施开创 作品数:113 被引量:515 H指数:13 供职机构: 广西动物疫病预防控制中心 更多>> 发文基金: 广西省自然科学基金 广西壮族自治区自然科学基金 广西科技创新能力与条件建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 机械工程 更多>>
PEDV、TGEV、PDCoV、PRoV多重RT-PCR检测方法的建立 针对猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪Delta冠状病毒(PDCoV)和猪轮状病毒(PRoV)基因序列,分别设计特异性引物,扩增PEDVN基因(750bp)、TGEVM基因(544 bp)、... 王睿敏 施开创 黎宗强 尹彦文 谢守玉 莫胜兰 陆文俊 屈素洁关键词:猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 猪轮状病毒 多重RT-PCR 猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪圆环病毒2型共感染对外周血单个核细胞促炎细胞因子mRNA表达的影响 被引量:8 2009年 将猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)和猪圆环病毒2型(PCV2)单感染和共感染6周龄健康仔猪,采用Real-ti me PCR技术对外周血单个核细胞(PBMC)中IL-1β、IL-6、IL-8和TNF-α等促炎细胞因子的mRNA表达进行定量分析。结果表明,病毒感染后,PRRSV感染组、PCV2感染组IL-1β、IL-6、IL-8和TNF-α的mRNA表达水平均上调,其中PRRSV感染组的IL-6、IL-8显著上调,PCV2感染组的IL-6、IL-8和TNF-α显著上调;PRRSV/PCV2共感染组仅有IL-8和TNF-α的mRNA表达水平上调且差异显著;并且,PRRSV/PCV2共感染组IL-1β、IL-6和IL-8的mRNA表达水平均低于单独感染组,仅TNF-α的mRNA表达水平显著高于单感染组。结果提示,TNF-α的过量表达可能在PRRSV和PCV2协同致病机制中扮演重要角色。 施开创 杨汉春 郭鑫 邢华伟 盖新娜 陈艳红 查振林关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒 猪圆环病毒2型 共感染 外周血单个核细胞 促炎细胞因子 A型塞尼卡病毒与O型、A型、亚洲Ⅰ型口蹄疫病毒多重TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:3 2022年 为建立鉴别检测A型塞尼卡病毒(SVA)与O型、A型、亚洲Ⅰ型口蹄疫病毒(FMDV)的方法,针对SVA 3D基因与O型、A型、亚洲Ⅰ型FMDV VP1基因,分别设计特异性引物和TaqMan探针,经优化反应条件,建立了同时检测SVA与O型、A型、亚洲Ⅰ型FMDV的TaqMan荧光定量RT-PCR方法。所建立的方法能特异性扩增SVA及O型、A型、亚洲Ⅰ型FMDV,与其他主要猪源病毒无交叉反应;对SVA与O型、A型、亚洲Ⅰ型FMDV质粒标准品的检出下限分别为2.50×10^(1)、2.50×10^(2)、2.50×10^(2)、2.50×10^(2)copies/μL;组内与组间重复性试验的变异系数均小于2%。应用所建立方法检测2019年来自广西的30份临床疑似样品,SVA和O型FMDV的检出阳性率分别为20%和70%,而未能检出A型和亚洲Ⅰ型FMDV。结果表明,本研究所建立的多重荧光定量RT-PCR方法为SVA与O型、A型、亚洲Ⅰ型FMDV的临床检测和流行病学调查提供了特异、敏感、高效的技术手段。 施开创 谢守玉 赵晶 莫胜兰 刘惠心 尹彦文 司红彬 屈素洁 陆文俊 冯淑萍 粟艳琼关键词:口蹄疫病毒 荧光定量RT-PCR 猪脑心肌炎病毒SYBR GreenⅠ real-time PCR检测方法的建立 针对猪脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus,EMCV) VP1基因序列设计并合成一对引物,构建含有该引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测EMCV核酸的SYBR Green Ⅰ r... Shi-kaichuang 施开创 陈进喜 Chen-jinxi Qu-sujie 屈素洁 Xu-ruisheng 许瑞胜 Xiong-yi 熊毅 Liu-qi 刘棋 陈汉忠 Chen-hanzhon Li-gang 李刚关键词:猪脑心肌炎病毒 荧光定量PCR 病原检测 猪源脑心肌炎病毒GXLC株全基因组序列测定与分析 对猪源脑心肌炎病毒(EMCV)GXLC株进行全基冈组克隆、测序和分析。采用RT-PCR技术分段扩增基因组开放阅读框(ORF),应用3’-RACE和5’-RACE技术扩增3’-UTR和5’-UTR,分别对扩增片段进行克隆和... 施开创 屈素洁 陈进喜 许瑞胜 郑敏 刘棋 陈汉忠 李刚关键词:同源性比较 系统进化分析 猪非典型瘟病毒GX01-2018株全基因组分子特征的分析 被引量:1 2019年 猪非典型瘟病毒(APPV)被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因组全长11 565 bp,包括一个编码3 635个氨基酸的阅读框(ORF)。同源性分析显示,GX01-2018株与国内代表毒株广西GX-CH_2016株、江西JX-JM01-2018A01株、广东China/GD-SD/2016株、广东GD株核苷酸序列的同源性分别为98.2%、92.9%、83.4%、90.8%。GX01-2018株与国外代表毒株美国000515株、德国Bavaria_S5/9株、奥地利AUT-2016_C株、荷兰NL1株核苷酸序列的同源性分别为87.8%、90.7%、90.5%、90.7%。上述国内外代表毒株间Npro、Erns、E2基因核苷酸序列的同源性分别为79.1%~97.2%、83.0%~98.4%、83.1%~96.8%。基于APPV全基因组以及E2、Npro、Erns基因核苷酸序列绘制遗传进化树,获得相似的进化树图。来自广西的GX01-2018株与欧洲型毒株位于一个分支,而同样来自广西的GX04/2017株与美洲型毒株位于另一个分支。表明APPV流行毒株具有遗传多样性,来自同一地区的流行毒株出现较大的遗传变异。 尹彦文 施开创 孙文超 莫胜兰 陆文俊 屈素洁关键词:基因组序列 分子特征 2018年广西重要猪源病毒性疫病流行病学调查 被引量:14 2020年 为了解2018年广西猪群重要疫病流行情况,试验采集广西各地的病死猪组织样品及病猪腹泻拭子,应用多重实时荧光定量RT-PCR检测猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),应用多重实时荧光定量PCR检测猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪圆环病毒1型(PCV1)、猪圆环病毒2型(PCV2)及猪圆环病毒3型(PCV3),应用多重RT-PCR检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PRoV)。结果显示,所检测的694份组织样品中,CSFV、PRRSV、HP-PRRSV、PRV、PCV1、PCV2、PCV3的阳性率分别为11.10%、18.88%、7.20%、5.19%、2.45%、67.00%和5.76%;2种病原混合感染率为41.21%,3种病原混合感染率为4.32%,其中PRRSV和PCV2混合感染率最高。所检测的792份肠内容物及拭子腹泻样品中,PEDV、PDCoV、TGEV、PRoV的阳性率分别为9.72%、5.81%、1.77%和6.31%;2种病原混合感染率为5.30%,其中PEDV和PRoV混合感染率最高。结果表明,当前多种重要病毒性疫病仍在广西猪群发生和流行,并且多重感染普遍存在,应进一步加强监测和防控。 施开创 尹彦文 王孝德 谢守玉 石永胜 刘宏梅 陆文俊 屈素洁 冯淑萍 粟艳琼关键词:病毒性疫病 流行病学调查 猪瘟病毒和不同型猪繁殖与呼吸综合征病毒的多重RT-PCR检测方法的建立 被引量:1 2012年 为建立能同时检测猪瘟病毒(CSFV)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的方法,针对CSFV和PRRSV的基因序列设计3对特异性引物,第1对引物扩增CSFV毒株NS2基因508bp片段,第2对引物扩增PRRSV美洲型经典毒株和变异毒株Nsp2基因338bp/248bp片段,第3对引物扩增PRRSV欧洲型毒株ORF5基因614bp片段。经过反应条件的优化,建立了能同时检测并区分CSFV毒株和PRRSV美洲型经典毒株、变异毒株及欧洲型毒株的多重RT-PCR方法。该方法可以特异扩增CSFV和PRRSV,而与猪口蹄疫病毒(FMDV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪细小病毒(PPV)、猪圆环病毒2型(PCV-2)均无交叉反应;对CSFV和PRRSV 4种重组质粒标准品的检出下限均为1.67×103拷贝/μL。对采集的106份临床疑似病料进行检测,结果CSFV和PRRSV变异株混合阳性4份,占3.77%(4/106);CSFV阳性7份,占6.60%(7/106);PRRSV变异株阳性17份,占16.04%(17/106)。结果表明,建立的多重RT-PCR检测方法可以用于CSFV和PRRSV的临床快速鉴别诊断和流行病学调查。 莫胜兰 施开创 胡杰 邹联斌 陆文俊 李军关键词:猪瘟病毒 猪繁殖与呼吸综合征病毒 猪促炎细胞因子多重TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用 2012年 为建立及应用定量检测猪促炎细胞因子mRNA表达水平的方法,从分子水平研究脑心肌炎病毒(EMCV)的致病机制,分别构建含有猪促炎细胞因子IL-1β、IL-6、TNF-α以及管家基因β-actin基因片段的重组质粒标准品,建立了检测IL-1β/β-actin、IL-6/β-actin、TNF-α/β-actin的多重TaqMan real-time PCR检测方法。标准曲线的相关系数均达到0.998以上;初始模板的检出下限均达到10拷贝/μL;只有以目标cDNA为模板,并加入特异性引物和探针的反应才能检测到荧光信号;组内与组间的变异系数均小于2%。应用所建立的检测方法,对猪源EMCV GXLC株感染仔猪心肌中IL-1β、TNF-α、IL-6mRNA的表达水平进行检测。结果表明,所建立的多重TaqMan real-time PCR检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好,可以用于猪IL-1β、IL-6、TNF-α基因的检测及定量分析。 施开创 梁媛 陈芳芳 屈素洁 莫胜兰 李军关键词:促炎细胞因子 脑心肌炎病毒 TAQMAN探针 鸡传染性喉气管炎的研究 Ⅰ.鸡传染性喉气管炎病毒某些生物学特性的研究 Ⅱ.应用间接ELISA法检测鸡传染性喉气管炎病毒抗体的研究 施开创