欧阳依娜
- 作品数：11 被引量：26H指数：3
- 供职机构：云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省应用基础研究基金云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 云南3个地方鸡群体mtDNA D-loop遗传多样性分析被引量：15
- 2015年
- 他留乌骨鸡、兰坪绒毛鸡和武定鸡为分布于云南西北部和中部地区的优良地方鸡遗传资源。本研究采用mt DNA母系遗传标记,对这3个地方鸡的群体遗传变异进行了检测和遗传多样性分析。在他留乌骨鸡中检测到33个核苷酸变异位点,共定义16种单倍型,单倍型多样度为0.855±0.036,核苷酸多样度为0.017 15±0.000 58,群体内遗传距离为0.018±0.004;在兰坪绒毛鸡中发现18个核苷酸变异位点,共定义7种单倍型,单倍型多样度为0.545±0.079,核苷酸多样度为0.004 65±0.001 29,群体内遗传距离为0.005±0.001;在武定鸡中观测到36个变异位点,共定义26种单倍型,单倍型多样度为0.922±0.018,核苷酸多样度为0.015 34±0.000 80,群体内遗传距离为0.016±0.003。单倍型中介网络分析显示:他留乌骨鸡和武定鸡均包含A,B,E,F,G和H等6个母系世系,但各世系的构成比存在较大差异:他留乌骨鸡中A,B,E,F,G和H世系的构成比为35.19%,5.55%,5.55%,16.67%,27.78%,9.26%,而在武定鸡中却为34.72%,22.22%,12.50%,12.50%,15.28%,2.78%;兰坪绒毛鸡仅含有A,F和G等3个世系,构成比为2.13%,89.36%,8.51%,云南土著鸡血统占97.87%,主要由F世系构成。上述结果揭示云南3个地方鸡群体存在较大遗传分化,他留乌骨鸡和武定鸡群体变异丰富,兰坪绒毛鸡群体变异较为贫乏,但其母系遗传组成独特。本研究结果支持家鸡多个母系起源的论点。
- 苗永旺孙利民王素芳欧阳依娜张永云袁峰和四池李庆量
- 关键词：武定鸡MTDNA
- 牛乳蛋白合成调控机制的研究进展
- 乳蛋白是乳中最重要的组分,提高乳蛋白的合成效率是奶产业的主要任务之一。乳蛋白的合成是多基因共同作用的结果,并受到日粮营养水平与营养素组成、环境因素和奶牛生理状态等因素的影响。在过去几十年,乳脂合成的调控研究受到了很大的关...
- 欧阳依娜苗永旺
- 文献传递
- 雉鸡微卫星DNA标记筛选及孔雀绿雉鸡群体遗传变异分析被引量：2
- 2014年
- 利用33个家鸡微卫星DNA标记对孔雀绿雉鸡基因组DNA进行种间扩增,筛选可用于雉鸡群体分析的遗传标记.共筛选出能扩增出特异性条带的7对引物,具有较丰富的多态性,分别是MCW0294,MCW0285,MCW0328,MCW0134,MCW0330,MCW0097,LEI0075.利用这7个遗传标记对孔雀绿雉鸡选育的母本群体（P）——美国七彩山鸡及其F3和F8群体进行群体变异检测.结果表明：各基因座位的等位基因数为2～4个;P,F3和F8群体平均期望杂合度分别为0.52,0.59,0.53,平均多态信息含量分别为0.438 8,0.505 2,0.461 2;F8与P群体Nei氏遗传距离为0.015 8,与F3群体之间Nei氏遗传距离为0.123 4.结果显示孔雀绿雉鸡F8群体与美国七彩山鸡亲缘关系更近,血统较纯,说明选育有一定效果.
- 高姗姗付琳袁峰欧阳依娜唐正红普丽萍田应华钱林东赵跃李石友苗永旺
- 关键词：雉鸡微卫星DNA
- 水牛SLC1A1基因的分离鉴定,组织表达谱及编码区多态性分析
- 氨基酸转运载体是介导氨基酸跨膜转运的膜蛋白，在哺乳动物细胞中广泛存在.SLC1A1基因作为普通奶牛乳蛋白合成的重要功能候选基因，在水牛上还未见研究报道.本文采用电子克隆及RT-PCR方法对水牛SLC1A1基因进行了分离鉴...
- 付琳欧阳依娜苗永旺
- 关键词：水牛克隆鉴定组织表达谱编码区
- 水牛FASN基因外显子37多态性及其生物信息学分析
- 2014年
- [目的]脂肪酸合成酶(Fatty acid synthase,FASN)是影响哺乳动物脂肪酸合成的关键酶,但有关水牛FASN基因的群体遗传组成特征还不清楚。[方法]本研究采用PCR产物直接测序法和PCR-SSCP方法对88头河流型和122头沼泽型水牛、54头牦牛和40头大额牛FASN基因外显子37进行群体变异检测,并结合已发表的牛科物种序列进行生物信息学分析。[结果]结果表明,仅在水牛中发现2个SNP位点,为c.6363C>T和c.6372C>T,均为同义替换。河流型和沼泽型水牛共享这2个SNP位点,但它们在两类水牛中的群体遗传组成不同。确定水牛特有的核苷酸位点3个,即c.6183A,c.6255T和c.6394A,其中c.6394A导致水牛FASN蛋白第2132位氨基酸与其它牛科物种不同,在水牛中为M而其它牛科物种中为V;山羊特有的位点2个,为c.6189A和c.6267T。普通牛、山羊和绵羊中具有异义替换SNP位点,分别为1个、3个和7个。普通牛的异义替换SNP位点c.6365G>A对蛋白质功能影响不显著(subPSEC>-3);山羊的这些异义替换SNP位点c.6296T>C、c.6301C>T和c.6341T>C对其蛋白质功能影响均有显著影响(subPSEC<-3);绵羊7个异义替换SNP位点中的2个,即c.6286A>C和c.6406A>G对FASN功能有显著影响(subPSEC<-3)。[结论]这些核苷酸差异引起的氨基酸差异可能引起不同牛科物种间FASN功能的差异。
- 江明星哈福付琳袁峰欧阳依娜张慧芳苗永旺
- 关键词：水牛多态性SNPS
- 利用细胞色素b(Cyt b)基因分析绿孔雀和蓝孔雀的遗传分化被引量：1
- 2009年
- 采用PCR产物直接测序法测定了10只绿孔雀和5只蓝孔雀的mtDNA细胞色素b基因516 bp序列,结合已发表的孔雀细胞色素b基因序列数据进行了序列比较分析;以雉鸡和家鸡的同源序列为外群,采用NJ法和ME构建了系统发育树。结果表明蓝孔雀群体内遗传差异程度低于绿孔雀,绿孔雀和蓝孔雀之间的核苷酸差异的平均数为21.417,净遗传距离为0.039±0.01,推断出绿孔雀与蓝孔雀的分化时间至少为2.96百万年,从而在分子水平揭示出绿孔雀和蓝孔雀属于两个不同的物种。重建的系统树将所有序列聚为支持率较高的绿孔雀与蓝孔雀2大类群,显示云南的绿孔雀至少存在两种类型,且这两种类型可能达到了亚种分化水平,而白孔雀和杂色孔雀在分类上则属于蓝孔雀类群。
- 欧阳依娜杨泽宇李大林霍金龙钱坤苗永旺
- 关键词：绿孔雀蓝孔雀遗传分化细胞色素B基因系统进化
- 水牛瘦素受体基因密码子使用偏好性分析
- 2017年
- 试验选取27头河流型水牛和41头沼泽型水牛,以从NCBI数据库中下载的家牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对编码瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因的密码子偏好性及水牛与其他物种间密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果发现,所有的密码子在河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因中均有使用,两种类型水牛偏好使用的密码子有28个,其中使用偏好性较强的密码子为AGA(RSCU≥2),表明河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因密码子使用特征相似。水牛及参考物种LEPR基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但水牛与其他参考物种间偏好使用密码子的种类和数目有差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型水牛与沼泽型水牛亲缘关系最近,先聚为一类,然后与家牛、野牦牛和野牛聚为一类,再与绵羊、山羊、小鼠和人等物种聚为一类。在密码子使用频率上,河流型水牛LEPR基因与酵母密码子偏好性差异小于与大肠杆菌和小鼠密码子偏好性差异,从而揭示酵母更适合作为水牛LEPR基因的外源表达系统。
- 范新阳欧阳依娜王鹏武张永云滕晓红苗永旺
- 关键词：河流型水牛沼泽型水牛
- 大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡mtDNA D-loop遗传多样性分析被引量：8
- 2017年
- 大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡是近年在云南发现的地方鸡遗传资源,具有优良的种质特性,为了阐明其群体遗传背景,采用mtDNA D-loop区序列为遗传标记,对采自3个地方鸡的共257个样品进行了检测分析。结果表明:大围山微型鸡、云龙矮脚鸡和拉伯高脚鸡的单倍型多样度分别为0.083±0.018、0.851±0.029和0.784±0.039;核苷酸多样度分别为0.014 67±0.000 45、0.013 42±0.000 80、0.011 66±0.001 55;群体内遗传距离分别为0.014±0.003、0.014±0.003、0.012±0.003。中介网络分析显示:本研究检测的257个样品分布在A、B、C、D、E、F和G等7个世系中,其中大围山微型鸡包含A、B、C、D、E、F和G等7个世系,B、D世系为其主要世系;云龙矮脚鸡包含A、B、C、E、F和G等6个世系,E世系为其主要世系;拉伯高脚鸡包含A、B、E和G等4个世系,G世系为其主要世系。AMOVA分析表明:3个群体间遗传分化指数(Fst)分别为0.120 84、0.239 46、0.263 68(P<0.01),群体内遗传变异占80.61%,群体间变异为19.39%(P<0.01)。本研究结果揭示3个地方鸡群体遗传多样性较丰富,都含有多个母系血统,支持家鸡多个母系起源的观点,但它们之间存在较大的遗传分化。
- 欧阳依娜阮谦钱林东孙利民张永云滕晓红苗永旺
- 关键词：MTDNAD-LOOP遗传分化
- 固醇调节元件结合蛋白(SREBPs)调控牛科物种脂合成的研究进展
- 2022年
- 固醇调节元件结合蛋白(sterol regulatory elemental binding protein,SREBPs)是细胞核内调控脂代谢的重要转录因子,其在细胞核内通过结合下游靶基因调控区的顺式作用元件来参与转录过程,进而调控脂代谢,包括调控体脂的沉积和乳脂的合成。本文综述了SREBPs的结构与功能、SREBPs参与的生物学路径、SREBP1参与牛科物种体脂沉积和乳脂合成的研究进展,旨在为牛SREBPs的深入研究提供参考。
- 刀文彬欧阳依娜哈福哈福
- 关键词：固醇调节元件结合蛋白
- 大河猪76个STR基因座的遗传多态性被引量：5
- 2009年
- 大河猪是中国西南中海拔地区代表性猪种之一,长期以来在当地养猪生产中发挥了重要作用。为了阐明其群体遗传变异情况,为进一步有效保护和合理利用提供科学依据,采用分布在家猪19对染色体上的76个微卫星标记对该猪种60个随机抽样个体进行了微卫星PCR–聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。共检测到347个等位基因,所有座位都呈现出多态性,每个座位的等位基因数在3—10个之间,平均每个座位等位基因数4.57个,有效等位基因数3.50个,群体平均杂合度及平均多态信息含量分别为0.6962±0.0716和0.6441±0.0914。结果表明,大河猪群体遗传多样性较丰富,选择潜力较大。
- 霍金龙霍海龙苗永旺李福泉刘丽仙伍革民欧阳依娜钱坤
- 关键词：微卫星标记大河猪杂合度多态信息含量
