罗蔚
- 作品数:14 被引量:97H指数:6
- 供职机构:广西中医药大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基于microRNAs组学的丹参酮ⅡA对心肌缺血损伤大鼠骨髓间充质干细胞影响被引量:1
- 2021年
- 目的应用miRNA表达芯片筛选丹参酮ⅡA干预骨髓间充质干细胞分化过程中差异表达的miRNA,并对其进行生物信息学分析,揭示心肌缺血的机制。方法制备心肌缺血损伤大鼠模型并提取骨髓间充质干细胞进行培养,使用丹参酮IIA含药血清干预,以生理盐水做阴性对照,两组均置培养箱中孵育24 h后去掉两组的培养液,以DMEM培养基进行连续2次洗涤及培养,换液后诱导分化7 d、14 d、28 d,然后运用TRIzol法提取大鼠BMSCs中总RNA,使用GenePix Pro 6.0表达谱芯片检测细胞miRNA的表达,接着对预测靶基因进行GO分析、KEGG通路分析、VISANT、STRING数据库分析蛋白相互作用。结果 (1)层次聚类分析提示有17个miRNA差异表达,其中8个上调、9个下调。(2)运用8个基因预测数据库交集分析确定靶基因49个,GO分析发现这些靶基因主要参与27种生物学过程、1种细胞组分、8类分子途径;KEGG通路发现有5条信号转导通路。(3)运用VISANT检索与靶基因相互作用的蛋白产物,发现节点(Nodes)86个,路径映射(Pathway Mapped)17个,节点的功能种类包括28类;STRING软件总共筛选出14个靶基因的蛋白产物存在相互作用,构建靶基因互作网络图。结论 (1)丹参酮ⅡA可干预心肌缺血损伤大鼠骨髓间充质干细胞miRNA的表达。(2)通过预测miRNA的差异miRNAs可知,经转录后的miRNAs表达主要由信号传导通路、miRNA转录与调控发挥作用。(3)生物信息学GO富集及KEGG通路后提示miRNAs与心肌的分化、再生有关系,挖掘的靶基因CXCR4、Bcl-XL、VEGFa及Rap1信号通路、Ras信号通路均能影响心肌缺血。
- 伍燕宏郑景辉马晓聪李建橡罗蔚朱梓铭
- 关键词:MIRNA心肌缺血骨髓间充质干细胞生物信息学
- 真武汤加减治疗慢性心力衰竭Meta分析被引量:2
- 2019年
- 目的:系统评价真武汤加减治疗慢性心力衰竭的临床疗效。方法:计算机检索中国知网、维普数据库、万方数据库、Pub Med、Embase等数据库进行系统检索,搜集真武汤加减治疗慢性心力衰竭相关的随机对照实验。通过收集、汇总纳入研究原始数据,采用Rev Man5. 3软件进行Meta分析。结果:共纳入符合要求的RCT文献27篇,真武汤治疗慢性心力衰竭试验组治疗效果优于对照组[OR=3. 95; 95%CI(3. 10,5. 04); P=1. 00],治疗后试验组中医证候较对照组中医证候明显改善[OR=3. 80; 95%CI(2. 42,5. 96); P=0. 59],治疗后试验组左心室射血分数较对照组左心室射血分数明显改善[MD=0. 98; 95%CI(0. 86,1. 09); P <0. 000 01]。结论:真武汤加减治疗慢性心力衰竭疗效显著,且安全性好。
- 伍燕宏郑景辉罗蔚朱梓铭
- 关键词:慢性心力衰竭真武汤加减META分析《伤寒论》
- 基于系统药理学的麻黄细辛附子汤治疗缓慢型心律失常的作用机制研究被引量:9
- 2019年
- 目的基于系统药理学方法探究麻黄细辛附子汤治疗缓慢型心律失常的作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)和PharmMapper数据库筛选出麻黄细辛附子汤的有效成分和作用靶点,并构建成分-靶点网络,然后利用OMIM、GeneCards、CTD数据库筛选缓慢型心律失常的相关靶点,通过Draw Venn Diagram网站进行交集比对,获取麻黄细辛附子汤作用于缓慢型心律失常的相关靶点;然后利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用Cytoscape进行网络靶点特性分析,并在Systemsdock数据库进行系统分子对接。结果筛选出了51个满足条件的药物有效成分及其263个作用靶点,566个缓慢型心律失常相关的疾病靶点,交集靶点共14个。GO分析得到63个相关生物过程,6项分子功能,10类细胞组成;KEGG通路富集筛选得到5条重要的信号通路;各分子与靶点之间有较好的结合活性。结论麻黄细辛附子汤可能是通过唾腺分泌、心肌细胞的肾上腺素能、cGMP-pkg信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路来发挥对缓慢型心律失常的治疗作用。
- 罗蔚郑景辉徐文华伍新诚李建橡
- 关键词:麻黄细辛附子汤缓慢型心律失常信号通路
- 基于GEO数据库对原发性高血压的差异靶基因分析
- 2018年
- 目的:初步探索分析原发性高血压的差异靶基因,为原发性高血压的治疗提供新的靶点。方法:从GEO公共数据库中检索高血压的数据芯片,利用GEO2R在线分析公共的差异表达基因,分别对差异表达基因和预测靶基因进行GO富集分析及KEGG通路分析。结果:(1)GEO2R在线分析成功筛选出147个差异microRNA,由logFC统一标识后得出16个关键microRNA,其中下调microRNA共3个,上调microRNA共13个。运用Metascape软件对microRNAs富集及KEGG热图分析,同时得出关键microRNA有2个,分别是:mir133a、mir31;(2)差异microRNA导入mirTarBase后,最终发现共有66个差异预测靶基因,通过David6.7在线分析富集得出关键基因,主要调控细胞内凋亡信号通路对DNA损伤的反应、血管生成、信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正、负调控、细胞膜内陷、蛋白质heterodimerization活动等方面。结论:(1)利用生物信息学能有效地分析基因芯片数据,获取生物的内在信息,为下一步实验提供有力的证据;(2)差异microRNA基因表达及预测靶基因的表达主要以信号通路传导方式为基础,这为治疗高血压提供了新的诊疗依据,同时也为后期的靶向治疗奠定了基础。
- 伍燕宏郑景辉罗蔚朱梓铭
- 关键词:原发性高血压生物信息学基因芯片
- 基于网络药理学方法研究枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的作用机制被引量:11
- 2019年
- 目的通过网络药理学方法,对枳实薤白桂枝汤治疗冠心病的作用机制进行研究。方法收集枳实薤白桂枝汤中5味药的有效化合物,预测这些化合物对冠心病的作用靶点,对这些靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图构建、基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG通路注释分析,将这些化合物与靶点进行分子对接。结果枳实薤白桂枝汤共收集到51个有效化合物,作用于31个冠心病相关靶点,PPI网络图显示ALB、ACE、REN、F2、NOS3、MAPK1、MMP9、MMP2、PPARG、SELE为10个联系最多的靶点,联系最密切的3组靶点为凝血组、斑块稳定组、其他保护组。GO富集分析显示出76个生物过程、26个分子功能、14个细胞成分,通路注释分析显示出19条通路,155组分子对接结果显示91组具有较好的结合活性。结论枳实薤白桂枝汤治疗冠心病具有多成分、多靶点的特点,可能通过抗凝血、稳斑块、抗氧化、抗炎症、降血脂、抑制RASS系统、增加NO保护、促进雌激素保护8个方面发挥治疗冠心病的作用。
- 赵阳郑景辉徐文华赵新望伍燕宏罗蔚朱梓铭
- 关键词:枳实薤白桂枝汤冠心病胸痹网络药理学分子对接
- 基于iTRAQ技术的安胃汤干预胃溃疡肝郁脾虚证大鼠蛋白质组学研究被引量:10
- 2019年
- 目的应用iTRAQ蛋白组学技术鉴定筛选安胃汤干预胃溃疡肝郁脾虚证大鼠胃黏膜细胞的差异表达蛋白,初步探讨安胃汤干预胃溃疡肝郁脾虚证大鼠的分子作用机制。方法采用乙酸法配合多因素复合模拟中医病因制备胃溃疡肝郁脾虚证大鼠模型,提取胃黏膜原代细胞进行培养,制备安胃汤含药血清对其进行干预,采用iTRAQ技术鉴定筛选差异蛋白。通过DAVID、KEGG、VISANT和STRING数据库对差异蛋白进行注释、富集分析、信号转导通路分析和蛋白质相互作用分析,并对其中的关键蛋白通过Western Blot实验进行验证。结果安胃汤组与对照组之间共有59个差异表达蛋白,生物信息学分析显示其主要参与53种生物学过程,10种细胞组分,16类分子途径,以及74条信号转导通路;Western Blot验证实验结果与iTRAQ蛋白组学结果基本一致。结论基于iTRAQ蛋白组学可筛选出安胃汤干预胃溃疡肝郁脾虚证大鼠胃黏膜细胞相关蛋白(Akt1、Jak1、Jak2、Plcb3、Adrb2、Stat2、Prkcg、Plcb4、Ptpn2、Chrm3及Ifngr1),初步分析提示其与胃溃疡的多种细胞生物学活动有关。
- 罗蔚唐友明韩叶芬吴德坤牛豫洁夏泽韦维郑景辉
- 关键词:安胃汤胃溃疡胃黏膜细胞肝郁脾虚证蛋白质组学
- 基于网络药理学研究川芎治疗冠心病的作用机制被引量:30
- 2019年
- 目的基于网络药理学研究川芎治疗冠心病的作用机制。方法以化合物口服药物生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,根据中药系统药理学技术平台(TCMSP)等数据库预测和筛选川芎化合物及治疗冠心病的作用靶点。然后,Cytoscape 3.5.1软件构建川芎化合物-靶点网络,String平台构建靶点蛋白相互作用网络,生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因进行GO富集分析及KEGG通路分析。结果从川芎中筛选得到7个化合物,作用于31个冠心病靶点,关键靶点包括血管性血友病因子、凝血因子2、跨膜受体蛋白1、心肌细胞增强因子2 A、超氧化物歧化酶1、氧化氮合酶2等,参与对缺氧的反应、对过氧化氢的反应、血压调节、心脏发育、凝血功能等生物过程,调节补体级联与凝血级联、缺氧诱导因子-1信号通路、过氧化物酶体等代谢通路。结论川芎可能主要通过抗氧化、抗炎、抗凝血、促进血管生成、扩张血管、调节血压等方面来治疗冠心病。
- 赵新望徐文华赵阳伍燕宏罗蔚朱梓铭郑景辉
- 关键词:川芎冠心病网络药理学
- 基于网络药理学探究养心通脉方对冠心病的作用机制被引量:6
- 2019年
- 目的:利用网络药理学技术更全面地预测养心通脉方(Yangxin Tongmai Formula,YTF)对冠心病(coronary heart disease,CHD)潜在的作用机制。方法:利用药物靶点数据库分析平台,基于化合物ADME特性筛选养心通脉方中相关活性成分,预测化合物的作用蛋白质靶点,进一步构建靶点蛋白数据集;基于Genecards数据库获取CHD高度相关蛋白靶点,构建数据集;将养心通脉方与CHD靶点数据集进行比对与分析,并基于共同靶点构建蛋白质-蛋白质互作网络(Protein-protein interaction,PPI)网络,靶点通路网络(target-pathway network)及进行生物信息学分析。结果:经分析养心通脉方中62个化合物,99个作用蛋白质靶点以及与CHD相关的20个共同靶点(占养心通脉方化合物靶点的25%)发现,相关靶点共有55个的生物学过程及39条通路被显著富集(P <0. 05),本次预测结果与养心通脉方前期已证实的成果在功效及机制上有一定契合。结论:本研究基于网络药理学通,过构建多维调控网络初步揭示了养心通脉方对CHD的作用机制,为其的临床应用提供了理论依据。
- 朱梓铭郑景辉唐友明徐文华伍燕宏罗蔚
- 关键词:养心通脉方网络药理学冠心病
- 养心通脉有效部位方干预AMI大鼠BMSCs miRNA组学分析被引量:3
- 2017年
- 目的:通过筛选差异表达miRNAs,预测和探究养心通脉方有效部位方(active principle region of Yangxing Tongmai formula,apr-YTF)诱导骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)心肌样分化的分子机制。方法:提取急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)血瘀证大鼠BMSCs并培养,使用apr-YTF含药血清诱导,以阴性对照血清做对照,提取细胞总RNAs,使用表达谱芯片检测细胞miRNAs的表达,并进行聚类分析。运用生物信息学方法预测差异miRNA调控的靶基因和功能分析。结果:芯片探测出共有26个差异miRNAs,其中8个上调,18个下调,经筛选和预测共100个靶基因参与了19种生物过程,11种细胞成分,10种分子作用。轴突导向通路,癌症转录误调节通路,AMPK信号通路被富集。rno-miR-93-5p,rno-miR-204-5p,rno-miR-128-3p为网络调控中心,其中rno-miR-204-5p下调更显著。结论:养心通脉有效部位方干预大鼠骨髓间充质干细胞心肌样分化的机制可能与rno-miR-204-5p,rno-miR-93-5p,轴突导向通路相关性较高。
- 朱梓铭郑景辉黄金龙陈建军莫云秋黄修解马晓聪张健罗蔚伍燕宏
- 关键词:MIRNA
- 中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的中英文数据库文献计量学分析被引量:1
- 2018年
- 目的:通过文献检索、共现分析和聚类分析等文献计量学分析,探讨中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的研究现状与热点,方便为该领域今后的相关研究提供参考。方法:检索中国知网和PubMed数据库中收录的中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病相关的文献,运用书目共现分析系统软件(BICOMB)、CytoScape3.6.1及SPSS软件对高频词进行共现分析和聚类分析。结果:从中国知网检索到文献116篇,频次≥3的高频词共43个,共有226对共现关系,聚类共分别出7个类别;从PubMed检索到文献44篇,频次≥3的高频词共35个,共有355对共现关系,聚类共分别出8个类别。结论:中医药干预干细胞治疗缺血性心脏病的研究在2005年之后在世界多个国家开始兴起,中药、益气温阳活血方、三七总皂苷、地黄低聚糖、丹参注射液、丹参6个方面是在中医药范围内的研究热点。
- 赵阳赵新望徐文华伍燕宏罗蔚朱梓铭郑景辉
- 关键词:中医药干细胞缺血性心脏病文献计量学