码子。在密码子使用频率上,CsCBF1基因与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tobacum)的差异小于与小麦(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)的差异;因此,拟南芥、烟草更适合作为CsCBF1基因的外源表达宿主。通过分析40种植物CBF基因编码特点可知大部分CBF基因偏好使用以G/C结尾的密码子,这可能与基因的特殊功能有关。
郭秀丽
王玉
杨路成
丁兆堂
关键词:
茶树
CBF1基因
密码子偏好性
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