翟云清
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：郑州轻工业学院计算机与通信工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金河南省教育厅科学技术研究重点项目博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 基于集成学习和基因本体标注库的细胞凋亡蛋白亚细胞位置预测
- 2016年
- 针对目前凋亡蛋白的亚细胞定位预测精度不高的问题,提出了基于集成学习和基因本体(GO)标注库的细胞凋亡蛋白亚细胞位置预测方法.该方法采用凋亡蛋白及其同源蛋白的GO特征,结合两层集成策略,预测凋亡蛋白的亚细胞位置.在第一层,依据不同同源蛋白个数生成多个特征向量集合,选取距离权重K近邻分类器作为个体分类器,训练多个子预测模型,并以多数投票的方式集成.在第二层,将第一层的集成模型作为子预测模型,以多数投票的方式集成不同近邻个数预测模型.Jackknife检验结果表明:该方法在CL317凋亡蛋白数据集上预测准确率达到96.2%,优于其他方法;此外,还有效降低了数据不均衡带来的影响.
- 王晓李辉翟云清
- 关键词：亚细胞定位同源蛋白
- 基于多标记学习的人类蛋白质亚细胞多位置预测
- 2018年
- 细胞被认为是组成生物体机能的最小单位,而蛋白质是组成细胞的生物大分子,在生物体的生命活动中起着至关重要的作用.给定一个蛋白质序列,预测它在哪一个具体的细胞器工作,如细胞膜、线粒体等,该方法称为蛋白质亚细胞定位.预测蛋白质亚细胞定位是了解其功能和确定药物靶点的必要步骤.现有的预测方法只能预测单个蛋白质的亚细胞位置,本文致力于预测多位点的蛋白质亚细胞位置预测,基于含有3 077个凋亡蛋白的数据集,提取其GO特征并使用LIFT_PCC算法进行预测,实验结果表明该方法整体精度达到了59.36%,并通过了性能测试,这表明该方法将成为一个非常有用的高通量工具.
- 翟云清翟胜楠
- 关键词：亚细胞定位同源蛋白
