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阮鹏

作品数:3 被引量:6H指数:1
供职机构:浙江大学动物科学学院更多>>
发文基金:国家科技支撑计划更多>>
相关领域:农业科学环境科学与工程更多>>

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 2篇农业科学
  • 1篇环境科学与工...

主题

  • 2篇基因
  • 2篇基因组
  • 1篇地方猪
  • 1篇地方猪种
  • 1篇遗传多样性分...
  • 1篇遗传多样性研...
  • 1篇全基因
  • 1篇全基因组
  • 1篇全基因组关联...
  • 1篇猪种
  • 1篇基因组测序
  • 1篇嘉兴黑猪
  • 1篇黑猪
  • 1篇候选基因
  • 1篇繁殖
  • 1篇繁殖性
  • 1篇繁殖性状
  • 1篇SNPS
  • 1篇FDR
  • 1篇GWAS

机构

  • 3篇浙江大学
  • 1篇浙江省畜牧技...

作者

  • 3篇阮鹏
  • 2篇郭晓令
  • 2篇陈究成
  • 1篇徐宁迎
  • 1篇黄敏婕

传媒

  • 1篇中国畜牧杂志
  • 1篇浙江畜牧兽医

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2017
  • 1篇2016
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
浙江省3个地方猪种繁殖性状的全基因组关联分析被引量:5
2018年
本研究使用全基因组关联分析(GWAS)技术对嵊县花猪(SXHZ)、金华猪(JHZ)和淳安花猪(CAHZ)繁殖性状关联性强的SNP位点进行定位,寻找可能影响这些性状的基因。采集SXHZ 114头、JHZ 185头和CAHZ 31头血样制成干血斑样本,提取DNA将质检合格的样品用Illumina平台的GGP Porcine50K SNP芯片作基因型判定。繁殖性状数据来自各取样猪场。对SNP标记和样本进行质控,筛选合适数据作GWAS分析,定位出显著位点,在Ensembl和NCBI上寻找候选基因。结果表明:SXHZ独立GWAS有160个SNPs呈FDR校正水平显著;JHZ独立GWAS有124个SNPs呈FDR校正水平显著;经过META分析得到337个SNPs呈FDR校正水平显著,16个SNPs呈Bonferroni校正染色体水平显著;CAHZ的独立GWAS由于样本量小,初步分析的结果可靠性不高。初步筛选出SXHZ的候选基因为SEMA4D、EYA4、ZC3H12D、BANP、DIP2B和TUSC3;JHZ的候选基因为SPINK14、GRIP1和PPP3CA;META分析得出候选基因PACSIN2、ATP8A2、ZNF32、CTNNA2和FAT1,为进一步筛选繁殖性状的主效基因提供基础和参考。
阮鹏黄敏婕郭晓令徐宁迎
关键词:繁殖性状GWAS候选基因
基于简化基因组测序嘉兴黑猪的遗传多样性分析被引量:1
2017年
试验评估采集嘉兴黑猪血样89例,其中公猪21例,母猪68例,利用GGRS简化基因组文库技术,共检测出SNP位点108603个,经过滤筛选后共获位点48408个,具有多态性的位点占比为0.99,通过计算得到AR为1.9,HE为0.324,群体内的平均遗传距离为0.136±0.01。
阮鹏陈究成徐宁迎章晓伟刘雅莉
关键词:基因组测序嘉兴黑猪
淳安花猪遗传多样性研究
引言 淳安花猪属皖浙花猪,是国家级保护猪种,为从分子水平了解淳安花猪群体的保种现状,本研究从淳安县茅山淳安花猪种业有限公司采集了59头淳安花猪,其中公猪9头,母猪50头,采集耳组织样装入盛有乙醇的1.5 ml离心管中运回...
阮鹏陈究成郭晓令徐宁迎
关键词:SNPS
共1页<1>
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