刘荷 作品数:15 被引量:25 H指数:4 供职机构: 吉首大学生物资源与环境科学学院 更多>> 发文基金: 湖南省重点学科建设项目 湖南省高校科技创新团队支持计划 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 水利工程 化学工程 轻工技术与工程 更多>>
高望界土壤放线菌抗菌活性筛选及生物学特征 2016年 为了从土壤环境中筛选产生抗菌活性物质的放线菌,采用琼脂扩散法对分离自湖南省高望界自然保护区森林土壤的169株放线菌进行抗菌活性检测,采用16S RNA基因序列分析法进行系统发育分析,采用常规方法进行生物学特性研究。结果表明,有47株受试菌株的发酵产物显示抗菌活性阳性(27.8%),其中6株具有较强抗菌活性。形态观察结果表明,这6株菌株均为典型的产丝产孢放线菌,在多数培养基上生长良好,气生菌丝和孢子丝丰富。系统发育分析表明,6株菌株均属于链霉菌属(Streptomyces),归为5个物种。菌株JSM 147612、JSM 147786、JSM 147831和JSM 147846分别与链霉菌属的已知物种S.violascens(序列相似性为99.93%)、S.malachitospinus(99.65%)、S.anulatus(99.72%)和S.aureus(99.38%)系统发育关系最为密切;菌株JSM 147823和JSM 147842之间的序列相似性为99.86%,应该属于同一物种,与它们系统发育关系最为密切的是S.albidoflavus(相似性分别为99.72%和99.58%)。 程金莲 刘祝祥 易旻 刘荷 李佑稷 张丽 贺建武 陈义光关键词:放线菌 抗菌活性 系统发育 栉江珧相关细菌抗菌活性筛选及系统发育分析 被引量:2 2013年 采用8种敏感指示菌(革兰阳性和阴性菌各3株,真菌2株),利用琼脂扩散法,对分离自南海硇洲岛潮汐带栉江珧(Atrina pectinata)样品的细菌进行抗菌活性筛选,并对具有较强生物活性的菌株进行系统发育分析和生物学特征观察。结果显示,125个分离菌株中,有18株的发酵液具有抗菌活性,占受试菌种总数的14.4%,其中6株(JSM 112006、JSM 114095、JSM 114060、JSM 112019、JSM 114054、JSM 114093)具有较强的抗菌活性。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,这些活性菌株类群多样性较高,分属于4个属:菌株JSM 112006属于Marinobacter属;JSM 114095属于Halomonas属;JSM 114060和JSM 112019属于Salinivibrio属;JSM 114054和JSM 114093属于Staphylococcus属。研究结果表明,南海硇洲岛潮汐带栉江珧分离菌株中存在一定比例的抗菌活性菌株,且这些细菌具有较为丰富的类群多样性。 朱泓溢 肖建青 刘祝祥 刘荷 李洪军 贺建武 钟小娟 陈义光关键词:栉江珧 抗菌活性 系统发育分析 武陵山地区特殊生境微生物资源研究及种质库建设 刘祝祥 田向荣 贺建武 刘荷 程金莲 杨玉婷 李梦霖 陈义光德夯风景区嗜盐及耐盐菌抗菌活性筛选及生物学特征 以8个敏感菌株(革兰阳性3株、革兰阴性3株、真菌2株)作为指示菌,采用琼脂扩散法对294株分离自德夯风景区的森林、耕作及溪流等普通非盐环境(ordinary non-saline environment)土壤的嗜盐及耐盐... 刘荷 李洪军 钟小娟 程金莲 陈义光关键词:抗菌活性筛选 生物学特性 系统发育分析 武陵山地区特殊生境微生物资源研究及种质库建设 以湘鄂渝黔四省市交界的武陵山区特殊生态环境中的微生物资源为研究对象,用微生物生态学、分子生物学及多相分类方法,开展微生物多样性、种质保护和生态适应机制等基础研究,并开展这些特色微生物资源在医药、农林和环保领域的资源化利用... 刘祝祥 贺建武 刘荷 程金莲 杨玉婷 李梦霖 彭清忠 陈义光关键词:微生物多样性 种质资源库 酒鬼酒窖池酒醅芽孢杆菌的系统发育分析和胞外酶学特征 被引量:6 2018年 从酒鬼酒窖池中采集成熟酒醅样品,用纯培养法进行芽孢杆菌分离纯化,采用16S rRNA基因序列分析法进行系统发育分析,采用水解法对其胞外酶学特征进行观察。采用NA和LA培养基分离纯化得到104株细菌菌株,根据形态特征和产芽孢特征,去除部分冗余,选择28株代表性芽孢杆菌用于进一步研究。系统发育分析结果表明,这28株芽孢杆菌具有较高的类群多样性和物种多样性,属于细菌域(Bacteria)厚壁菌门(Firmicutes)的2个科(Bacillaceae、Paenibacillaceae)的3个属(Bacillus、Brevibacillus、Virgibacillus),分为10个物种。芽孢杆菌属(Bacillus)占绝对优势,共26株(92.9%);其余2株JSM161009和JSM 166025分属于枝芽孢杆菌属(Virgibacillus)和短芽孢杆菌属(Brevibacillus)。胞外水解酶学特征观察结果表明,至少产生一种酶的菌株共27株(96.4%)。其中有20株(71.4%)淀粉水解酶阳性,19株(67.9%)明胶水解酶阳性,27株(96.4%)尿素水解酶阳性,21株(75.0%)对4种吐温(20、40、60、80)之一水解活性阳性。在28株受试菌株中,有8株(JSM 161009、163010、163017、166014、167011、167021、168017、168019)水解酶谱较广。这8个菌株均属于芽孢杆菌科(Bacillaceae),其中1株(JSM161009)属于枝芽孢杆菌属(Virgibacillus),其他7株属于芽孢杆菌属(Bacillus)。 杨玉婷 黎有有 吴秋蕾 樊林 刘荷 赵湖 贺建武 刘祝祥 陈义光关键词:酒鬼酒 酒醅 芽孢杆菌 系统发育分析 胞外酶 小溪自然保护区非盐环境土壤嗜盐和耐盐菌多样性研究 从湖南小溪国家级自然保护区采集非盐环境(ordinary non-saline environment)土壤样品,用纯培养法(culture-dependent method)分离其中的嗜盐和耐盐原核生物,进而采用基于1... 陈奇辉 刘祝祥 刘荷 李洪军 钟小娟 贺建武 陈义光酒鬼酒发酵车间空气源细菌产酯酶活性菌株筛选及多样性分析 被引量:4 2015年 采用平板水解圈法(plate hydrolysis spot method)对分离自酒鬼酒发酵车间空气的细菌进行产酯酶活性菌株筛选,采用基于16S r RNA基因序列的分析方法对高酶活菌株进行系统发育多样性分析。结果表明,73个受试菌株中,有51株酯水解酶活性菌株呈阳性,占受试菌株的69.9%。其中有9株(JSM 2215018、JSM 2215021、JSM2215027、JSM 2215104、JSM 2215109、JSM 2215116、JSM 2215117、JSM 2215126、JSM 2215132)具有较强的酯酶活性。系统发育分析表明,这9株菌属于细菌域(Eubacteria)的4个大的系统发育类群(Actinobacteria,DeinococcusThermus,Firmicutes,Proteobacteria)的8个科(Bacillaceae,Deinococcaceae,Microbacteriaceae,Micrococcaceae,Moraxellaceae,Nocardiaceae,Rhodobacteraceae,Xanthomonadaceae)的8个属:JSM 2215018属于Microbacterium属;JSM 2215021属于Arthrobacter属;JSM 2215027属于Bacillus属;JSM 2215104属于Xanthomonas属;JSM 2215109属于Deinococcus属;JSM 2215116属于Acinetobacter属;JSM 2215117和JSM 2215132属于Paracoccus属;JSM2215126属于Rhodococcus属。研究结果表明,酒鬼酒发酵车间空气源细菌存在较高比例的产酯酶菌株,且这些菌株具有较高的类群多样性。 刘荷 黎有有 程金莲 樊林 钟小娟 余冰 李洪军 刘祝祥 陈义光关键词:微生物 系统发育分析 硇洲岛潮汐带牡蛎相关可培养细菌多样性 被引量:5 2013年 【目的】了解南海硇洲岛潮汐带香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)相关可培养细菌的多样性。【方法】应用纯培养法分离样品中的细菌(含放线菌),采用基于16S rRNA基因序列的系统发育分析方法研究这些分离菌株的生物多样性。【结果】用补充0–25%(W/V)NaCl的MA、MH和NA培养基从样品中分离到102株细菌,在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取74个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析。结果表明,这些菌株归为38个物种,属于4个大的系统发育类群(Gamma-Proteobacteria,Alpha-Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes)的16个科、18个属。大多数菌株属于Gamma-Proteobacteria亚门(45株,60.8%),其余依次是Firmicutes门(12株,16.2%)、Bacteroidetes门(11株,14.9%)和Alpha-Proteobacteria亚门(6株,8.1%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的有效发表种典型菌株之间(16S rRNA基因序列相似性为94.3%–99.8%)存在一定的遗传差异,其中JSM 111069可能代表Carnobacteriaceae科的潜在新属;菌株JSM 111039和JSM 111085可能分别代表Bacillus属的两个新物种,菌株JSM 111020、JSM 111072和JSM 111090可能分别代表Pseudoalteromonas、Proteus和Idiomarina属的新物种。【结论】南海硇洲岛潮汐带牡蛎中存在较为丰富的原核生物多样性,并潜藏着一定数量的微生物新类群(物种)。 肖建青 朱泓溢 刘祝祥 刘荷 贺建武 李洪军 钟小娟 李文均 陈义光关键词:香港巨牡蛎 RRNA基因 系统发育分析 细菌多样性 南海硇洲岛潮汐带栉江珧可培养细菌的系统发育多样性 被引量:2 2014年 【目的】研究南海硇洲岛潮汐带栉江珧(Atrina pectinata)样品相关可培养细菌的多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S r RNA基因序列的系统发育分析,法对样品中可培养细菌(含放线菌)的类群多样性、物种多样性和遗传多样性进行研究。【结果】用补充0–25%(质量体积比)Na Cl的MA、MH和NA培养基从栉江珧样品中分离到125株细菌。在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取90个代表性菌株进行基于16S r RNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,这90个分离菌株分属于3个大的系统发育类群(Gamma-proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteria)、6个科、10个属,可分为33个物种。优势类群为厚壁菌门(Firmicutes)(56株,62.2%)和γ-变形杆菌亚门(Gamma-proteobacteria)(31株,34.5%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异(16S r RNA基因序列相似性为95.7%–99.9%),其中有5株可能代表新的分类单元(Potential new taxa)。分析表明,菌株JSM 112024可能代表了盐单胞菌科(Halomonadaceae)的一个属一级新分类单元;菌株JSM 112019、JSM 114045、JSM 114058和JSM 114083可能分别代表盐弧菌属(Salinivibrio)、芽孢杆菌属(Bacillus)、盐单胞菌属(Halomonas)和枝芽孢菌属(Virgibacillus)的新物种。【结论】湛江硇洲岛潮汐带栉江珧中存在较为丰富的可培养细菌物种多样性和系统发育多样性,并潜藏着较多的新微生物类群(物种)。 刘荷 朱泓溢 肖建青 刘祝祥 程金莲 贺建武 李文均 陈义光关键词:栉江珧 可培养细菌 RNA基因 系统发育分析