牛军
- 作品数:2 被引量:7H指数:2
- 供职机构:淮海工学院海洋学院更多>>
- 发文基金:江苏省高校自然科学研究项目江苏省自然科学基金中央财政支持地方高校发展专项资金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 一株抗菌海洋真菌的筛选、鉴定与发酵条件优化被引量:2
- 2015年
- 从专性海洋真菌中筛选具有抗菌活性的菌株,并对其发酵条件进行优化.以Escherichia coli,Bacillus pumilus,Fusarium graminearum和Saccharomyces cerevisiae作为指示菌,利用管碟法从10株专性海洋真菌中筛选抗菌活性菌株,获得1株对革兰氏阳性细菌、革兰氏阴性细菌及多种植物病原真菌均有拮抗作用的菌株COF01,通过形态学与18SrDNA-ITS序列分析将该菌株鉴定为黑曲霉(Aspergillus niger);采用单因素试验和正交试验优化菌株产抗菌物质的发酵条件为玉米粉20g/L、黄豆粉15g/L、NaCl 3g/L,海水配制,在此条件下,发酵液粗提物对Fusarium vasinfectum抑菌圈直径达到(43.79±2.82)
- 牛军刘姝房耀维王淑军吕明生焦豫良潘建梅金志勇王思达朱晓杰
- 关键词:抗菌发酵优化
- 海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组新颖PKS和NRPS基因簇的发掘被引量:5
- 2014年
- 利用基因组发掘技术,从海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组序列中发掘新颖PKS和NRPS基因簇,并初步预测基因簇对应产物,为新颖聚酮化合物的发现,基因簇的异源表达和利用组合生物合成技术对化合物结构进行改造提供信息。在利用anti SMASH对S.arenicola CNS 205和S.arenicola CNP193次级代谢产物基因簇进行预测,并经过NRPS-PKS knowledgebase验证的基础上,以S.arenicola CNS 205基因簇为对照,初步选择新颖基因簇;进一步用NCBI Blast和Nap Dos分析判断基因簇的新颖性后获得3个新颖基因簇:基因簇7,基因簇10和基因簇20。结合anti SMASH对基因簇核心结构的预测和与已知功能同源性基因簇,NCBI Blast比对的同源序列,以及Nap Dos对个基因簇中KS domain和C domain的进化分析等信息,初步表明基因簇7和基因簇20的对应产物分别为烯二炔类和有半胱氨酸及其他氨基酸参与合成的肽类化合物。由于基因簇10得到的信息较少,不能预测其代谢产物。
- 房耀维刘姝王淑军吕明生焦豫良陈国强潘建梅牛军