石俊霞
- 作品数：3 被引量：36H指数：1
- 供职机构：西南大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金博士科研启动基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 基于转录组数据的两种书虱SSR位点筛选及分析
- 微卫星又称为简单重复序列(Single Sequence Repeats,SSR),由于具有高度的多态性和杂合度、呈孟德尔共显性遗传、选择中性、检测快速方便等特点,使其成为一种极为有效的分子标记而广泛应用于动植物品种鉴定...
- 张夏瑄石俊霞李婷魏丹丹王进军
- 关键词：微卫星转录组书虱分子标记高通量测序
- 基于转录组数据的两种书虱SSR位点筛选及分析
- 微卫星又称为简单重复序列(Single Sequence Repeats,SSR),由于具有高度的多态性和杂合度、呈孟德尔共显性遗传、选择中性、检测快速方便等特点,使其成为一种极为有效的分子标记而广泛应用于动植物品种鉴定...
- 张夏瑄石俊霞李婷魏丹丹王进军
- 关键词：微卫星转录组书虱分子标记高通量测序
- 基于转录组数据的桔小实蝇微卫星位点信息分析被引量：36
- 2014年
- 以桔小实蝇为材料,从其转录组数据库中筛选功能微卫星(EST-SSR)序列,并进行SSR位点的信息分析.共获得1890个EST-SSR位点,可用于引物设计的SSR数为1296个.EST-SSR平均分布频率为1/10.21 kb,但这种分布频率在不同重复类型SSR之间相差很大.其中,三碱基重复SSR在该种昆虫的EST-SSR中出现的频率最高,结合其他文献推断三碱基重复可能是所有昆虫EST-SSR的优势类型.本文共设计了42对桔小实蝇EST-SSR引物,其中有18对引物可以扩增得到预期大小的条带.最后,探讨了基于转录组数据发掘昆虫SSR的前景和挑战,以及进行转录组EST-SSR筛选时应注意的问题.
- 魏丹丹石俊霞张夏瑄陈世春魏冬王进军
- 关键词：微卫星转录组高通量测序实蝇
