范一星
- 作品数：12 被引量：36H指数：4
- 供职机构：内蒙古农业大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学天文地球医药卫生更多>>
- 基于RNA-Seq绒山羊皮肤两种毛囊差异表达基因的分析被引量：3
- 2017年
- 为了研究绒山羊皮肤初级毛囊和次级毛囊之间的表达基因模式的差异,筛选影响毛囊发育的重要基因,对6只内蒙古绒山羊阿尔巴斯型个体进行RNA-seq测序,利用生物信息学方法对转录组数据进行分析,在测序结果质量控制后的基础上,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。共筛选到617个在初级毛囊和次级毛囊中差异表达的基因,其中,上调表达基因297个,下调表达基因320个。GO功能注释结果显示,上调表达基因主要行使电子传递链、呼吸链电子传递、线粒体电子传递、基因表达等生物学功能;下调表达基因主要行使细胞吞噬、蛋白质复性、中性粒细胞聚集、细菌真菌防御反应等生物学功能。利用KEGG数据库作为参考,这些基因主要参与半胱氨酸和蛋氨酸代谢、RNA聚合、RNA可变剪切、底物磷酸化等通路。PPP2R2A和CDK2AP1基因可能在皮肤毛囊发育中发挥重要作用,以上结果为今后深入研究皮肤毛囊发育相关基因及功能提供了依据。
- 苏蕊乔贤范一星范一星李晓凯张磊王瑞军王瑞军刘志红王志英李金泉
- 关键词：绒山羊毛囊转录组
- 山羊基因组与遗传变异图谱研究进展被引量：1
- 2020年
- 高通量测序技术和生物信息学的发展极大的促进了山羊分子生物学研究。山羊参考基因组的不断完善以及基因组重测序技术的应用,在全基因组水平上发现了大量的遗传变异信息(SNP、Indel和CNV),丰富了山羊分子群体遗传学研究利用的分子标记。综述了山羊参考基因组组装和全基因组变异图谱的构建及其在山羊上的研究进展,以期为进一步利用分子遗传标记进行山羊的各种性状的遗传基础研究和遗传资源保护利用提供科学依据和参考。
- 李晓凯范一星乔贤张磊王凤红王志英王瑞军张燕军张燕军王志新刘志红李金泉王志新张家新
- 关键词：山羊单核苷酸多态性拷贝数变异
- 山羊基因组研究进展被引量：4
- 2019年
- 山羊基因组是山羊品种资源保护和利用的研究依据,对培育和改良山羊品种具有重要意义。目前,随着山羊参考基因组的不断完善,在山羊起源、进化和适应性等方面的研究取得了诸多重要成果。本文详细综述了山羊基因组研究进展,主要包括山羊基因组结构、山羊基因组图谱(遗传图谱、物理图谱和比较图谱)、山羊高通量测序和山羊SNP芯片的开发及利用,以期为开展山羊基因组选择(genome selection,GS)奠定理论基础。
- 王凤红张磊李晓凯范一星乔贤龚高严晓春张令天王志英王瑞军刘志红刘志红何利兵王志新李金泉赵艳红张燕军
- 关键词：山羊基因组结构基因图谱芯片
- 绒山羊毛被类型多样性研究进展被引量：3
- 2020年
- 根据被毛纤维特征、生长时间和颜色特点等,可将绒山羊分为长毛型和短毛型,粗毛型和细毛型,嵌合型,穗状弯曲型和直绒型,常年长绒型和季节性长绒型,白绒、青绒以及紫绒等不同类型。相较于其他分类,目前对粗毛纤维性状的多样性研究较为丰富,其不同类型与其他重要经济性状具有中等偏下的表型相关和遗传相关,对绒毛经济性状的间接选择具有一定的参考价值。作者根据近年来绒山羊的相关研究资料,探讨了绒山羊毛被类型的多样性及其划分依据的差异,并对绒山羊不同毛被类型的今后研究方向提出了展望和思考,以期为进一步对不同毛被类型的分子生物学研究和新品系选育提供借鉴和理论依据。
- 李晓凯范一星乔贤张磊王凤红王志英王瑞军张燕军张燕军王志新刘志红李金泉王志新张家新
- 关键词：绒山羊绒毛品质
- 基于转录组测序分析内蒙古绒山羊毛囊退行期与休止期差异表达基因
- 2018年
- 为了探究内蒙古绒山羊次级毛囊（SHF）退行期到休止期以及相应时间点的初级毛囊（PHF）的差异表达基因,试验对3只内蒙古绒山羊阿尔巴斯型2周岁成年母羊的退行期和休止期的初、次级毛囊进行转录组测序,并采用生物信息学方法分析数据;在检测测序质量合格的基础上,进行差异表达基因的筛选、GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果表明：在次级毛囊中,退行期（1月份）与休止期（3月份）分别对比到50 626个和50 628个转录本,其中1 199个差异表达基因中有953个上调基因和246个下调基因;初级毛囊在这两个时间点分别比对到50 629个和50 626个转录本,其中1 977个差异表达基因中有1 258个上调、719个下调;这两个时期中,共有100个差异表达基因同时比对到初级毛囊与次级毛囊中。GO功能富集结果显示,次级毛囊两个时期的差异表达基因主要富集在肌肉重建、肌丝滑动等功能上;初级毛囊两个时期差异表达基因主要富集在翻译延伸、转录拼接等功能上。
- 苏蕊刘燕刘燕范一星李晓凯李晓凯张磊丽春王瑞军王瑞军
- 关键词：内蒙古绒山羊毛囊转录组测序差异表达基因
- 全基因组关联分析在畜禽重要经济性状中的研究进展被引量：5
- 2017年
- 以往通过候选基因分析和数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)连锁分析等策略使我们对一些基因的功能有了一定了解,但是很多控制畜禽经济性状的基因还无法分离和鉴定。随着高通量测序技术的不断发展以及人类全基因组计划(human genome project,HGP)和许多动植物的全基因组测序完成,全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)已经成为研究复杂性状的重要方法。文章针对GWAS在重要畜种复杂经济性状中的研究进展进行综述,梳理了近几年在动物经济性状研究中利用GWAS取得的成果,并且对GWAS研究策略与方法进行了归纳总结,旨在利用GWAS为畜禽复杂性状的遗传基础研究提供参考,同时为今后的动物育种工作奠定基础。
- 乔贤张磊李晓凯范一星马宇浩张燕军刘志红王瑞军王志英王志英王志新赵艳红李金泉李金泉
- 关键词：畜禽
- 皮肤毛囊发育的转录组研究进展被引量：13
- 2015年
- 近年来,转录组测序技术在动物重要经济性状受复杂基因网络的调控研究领域取得了显著的成果。作为哺乳动物皮肤的衍生物,毛囊是唯一具有高度自我更新能力、独特的可再生器官,毛囊细胞经增殖分化最终形成毛发。已有的研究表明,诸多生长因子及其受体作为体内分泌协调基因的重要因素,对毛发的生长发育起着重要的调控作用。文章综述了近年来转录组测序技术在人、小鼠及羊等生物的皮肤毛囊发育和再生过程中基因调控方式的研究进展,旨在为今后人工干扰绒毛周期生长发育和分子育种提供理论依据,同时也为皮肤毛囊相关疾病的临床治疗提供新思路。
- 江玮范一星乔贤张燕军刘志红赵艳红王瑞军王志新张文广苏蕊李金泉
- 关键词：毛囊转录组小鼠
- 内蒙古绒山羊角间距对重要经济性状的相关性研究
- 张磊苏蕊乔贤范一星李晓凯王凤红张燕军刘志红王瑞军王志英李金泉
- 羊角相关基因定位的研究进展
- <正>引言/目的羊角是牛科动物的重要表型特征之一,由常染色体等位基因控制,表现为有角、无角和多角、畸形。已有的研究中表明角与羊的繁殖性状、性行为、驯化选择等相关。随着分子标记和高通量测序技术的发展,全基因组水平的选择信号...
- 张磊李晓凯乔贤范一星王志新王志英王瑞军刘志红张燕军苏蕊李金泉
- 关键词：羊角基因定位表型选择经济性状
- 文献传递
- 内蒙古绒山羊羊绒细度性状全基因组关联分析
- <正>引言/目的内蒙古绒山羊是经过长期的自然选择和人工选育而形成的地方良种,因其绒细、产绒量高、纺织性能好等特性享有'纤维宝石'和'软黄金'的美誉。山羊绒细度性状是一个综合的数量性状,由微效多基因调控。全基因组关联分析(...
- 乔贤李晓凯范一星张燕军刘志红王瑞军王志英王志新苏蕊李金泉
- 关键词：绒山羊遗传育种羊绒细度全基因组关联分析
- 文献传递
