张冲 作品数:25 被引量:97 H指数:7 供职机构: 北京市通州区疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 北京市自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 环境科学与工程 轻工技术与工程 更多>>
2004年通州区7类食品中致病菌污染状况调查 被引量:2 2005年 目的:了解北京市通州区居民的主要消费食品中食源性致病菌污染的实际情况,寻找可能引起食源性疾病的重点食品,为准确快速查找食物中毒原因提供方法。方法:依据国标方法,对样品分别进行沙门氏菌、空肠弯曲菌、大肠杆菌O157:H7、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌、单增李斯特氏菌分离、生化及血清学鉴定。结果:共采集样品121件,有35件样品检出致病菌,6种食源性致病菌总检出率为28.93%;其中单增李斯特菌检出率为14.88%,金黄色葡萄球菌检出率11.57%,沙门氏菌检出率为7.44%,未检出大肠杆菌O157:H7、副溶血弧菌及空肠弯曲菌。生畜肉类污染最严重,其次是熟肉制品和生牛奶。通州区熟肉制品检出率高于2003年北京市的监测值。结论:食源性致病菌污染较为严重,应引起相应部门关注。 张冲 张兰荣 常欣 刘桂玲 迟复平 周景林关键词:食品 食源性致病菌 污染 北京市通州区外环境禽流感病毒的流行分布及基因特征分析 2023年 目的通过对2021—2022年北京市通州区农贸市场的外环境及相关人员标本的禽流感病毒检测结果及基因特征分析,为我市禽流感防控策略提供依据。方法2021—2022年共采集外环境及食品涂抹标本2184例,相关人员咽拭子标本124例。利用实时荧光RT-PCR法对标本进行核酸检测,采用illumina二代测序平台对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序,分析其基因特征。结果实时荧光RT-PCR核酸检测结果显示,外环境及食品涂抹标本检出2例H5N8阳性、78例H7N9阳性、177例H9N2阳性、2例H5N8和H9N2共感染、1例H7N9和H9N2共感染,124例人员标本检测结果均为阴性。对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序分析,1例H5N8病毒的HA基因属于为2.3.4.4分支,HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸(REKRRKR/GLF),2例H7N9病毒的HA基因与Yangtza river delta属于同一分支,HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸(VPKRKRTAR/GLF),均属于高致病性禽流感病毒。遗传进化树分析提示,H5N8和H7N9的HA基因与国内报道的病毒株亲缘关系较近。结论农贸市场是禽流感病毒分布的主要场所,高致病性及低致病性禽流感病毒同时空交叠感染现状,提示应加强禽流感病毒的监测防控工作及防范知识的宣传。 邹林 高翔 张冲 佟玲 刘肖 马静 杨耀武关键词:禽流感 实时荧光RT-PCR 全基因组测序 北京市通州区一起聚集性发热疫情的病原学鉴定及柯萨奇病毒A4型基因特征分析 2024年 本研究旨在对2023年7月北京市通州区发生的一起聚集性发热疫情进行病原学和基因特征研究,为相关疫情防控提供参考。本研究采用实时荧光RT-PCR对患者咽拭子标本进行肠道病毒核酸检测,并对7例肠道病毒核酸阳性分离株VP1基因进行测序和Blast型别鉴定,随后与筛选自不同国家和地区的CVA4的VP1序列的代表株进行系统发育树构建、核苷酸序列相似性及氨基酸变异位点等分析。结果显示,通州区7例肠道病毒核酸阳性标本均为柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)。通过对从NCBI公共数据库筛选的来自全球的324条CVA4的全长VP1序列构建系统发育树,发现CVA4可分为A~F 6个基因型,F基因型分为F1和F2亚型。相似性分析表明,7株分离株与CVA4 F2亚型核苷酸相似性最高,中位数为0.936(0.927~0.945),与F2亚型氨基酸相似性中位数为0.993(0.990~0.996)。因此北京市通州区此次聚集性发热疫情是由CVA4引起,属于F基因型F2亚型,提示未来工作应加强对CVA4的监测。 邹林 甄博珺 张萍 张冲 佟玲 张建明 郗璐 王建国 王芳 高翔 李仁清关键词:分子特征 2020-2022年北京市通州区呼吸道感染患者呼吸道病原体流行特征分析 被引量:13 2023年 目的调查2020—2022年北京市通州区呼吸道传染病病原体的流行特征,为临床呼吸道感染疾病的诊断治疗和疫情防控提供参考依据。方法按照呼吸道感染病例纳入标准,收集2020年1月至2022年12月,到首都医科大学附属北京潞河医院就诊的1176例呼吸道感染患者的呼吸道样本,应用多重实时荧光聚合酶链式反应技术,对29种呼吸道感染病原体的核酸进行检测和数据分析。结果1176例样本中,检出26种呼吸道传染病病原体核酸阳性,病毒和细菌总检出率34.86%(410/1176),其中单一感染病毒类病原体98例(23.90%,98/410),单一感染细菌类病原体185例(45.12%,185/410),检出大于1种病原体的混合感染127例(30.98%,127/410),其中病毒+细菌混合感染39例(9.51%,39/410)、细菌+细菌混合感染88例(21.46%,88/410);<5、5~17、18~44、45~64、≥65岁年龄组检出率分别为30.77%(24/78)、35.59(42/118)、29.06%(120/413)、36.28%(78/215)、41.48%(146/352);上呼吸道和下呼吸道样本检出率分别为25.97%(195/751)和50.59%(215/425);按样本采集时间分组,检出率前2位的月份组分别是2020年1月,检出率84.00%(21/25),2021年12月,检出率59.78%(55/92)。结论2020年1月至2022年12月北京市通州区呼吸道传染病感染病毒情况明显减少,病原体以细菌类多见,混合感染情况占比较高,混合感染主要以细菌类混合感染为主,其中重症肺炎病例混合感染情况更加复杂多样,感染率最高的细菌类病原体是铜绿假单胞菌,老年人为易感人群且男性更易感染;春秋季节为感染的高发期。 邹林 高翔 张冲 佟玲 王建国 郗璐 张建明 刘永红 彭晓旻关键词:呼吸道感染 2019—2023年北京市通州区严重急性呼吸道感染病例病原流行特征分析 2025年 目的了解2019—2023年北京市通州区严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)病例常见8种病毒病原构成及其动态变化,为呼吸道传染病防控提供依据。方法采集2019—2023年北京市通州区某哨点医院非新型冠状病毒感染的SARI病例的呼吸道样本,同时收集相关的临床和流行病学信息。使用实时荧光定量聚合酶链式反应对样本进行常见8种呼吸道病毒核酸检测及相关的流行病学分析。结果1426例SARI中,194份(13.60%)呼吸道样本至少检测出1种病毒,以单一病毒检出为主(184份,94.85%),检出前3位的病毒依次为流感病毒(influenza virus,Flu)(73份,5.12%)、呼吸道合胞病毒(41份,2.88%)和人副流感病毒(human parainfluenza virus,HPIV)(34份,2.38%);各年龄组间检出率差异有统计学意义(χ^(2)=32.785,P<0.05),0~<5岁年龄组检出率较高(22.09%,19/86);季节间检出率差异有统计学意义(χ^(2)=16.450,P<0.05),以冬季检出率较高(18.87%,80/424),呼吸道合胞病毒(6.82%)、HPIV(3.86%)和人偏肺病毒(1.14%)主要在5~<18岁的人群中检出率较高,Flu在≥60岁年龄中检出率较高(6.67%);Flu、人冠状病毒和呼吸道合胞病毒检出高峰为11月—次年4月;鼻病毒为8—9月;HPIV全年散发流行。结论2019—2023年北京市通州区SARI中病毒病原主要以Flu、呼吸道合胞病毒和HPIV为主,各病毒的流行时间和年龄组间存在差异,建议持续加强对SARI病例中呼吸道病毒的流行特征及构成变异的监测。 张冲 邹林 佟玲 刘肖 杨丽丽 高翔 王芳 张猛关键词:呼吸道病毒 通州区6类食品单增李斯特菌污染状况及分子流行病学特征调查研究 被引量:14 2007年 目的:了解通州区6类食品中单增李斯特菌的污染情况,探讨所污染菌株携带的三个毒力基因(hlyA、iap、prfA)的状况和DNA随机扩增多态性PCR分型情况。方法:依据国标方法,采用全自动微生物分析仪和API Listeria试剂条鉴定系统对样本进行单增李斯特菌分离和生化鉴定;采用聚合酶链反应检测实验菌株携带毒力因子的情况,使用随机引物PCR的方法对菌株进行分子分型。结果:从通州区共采集6类食品样品121件,检出单增李斯特菌18株,检出率为14.9%;18株实验菌株均携带单核细胞增多性李斯特菌特异的毒力因子;随机引物PCR方法将实验菌株分成6个随机引物PCR型别。结论:本区食品中单增李斯特菌污染较为严重,且毒力基因prfA、hly、iap同时存在,说明有潜在的致病能力,应引起相关部门关注;通州区在不同时间、不同地点分离的单增李斯特菌其PCR型别差别较大,有多种型别的细菌存在;也可根据PCR分型看出在食品加工过程中存在着内部污染问题。但来源不同的菌株之间PCR分型无关联,无流行趋势。 张兰荣 唐一清 甄博珺 张冲关键词:食品污染 单核细胞增生李斯特菌 毒力因子 2019—2022年北京市通州区哨点医院儿内科严重急性呼吸道感染住院病例特征分析 2024年 目的分析2019—2022年北京市通州区儿内科严重急性呼吸道感染(SARI)住院病例的病原谱及流行特征,为疾病防控提供依据。方法选取2019年1月—2022年12月首都医科大学附属北京潞河医院收治的379例SARI住院患儿为研究对象,进行回顾性分析。采集患儿鼻咽拭子、呼吸道分泌物,应用多重实时荧光聚合酶链反应(qPCR)技术检测病原种类,分析其流行病学和临床特征。结果379例SARI患儿中,男性205例,女性174例;0~5岁196例,6~10岁129例,11~15岁54例;175例患儿检测到明确病原。175例SARI病例中,由病毒引起的SARI病例最常见的病原为呼吸道合胞病毒和副流感病毒;由细菌引起的SARI病例最常见的病原为肺炎支原体和肺炎链球菌。≤5岁患儿SARI主要由病毒引起,最常见病原体为呼吸道合胞体病毒;>5岁患儿SARI主要由细菌引起,最常见病原体为肺炎支原体。自2019年起北京市通州地区≤15岁儿童开始流行肺炎支原体病原菌。结论北京市通州区≤5岁儿童需重点关注呼吸道合胞病毒感染,>5岁儿童则需要重点防控肺炎支原体感染。不同年份流行毒株不同,需针对本地优势流行毒株制订治疗方案和防控措施。 张冲 邹林 高翔 张建明 佟玲 杨丽丽 马静 刘肖 黄芳 张猛关键词:呼吸道合胞病毒 肺炎支原体 2019-2022年北京市通州区严重急性呼吸道感染住院病例病原谱分析 2024年 目的分析2019—2022年北京市通州区哨点医院严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)住院病例的病原谱及流行特征,为科学防控提供参考。方法纳入2019年1月—2022年12月北京市通州区潞河医院SARI患者,采集患者鼻咽拭子或呼吸道分泌物,荧光定量法检测病原及其种类,分析其流行病学特征。结果共纳入SARI病例1124例,其中379例呼吸道病原体阳性,检出率为33.72%。细菌的检出率较高,以肺炎支原体、肺炎链球菌和嗜麦芽窄食单胞菌为主,检出率较高的病毒为甲型流感病毒、副流感病毒和呼吸道合胞病毒。不同年龄段病例数及病原检出率差异有统计学意义(χ^(2)=555,P=0.0001)。不同年份优势检出病原体不同,2019年肺炎支原体和甲型流感病毒的检出率较高,分别为27.27%(51/187)和17.65%(33/187);2020年副流感病毒、肺炎支原体和流感嗜血杆菌的检出率较高,分别为16.67%(10/60)、11.67%(7/60)和11.67%(7/60);2021年嗜麦芽窄食单胞菌和呼吸道合胞病毒的检出率较高,分别为24.39%(20/82)和19.51%(16/82);2022年嗜麦芽窄食单胞菌和副流感病毒的检出率较高,分别为20.00%(10/50)和12.00%(6/50)。结论北京市通州区SARI病例中细菌性病原体检出率较高,需要关注嗜麦芽窄食单胞菌和肺炎支原体的流行。此外,呼吸道合胞病毒、副流感病毒、甲型流感病毒的流行也不容忽视。不同年份检出的主要病原体不同,需要针对本区的实际情况制定防控措施。本研究为国家呼吸道多病原监测方案的实施提供了基础数据。 邹林 张冲 佟玲 张建明 王建国 王芳 高翔 崔淑娟 张代涛关键词:甲型流感病毒 呼吸道合胞病毒 肺炎支原体 嗜麦芽窄食单胞菌 2023年北京市通州区学校呼吸道腺病毒暴发疫情感染病原特征分析 2025年 目的 分析2023年北京市通州区学校呼吸道腺病毒暴发疫情的病原基因组学及流行病学特征,为疫情防控提供依据。方法 收集2023年北京市通州区学校呼吸道感染不明原因发热病例,经荧光聚合酶链式反应(PCR)鉴定为腺病毒核酸阳性呼吸道标本,采用PCR方法扩增六邻体基因片段,进行核苷酸序列测定及初步分型鉴定,并使用全基因组靶向多重扩增测序方法,获取腺病毒全基因组序列,用于遗传进化溯源树分析及监控基因组变异情况。结果 2023年北京市通州区学校4 653份呼吸道感染发热病例中,共报告1例腺病毒散发病例与3起腺病毒暴发疫情,涉及14所学校,腺病毒荧光PCR检测阳性89份。对其中的63份进行普通PCR扩增六邻体基因片段,成功扩增测序得到58份基因序列,经Blast比对及进化树分型,初步鉴定所有样本均为人腺病毒B3型。选取其中15份样本进行全基因组测序,组装序列的腺病毒基因组覆盖度均大于99%,进化树溯源分析15份样本均与人腺病毒B3型2021年北京流行株MW748663.1亲缘关系最近,同源性均在99.75%以上,测试样本基因组未发现重组事件发生。结论 2023年北京市通州区学校腺病毒感染病例主要流行株基因型别为HAdV-B3型,未发现明显基因组变异情况。 张冲 邹林 佟玲 郗璐 刘肖 王芳 张猛关键词:流行病学 暴发疫情 全基因组测序 北京地区一起3型腺病毒引起发热暴发疫情的实验室确诊 被引量:2 2020年 目的对北京地区一起呼吸道发热疫情进行实验室确诊。方法收集此次呼吸道发热疫情病例的咽拭子标本,利用实时荧光RT-PCR方法对呼吸道病毒和呼吸道细菌进行核酸筛检。对腺病毒筛查阳性的标本,利用腺病毒特异性引物,进行3个基因片段(Fiber、Hexon和Penton)扩增和测序,并对测序序列进行BLAST比对和进化关系分析。结果在收集的14份病例标本中,共检测到14份腺病毒阳性。Fiber、Hexon和Penton 3个基因序列BLAST结果显示,14例均为3型腺病毒。进化关系分析显示,该病毒与美国1株2007年流行的3a51型腺病毒(GenBank登录号为KF268123)高度同源。结论北京地区该起呼吸道发热暴发疫情,是由3a51型腺病毒引起的。 邹林 高翔 王建国 张冲 佟玲 杨丽丽 杨艳娜 王艳春 李洪军 张铁钢 张国峰关键词:人腺病毒 基因型