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程金莲: 作品数：13 被引量：14H指数：3; 供职机构：吉首大学生物资源与环境科学学院更多>>; 发文基金：湖南省重点学科建设项目湖南省高校科技创新团队支持计划国家自然科学基金更多>>; 相关领域：生物学农业科学水利工程化学工程更多>>

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高望界土壤放线菌抗菌活性筛选及生物学特征: 2016年; 为了从土壤环境中筛选产生抗菌活性物质的放线菌,采用琼脂扩散法对分离自湖南省高望界自然保护区森林土壤的169株放线菌进行抗菌活性检测,采用16S RNA基因序列分析法进行系统发育分析,采用常规方法进行生物学特性研究。结果表明,有47株受试菌株的发酵产物显示抗菌活性阳性(27.8%),其中6株具有较强抗菌活性。形态观察结果表明,这6株菌株均为典型的产丝产孢放线菌,在多数培养基上生长良好,气生菌丝和孢子丝丰富。系统发育分析表明,6株菌株均属于链霉菌属(Streptomyces),归为5个物种。菌株JSM 147612、JSM 147786、JSM 147831和JSM 147846分别与链霉菌属的已知物种S.violascens(序列相似性为99.93%)、S.malachitospinus(99.65%)、S.anulatus(99.72%)和S.aureus(99.38%)系统发育关系最为密切;菌株JSM 147823和JSM 147842之间的序列相似性为99.86%,应该属于同一物种,与它们系统发育关系最为密切的是S.albidoflavus(相似性分别为99.72%和99.58%)。; 程金莲刘祝祥易旻刘荷李佑稷张丽贺建武陈义光; 关键词：放线菌抗菌活性系统发育

德夯风景区嗜盐及耐盐菌抗菌活性筛选及生物学特征: 以8个敏感菌株(革兰阳性3株、革兰阴性3株、真菌2株)作为指示菌,采用琼脂扩散法对294株分离自德夯风景区的森林、耕作及溪流等普通非盐环境(ordinary non-saline environment)土壤的嗜盐及耐盐...; 刘荷李洪军钟小娟程金莲陈义光; 关键词：抗菌活性筛选生物学特性系统发育分析; 文献传递

武陵山地区特殊生境微生物资源研究及种质库建设: 以湘鄂渝黔四省市交界的武陵山区特殊生态环境中的微生物资源为研究对象,用微生物生态学、分子生物学及多相分类方法,开展微生物多样性、种质保护和生态适应机制等基础研究,并开展这些特色微生物资源在医药、农林和环保领域的资源化利用...; 刘祝祥贺建武刘荷程金莲杨玉婷李梦霖彭清忠陈义光; 关键词：微生物多样性种质资源库

酒鬼酒制曲车间产淀粉酶细菌筛选和系统发育被引量：5: 2014年; 采用平板水解圈法对酒鬼酒制曲车间空气的细菌进行产淀粉酶活性筛选,运用基于16SrRNA基因序列的分析法对高酶活菌株进行系统发育分析.研究结果表明,65株受试菌株中,有24.6%的菌株(16株)淀粉水解酶活性呈阳性,其中有4株(JSM 2145008,JSM 2155001,JSM 2155017,JSM 2175012)产淀粉水解酶能力较强.基于16SrRNA基因序列的系统发育分析表明,这4个菌株分别属于细菌域3个大的系统发育类群中3个科的3个属.菌株JSM 2145008属于放线菌门微球菌科,与节杆菌属(Arthrobacter)的氧化节杆菌的系统发育关系最为密切,它们之间的16SrRNA基因序列相似性高达99.8%,且在系统进化树上形成一个稳定的亚分支;菌株JSM 2155001和JSM 2175012属于异常球菌——栖热菌群异常球菌科的异常球菌属(Deinococcus),分别与该属的大琼异常球菌和云威异常球菌系统发育关系最为密切(序列相似性分别为99.6%和99.9%);菌株JSM 2155017属于厚壁菌门芽孢杆菌科,与芽孢杆菌属(Bacillus)的同温层芽孢杆菌系统发育关系最为密切(序列相似性为100%),它们以极高的自展值支持(boostrap value,100%)在系统进化树上聚在一起.上述实验结果表明,酒鬼酒制曲车间空气源细菌中存在较高比例的产淀粉酶菌株,且这些菌株具有较高的类群多样性.; 李洪军樊林程金莲刘祝祥陈义光; 关键词：淀粉酶活性系统发育分析

酒鬼酒发酵车间空气源细菌产酯酶活性菌株筛选及多样性分析被引量：3: 2015年; 采用平板水解圈法(plate hydrolysis spot method)对分离自酒鬼酒发酵车间空气的细菌进行产酯酶活性菌株筛选,采用基于16S r RNA基因序列的分析方法对高酶活菌株进行系统发育多样性分析。结果表明,73个受试菌株中,有51株酯水解酶活性菌株呈阳性,占受试菌株的69.9%。其中有9株(JSM 2215018、JSM 2215021、JSM2215027、JSM 2215104、JSM 2215109、JSM 2215116、JSM 2215117、JSM 2215126、JSM 2215132)具有较强的酯酶活性。系统发育分析表明,这9株菌属于细菌域(Eubacteria)的4个大的系统发育类群(Actinobacteria,DeinococcusThermus,Firmicutes,Proteobacteria)的8个科(Bacillaceae,Deinococcaceae,Microbacteriaceae,Micrococcaceae,Moraxellaceae,Nocardiaceae,Rhodobacteraceae,Xanthomonadaceae)的8个属:JSM 2215018属于Microbacterium属;JSM 2215021属于Arthrobacter属;JSM 2215027属于Bacillus属;JSM 2215104属于Xanthomonas属;JSM 2215109属于Deinococcus属;JSM 2215116属于Acinetobacter属;JSM 2215117和JSM 2215132属于Paracoccus属;JSM2215126属于Rhodococcus属。研究结果表明,酒鬼酒发酵车间空气源细菌存在较高比例的产酯酶菌株,且这些菌株具有较高的类群多样性。; 刘荷黎有有程金莲樊林钟小娟余冰李洪军刘祝祥陈义光; 关键词：微生物系统发育分析

南海硇洲岛潮汐带栉江珧可培养细菌的系统发育多样性被引量：2: 2014年; 【目的】研究南海硇洲岛潮汐带栉江珧(Atrina pectinata)样品相关可培养细菌的多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S r RNA基因序列的系统发育分析,法对样品中可培养细菌(含放线菌)的类群多样性、物种多样性和遗传多样性进行研究。【结果】用补充0–25%(质量体积比)Na Cl的MA、MH和NA培养基从栉江珧样品中分离到125株细菌。在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取90个代表性菌株进行基于16S r RNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,这90个分离菌株分属于3个大的系统发育类群(Gamma-proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteria)、6个科、10个属,可分为33个物种。优势类群为厚壁菌门(Firmicutes)(56株,62.2%)和γ-变形杆菌亚门(Gamma-proteobacteria)(31株,34.5%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异(16S r RNA基因序列相似性为95.7%–99.9%),其中有5株可能代表新的分类单元(Potential new taxa)。分析表明,菌株JSM 112024可能代表了盐单胞菌科(Halomonadaceae)的一个属一级新分类单元;菌株JSM 112019、JSM 114045、JSM 114058和JSM 114083可能分别代表盐弧菌属(Salinivibrio)、芽孢杆菌属(Bacillus)、盐单胞菌属(Halomonas)和枝芽孢菌属(Virgibacillus)的新物种。【结论】湛江硇洲岛潮汐带栉江珧中存在较为丰富的可培养细菌物种多样性和系统发育多样性,并潜藏着较多的新微生物类群(物种)。; 刘荷朱泓溢肖建青刘祝祥程金莲贺建武李文均陈义光; 关键词：栉江珧可培养细菌 RNA基因系统发育分析

武陵山地区特殊生境微生物资源研究及种质库建设: 刘祝祥田向荣贺建武刘荷程金莲杨玉婷李梦霖陈义光

硇洲岛牡蛎相关细菌抗菌筛选及系统发育分析: 2015年; 以8个敏感菌株作为指示菌,采用管碟法对分离自湛江硇洲岛(20°52'N^20°56'N,110°33'E^110°38'E)潮汐带香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)中的72株细菌的发酵液进行抗菌筛选,并对阳性菌株进行基因组DNA提取、16S rRNA基因PCR扩增和序列测定,继而进行系统发育分析。抗菌实验结果表明,受试菌株中有23株菌的发酵产物具有抗菌活性(阳性率31.9%),其中有5个菌株(JSM 111024、JSM 111027、JSM111029、JSM 111076、JSM 111083)具有较强的抗菌活性。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,这23株菌具有较高的类群多样性和物种多样性,属于3个系统发育群/门(Alpha-Proteobacteria、Gamma-Proteobacteria、Bacteroidetes)中的8个科(Aeromonadaceae、Flavobacteriaceae、Halomonadaceae、Idiomarinaceae、Phyllobacteriaceae、Pseudoalteromonadaceae、Shewanellaceae、Xanthomonadaceae)的8个属(Idiomarina、Halomonas、Myroides、Nitratireductor、Oceanimonas、Pseudoalteromonas、Shewanella、Wohlfahrtiimonas),可分为11个物种。优势类群为Gamma-Proteobacteria亚门(14株),其中优势属为Oceanimonas属(6株);第二大类群为Bacteroidetes门(7株),都属于Flavobacteriaceae科的Myroides属。具有较强抗菌活性的5个菌株中,有4个菌株(JSM 111024、JSM 111027、JSM 111029、JSM 111083)属于Alpha-Proteobacteria亚门Phyllobacteriaceae科Oceanimonas属,而菌株JSM 111076属于Gamma-Proteobacteria亚门Aeromonadaceae科Nitratireductor属。; 肖建青樊林赵湖余冰易旻程金莲李洪军钟小娟陈义光; 关键词：抗菌活性筛选系统发育分析

发酵车间空气源细菌淀粉酶产生菌筛选及多样性分析被引量：5: 2015年; 采用平板水解圈法(plate hydrolysis spot method)对分离自酒鬼酒发酵车间空气样品的细菌进行淀粉酶产生菌筛选,运用基于16S rRNA基因序列的分析方法对高酶活菌株进行系统发育多样性分析。结果表明,73个受试菌株中,有23株为淀粉酶产生菌,占受试菌株的31.5%,其中有9株为高酶活菌。23个淀粉酶产生菌类群多样性和物种多样性较高,属于4个大的系统发育类群(Actinobacteria、Deinococcus-Thermus、Firmicutes、Proteobacteria)中的10个科(Bacillaceae、Deinococcaceae、Intrasporangiaceae、Microbacteriaceae、Micrococcaceae、Nocardiaceae、Propionibacteriaceae、Pseudomonadaceae、Rhodobacteraceae、Xanthomonadaceae)的13个属,可分为21个物种。进一步分析表明,9株高酶活菌属于细菌域(Eubacteria)的4个大的系统发育类群(Actinobacteria、Deinococcus-Thermus、Firmicutes、Proteobacteria)的7个科(Bacillaceae、Deinococcaceae、Micrococcaceae、Microbacteriaceae、Nocardiaceae、Rhodobacteraceae、Xanthomonadaceae),归属于8个属。研究结果表明,酒鬼酒发酵车间空气源细菌存在较高比例的淀粉酶产生菌,且这些菌株具有较高的类群多样性和物种多样性。; 刘荷樊林程金莲肖建青钟小娟余冰李洪军刘祝祥陈义光; 关键词：系统发育分析

武陵山地区特殊生境微生物资源研究及种质库建设: 以湘鄂渝黔四省市交界的武陵山区特殊生态环境中的微生物资源为研究对象，用微生物生态学、分子生物学及多相分类方法，开展微生物多样性、种质保护和生态适应机制等基础研究，并开展这些特色微生物资源在医药、农林和环保领域的资源化利用...; 刘祝祥田向荣贺建武刘荷程金莲杨玉婷李梦霖陈义光; 关键词：微生物多样性种质资源库

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