张晓芹 作品数:25 被引量:91 H指数:5 供职机构: 北京中医药大学中药学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 教育部留学回国人员科研启动基金 科技基础性工作专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 历史地理 更多>>
北柴胡特异DNA 条形码筛选及种质资源鉴定 被引量:5 2023年 目的基于北柴胡Bupleurum chinense叶绿体基因组筛选特异性DNA条形码,并利用特异DNA条形码鉴定不同产地北柴胡种质资源。方法利用Illumina HiSeq X Ten平台对北柴胡进行叶绿体基因组测序,利用mVISTA软件和核酸多样性分析筛选特异性片段,基于特异性片段进一步分析不同产区北柴胡样品单倍型。结果不同产地3份北柴胡叶绿体基因组全长为155557~155959 bp,均呈现典型的环状四分体结构,均编码131个基因。trnV-UAC、trnC-GCA_petN、petN_psbM、ndhF_rpl32可以作为潜在的北柴胡种质资源鉴定的特异性DNA条形码。基于扩增效率,选择petN_psbM和ndhF_rpl32对来自4省7个产地177份北柴胡样品进行序列分析,结果表明petN_psbM和ndhF_rpl32分别有91和78个变异位点,分别鉴定到28、29个单倍型;两段序列联合分析形成40个单倍型(Hap1~Hap40),各单倍型的遗传距离为0~0.022。6个产地拥有特有单倍型,可以将不同产地的北柴胡种质资源进行区分。结论利用比较叶绿体基因组学筛选的特异DNA条形码petN_psbM和ndhF_rpl32可以用于北柴胡种内种质资源鉴定,为后续鉴定北柴胡的产地来源、种质资源保护利用和育种等工作奠定基础。 王馨 尹光耀 张志飞 陈颖 刘珊瑚 满金辉 石玥 黄钰莹 张晓芹 王晓晖 魏胜利关键词:北柴胡 叶绿体基因组 种质资源 DNA条形码 桔梗特异DNA条形码筛选、种质资源鉴定及遗传多样性分析 被引量:1 2024年 中药材桔梗为桔梗科植物桔梗的干燥根,具有多种药理作用,是常用的大宗中药材。本研究利用Illumina HiSeq X Ten平台对6份来自不同产地的桔梗进行叶绿体基因组测序,筛选特异性DNA条形码,基于特异性DNA条形码对不同产区的桔梗样品的种质资源和遗传多样性进行分析。6份桔梗叶绿体基因组全长为172260~172275 bp,均呈现典型的环状四分体结构,编码141个基因。根据比较基因组学分析和扩增效率分析发现trnG-UCC和ndhG_ndhF可作为潜在的桔梗种内种质资源鉴定的特异性DNA条形码。对来自9省15个产地305份桔梗样品的trnG-UCC和ndhG_ndhF进行PCR扩增和序列分析,结果表明trnG-UCC和ndhG_ndhF分别有5和11个变异位点,分别鉴定到5和7个单倍型;两段序列联合分析鉴定13个单倍型(Hap1~Hap13),其中占比最多的是Hap4,其次是Hap1。3个产地拥有的特异单倍型,可作为该产地的DNA分子标签与其他产地的桔梗种质资源进行区分。单倍型多样性、核苷酸多样性和遗传距离分别为0.94、4.79×10^(-3)和0.0000~0.0203,表明桔梗在物种水平上有较高的遗传多样性,种内各单倍型之间亲缘关系比较接近。本研究为桔梗产地鉴定、种质资源保护利用和分子育种等工作奠定基础。 王馨 石玥 满金辉 黄钰莹 张晓芹 安克露 何高洁 刘子齐 关范圆 郑语嫣 王晓晖 魏胜利关键词:桔梗 叶绿体基因组 DNA条形码 种质资源 大黄总RNA提取方法的研究 被引量:5 2014年 目的建立大黄根中总RNA提取的方法,为后续的分子生物学研究打下基础。方法以新鲜的大黄根为材料,分别采用Trizol法、常规CTAB-LiCl法、改良CTAB-LiCl法、通用型试剂盒法提取总RNA,利用琼脂糖凝胶电泳、微量紫外分光光度计和实时荧光定量PCR检测总RNA的纯度、完整性和产量。结果除CTAB-LiCl法外,Trizol法和通用型试剂盒法均不能从大黄根中提取出总RNA。同时,常规CTAB-LiCl法不稳定,所提总RNA有一定程度的降解。采用改良CTAB-LiCl法所提取的总RNA量大,纯度、完整性及质量均较好。结论改良CTAB-LiCl法对大黄等富含多酚、多糖类药材的总RNA提取具有一定的借鉴意义。 程小丽 魏胜利 刘春生 张晓芹关键词:总RNA 多基原药材大黄叶绿体matK基因序列分析及鉴定研究 被引量:21 2013年 大黄为多基原药材,其混淆品种类很多,传统的药材鉴定方法无法实现对药材基原种的鉴别。本研究通过对采集于大黄主产区的正品基原以及常用混淆品药材matK基因序列的差异分析,结合已有报道的大黄matK基因序列结果,探讨从基因型角度进行大黄药材分子鉴定的可行性。采用改良试剂盒法提取DNA,以大黄属matK基因通用引物进行PCR扩增,扩增产物经回收纯化后双向测序,运用ContingExpress、DNAman、MEGA5.0等软件进行序列分析,总结大黄正品基原与混淆品的基因型对应规律。结果显示正品大黄的matK基因序列全长1 518 bp,变异位点57个。基于587、707和838位3个特异性位点可鉴别掌叶组外的混淆品与正品基原,基于基因型特异性可鉴别掌叶组内条裂大黄、六盘山鸡爪大黄和绿花唐古特大黄3种组内混淆品以及正品基原的3个种,同时也能在一定程度上实现正品基原产地的鉴别,但是对此还有待于增加药材样品进一步验证。 张晓芹 刘春生 闫兴丽 程小丽 刘娟 王秋玲 刘凯 魏胜利关键词:分子鉴定 基因型 基于DNA条形码—产地—形态分析联用的巴西草药PICO(鬼针草)的鉴定及生药学研究 2015年 目的对巴西鬼针草药材进行基原鉴定及生药学研究,为药材质量控制和开发应用提供依据。方法提取样品总DNA,扩增ITS基因序列,利用相似度搜索法进行分子鉴定。利用通过DNA条形码—产地—形态分析方法鉴定巴西鬼针草。按照2010版《中华人民共和国药典》(一部)中方法分析样品性状、显微特征。结果 DNA条形码—产地—形态分析联用的鉴定方法鉴定巴西鬼针草药材来源于菊科植物鬼针草Bidens pilosa。结论巴西鬼针草药材来源于菊科植物鬼针草Bidens pilosa,生药学特征可以作为药材鉴定的依据。 顾选 张晓芹 宋晓娜 李妍芃 韩丽 赵百孝 刘春生 马长华 哈略关键词:鬼针草 DNA条形码 生药学 基于DNA条形码-产地-形态联用的药材溯源新方法研究---以黑果枸杞1种伪品为例 利用NCBI 核酸数据库中ITS(internal transcribed spacer)序列,结合产地分析和形态分析对新发现的一种黑果枸杞混伪品进行溯源研究。通过提取样品DNA,PCR 扩增及双向测序,获得样品的ITS... 顾选 张晓芹 宋晓娜 臧艺玫 李妍芃 马长华 赵百孝 刘春生尼泊尔产重楼药材的DNA鉴定 目的:利用NCBI核酸数据库中的ITS序列来鉴定尼泊尔产重楼药材,并为其定种以及是否可作为进口药材提供分子依据。方法:从该药材中提取总DNA,以ITS序列通用引物进行PCR扩增,扩增产物经纯化后直接双向测序,利用ITS序... 程小丽 张晓芹 刘春生关键词:重楼 药材鉴定 ITS序列 文献传递 一种诱导三七幼芽形成三七愈伤组织的方法 本发明公开了一种诱导三七幼芽形成三七愈伤的方法,包括将三七幼芽置于诱导培养基中进行培养,所述诱导培养基中同时使用四种激素共同诱导三七幼芽形成三七愈伤组织。本发明的方法简便、可控,能够快速诱导三七幼芽培养出三七愈伤组织。 魏胜利 王晓晖 石玥 满金辉 黄钰莹 张晓芹RP-HPLC-DAD同时测定大黄中9种有效成分的含量 被引量:17 2013年 目的:建立RP-HPLC-DAD同时测定大黄中5种游离蒽醌类成分(芦荟大黄素、大黄酸、大黄素、大黄酚和大黄素甲醚),2种双蒽酮类成分(番泻苷A、番泻苷B),以及没食子酸、儿茶素合计9种成分含量的方法。方法:采用Agilent Zorbax SB-C18(4.6 mm×250 mm,5μm)色谱柱,流动相0.05%磷酸水溶液-乙腈,梯度洗脱,流速1 mL·min-1,检测波长280 nm,柱温40℃,进样量10μL。结果:芦荟大黄素、大黄酸、大黄素、大黄酚、大黄素甲醚、番泻苷A、番泻苷B、没食子酸和儿茶素9种成分分别在4.56~45.6,16.3~163,7.38~73.8,7.44~74.4,1.82~18.2,57.6~576,28.2~282,3.27~32.7,118~1.18×103mg·L-1与峰面积呈良好的线性关系(r≥0.999 5),平均加样回收率为96.4%~101.4%,RSD〈3.15%。不同来源的6批大黄样品中9种有效成分的含量差别较大。结论:该方法简单、重复性良好,准确可靠,可用于大黄药材的快速质量评价。 程小丽 魏胜利 刘春生 张媛 刘娟 刘凤波 张晓芹药膳巧调经,安度更年期 2013年 女性到了更年期,月经变化最突出,出现月经不规则、血量增多或减少等现象。若经血量大,经期延长,失血过多可造成贫血。饮食方面需要选择营养价值高的补血食物,如鸡蛋、鸡肉、牛奶等。与此同时,由于更年期内分泌改变,容易引起植物神经系统功能的紊乱,出现血压升高、 刘春生 张晓芹 詹鑫婕关键词:更年期 调经 药膳 神经系统功能 内分泌改变 失血过多