李多云
- 作品数：52 被引量：106H指数：5
- 供职机构：深圳市南山区人民医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金深圳市南山区科技计划项目广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 一株利奈唑胺耐药粪肠球菌的全基因组测序和序列比较被引量：2
- 2014年
- 目的研究利奈唑胺耐药粪肠球菌的全基因组序列,并探讨与其它肠球菌序列的差异。方法从1例男性急性白血病患者的气管分泌物中分离到粪肠球菌株Deng1(E.fecalis Deng1)。通过Illumina Hiseq2000和Roche454 FLX+进行高通量全基因组鸟枪法测序(high-throughput whole-genome shotgun sequencing)。基因组Contigs和scaffolds通过Newbler汇编软件分析。基因组gap closures通过Sanger测序法确定。通过Phred/Phrap/Consed软件构建圆环型的基因组图,并通过软件Prokaryote Genomes Automatic Annotation Pipeline(PGAAP)进行基因组注释。参考序列和粪肠球菌Deng1基因组之间的系统发育分析(phylogenice analysis)通过muscle软件分析。结果 E.fecalis Deng1圆环形基因组包含2,961,043碱基对,GC含量37.5%。基因组含有2 854个编码序列(CDS),62个tRNA的编码基因,以及4个完整的rRNA基因编码的操纵子。E.fecalis Deng1基因组共有443个毒力因子。E.fecalis Deng1基因组致病岛(PAI)约170kb,含有编码溶细胞毒素、肠球菌表面蛋白Esp和Gls-24-样蛋白等的毒力因子,E.fecalis Deng1含有对链霉素高水平耐药的氨基糖苷类6-腺苷酰转移酶基因(aadK),以及与抗生素耐药相关的emea,lsa和tetM基因。结论完成了一株粪肠球菌完整基因组的测序分析,加深了对LZD耐药流行菌株的认识。
- 郑金鑫董琨陈重潘伟光李多云刘晓军邓启文余治健
- 关键词：粪肠球菌利奈唑胺高通量测序全基因组序列
- 2株利奈唑胺中介粪肠球菌23SrRNAV区基因变异检测
- 2014年
- 目的研究粪肠球菌对利奈唑胺(LNZ)的耐药情况和耐药机制,为临床合理用药提供依据。方法收集2012年1月—2013年1月深圳市南山区人民医院接受LNZ治疗患者痰液标本分离的粪肠球菌12株,采用琼脂稀释法测定抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC),聚合酶链反应(PCR)扩增23S rRNA V区基因,并进行测序分析。结果 12株菌中,2株为中介株(菌株编号分别为3和6),10株为敏感株。2株中介株均检测到G2576U突变,其中1株(编号6)还同时存在C2424U突变;10株敏感株未检测到变异。C2424U和G2576U突变分别发生在23S rRNA V区基因的R1区和R4区。结论粪肠球菌LNZ中介株中发现23S rRNA V区基因变异,提示临床应密切关注LNZ的MIC变化。
- 郑金鑫李多云陈重邓名贵刘晓军邓启文余治健
- 关键词：粪肠球菌利奈唑胺耐药性抗药性突变
- 2008-2015年深圳某医院金黄色葡萄球菌血流感染的临床特征和预后分析被引量：16
- 2017年
- 目的分析深圳市南山区人民医院金黄色葡萄球菌血流感染的临床特征和起病后30 d内死亡相关的危险因素。方法回顾分析2008-2015年由金黄色葡萄球菌所致血流感染患者的临床和微生物学资料,分析30 d内死亡相关危险因素。结果共121例患者入组,其中MRSA血流感染检出率为17.4%(21/121)。相比较于MSSA血流感染,MRSA血流感染中年龄≥65岁老年患者更多、医院感染和呼吸道感染更为常见(P值分别为0.026、0.035和0.001);并且MRSA血流感染患者中复数菌感染更多和接受了更多的不恰当初始抗感染治疗(P值分别为0.005和0.001)。患者起病后30 d内的死亡率为18.2%(22/121)。通过单因素和多因素回归分析示仅实体肿瘤(OR,8.932,P=0.004)和感染性休克(OR,56.721,P<0.001)是患者起病后30 d内死亡的独立危险因素。结论实体肿瘤和感染性休克,比MRSA感染在金黄色葡萄球菌血流感染患者死亡中起了更重要的作用。
- 郑金鑫王红燕徐芹珍蒲彰雅李多云陈重邓向斌邓启文余治健
- 关键词：金黄色葡萄球菌血流感染死亡率
- 人I型干扰素受体亚基稳定表达真核细胞的筛选及鉴定被引量：1
- 2015年
- 目的:筛选及鉴定人I型干扰素受体亚基(IFNAR1)稳定表达真核细胞。方法:体外扩增IFNAR1基因片段,将双酶切后扩增片段和pc DNA3.1(+)连接构建重组质粒pc DNA3.1-IFNAR1,转化BL21感受态细菌培养,提取重组质粒行琼脂糖凝胶电泳和测序鉴定。重组质粒pc DNA3.1-IFNAR1转染肝癌细胞系Hep G2,新霉素筛选挑取阳性克隆细胞,蛋白质印迹试验(Western blotting)分析阳性细胞IFNAR1表达水平。结果:经双酶切和测序验证pc DNA3.1-IFNAR1重组质粒构建成功。pc DNA3.1-IFNAR1转染Hep G2经新霉素筛选后获得稳定表达细胞系,蛋白质印迹试验(Western blotting)证实这些细胞具有较好蛋白表达水平。结论:体外成功构建不同IFNAR1稳定表达水平的Hep G2细胞。
- 余治健李多云刘宝兰刘晓军邓名贵杨唯枝郑金鑫陈重邓启文
- 关键词：重组质粒真核细胞
- 用于预防和治疗肠致病大肠杆菌感染的肽段
- 本发明提供了一种用于预防和治疗肠致病大肠杆菌感染的肽段，其包括SEQ ID NO：4的氨基酸序列。采用本发明的技术方案，包含用于预防和治疗肠致病大肠杆菌感染的肽段的多肽与EspB蛋白的亲和力高于对照蛋白，可用于预防和治疗...
- 邓启文余治健陈重程航邓向斌李多云郑金鑫
- 文献传递
- 耐利奈唑胺粪肠球菌感染的危险因素分析被引量：3
- 2017年
- 分析深圳市南山区人民医院粪肠球菌感染患者的临床资料,探讨引起感染的危险因素,为防治耐利奈唑胺粪肠球菌感染提供临床参考。选取2010年1月—2015年9月在深圳市南山区人民医院住院的165例粪肠球菌感染患者,根据药敏结果分为利奈唑胺敏感组(103例)和利奈唑胺中介/耐药组(62例)。165例粪肠球菌主要来源于中段尿培养,占53.94%,其次为伤口分泌物培养(21.82%)、血培养(6.06%);科室分布以泌尿外科和肝胆外科为主,分别占35.76%和9.70%。单因素分析显示,碳青霉烯类抗生素暴露、留置尿管与感染相关。Logistic回归分析进一步明确碳青霉烯类抗生素暴露、留置尿管为耐利奈唑胺粪肠球菌感染的危险因素,提示应严格掌握碳青霉烯类抗生素的适应证,加强医院内感染的控制管理。
- 马孝煜蒲彰雅姚伟明陈重王红燕程航邓向斌李多云郑金鑫邓名贵刘晓军邓启文余治健
- 关键词：粪肠球菌利奈唑胺
- 一株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MS4的全基因组测序结果分析被引量：2
- 2017年
- 目的:分析创口分离一株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的全基因组序列特点。方法:将深圳大学南山区人民医院一例创口脓液分离菌株采用BD Phoenix TM100自动细菌鉴定/药敏系统鉴定;用E-Test试验测定其利奈唑胺(LZD)最低抑菌浓度(MIC)值;扩增细菌提取细菌总DNA,应用多重PCR扩增及DNA测序方法行SCCmec-spaMLST分型;并采用Illumina Miseq结合第三代测序技术分别构建了Illumina Miseq PE文库(~500 bp)和Pac Bio文库(8~10 kb),普通PCR覆盖gap,对获得的测序数据进行质控后利用生物信息学分析手段完成该菌株的全基因组完成图绘制。结果:经鉴定此菌株为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(命名为MS4)。药敏结果显示该菌株对头孢西丁、氨苄西林、甲氧西林、青霉素P、阿莫西林/克拉维酸耐药,对利奈唑胺等其余抗菌素敏感。E-Test提示LZD MIC值为0.094 ug/m L。SCCmecspa-MLST分型结果显示该菌株属于III-t 3592-ST59型。MS4基因组包含2709797 bp,GC含量33.5%;通过注释后总共有2475个基因,11个t RNA编码基因,3个完整的r RNA基因编码操纵子,并包括mec A等耐药基因和γ-溶血素、溶血素III、烯醇酶、肠毒素等多种毒力因子,申请获得Genebank号CP009828。结论:完成了一株创口脓液来源MRSA的基因分型和全基因组完成图绘制,为MRSA基因组比对和系统进化发育分析提供了模板序列。
- 姚伟明陈重王红燕程航邓向斌李多云郑金鑫邓名贵刘晓军邓启文余治健
- 关键词：金黄色葡萄球菌甲氧西林全基因组序列
- 一株利奈唑胺耐药粪肠球菌基因完成图绘制和结果分析
- 目的:研究利奈唑胺耐药粪肠球菌(Enterococcusfaecalis,E.faecalis)的基因组情况。方法:临床分离的一株粪肠球菌,E.faecalisstrainDeng1,来自深圳市南山区人民医院一例住院患者...
- 程航李多云马桂红潘伟光郑金鑫陈重余治健邓启文
- 关键词：粪肠球菌全基因组高通量测序
- 文献传递
- 深圳某三甲综合医院7年耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药变迁被引量：4
- 2017年
- 目的:分析深圳市南山区人民医院7年来临床分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)临床分布及耐药特点,为临床合理用药提供参考。方法:收集2010年1月至2016年12月本院临床分离的CRKP,分析标本来源、科室分布及耐药变迁。结果:1528株非重复分离的肺炎克雷伯菌中,检出CRKP 86株(5.63%)。2010年至2016年CRKP检出率分别为3.22%、2.22%、2.56%、4.87%、3.14%、12.92%、11.79%,呈逐年上升趋势。86株CRKP产超广谱β-内酰胺酶(ESBL)率为55.81%(48/86)。CRKP菌株主要来源于痰液(57.65%)及中段尿(20.00%),主要分布于重症监护病房(ICU)、普外科及呼吸内科。2010年至2016年CRKP对抗菌药物总耐药率最高的是氨苄西林(100%),其次是头孢唑林(94.44%)。耐药率最低的是阿米卡星(16.28%),其次是庆大霉素(24.42%)。而美罗培南和亚胺培南总耐药率分别是72.09%和82.56%,并呈逐年上升趋势。结论:CRKP感染呈逐年上升趋势,临床应实施严格的感染控制措施防止CRKP在医院内的快速传播。
- 马孝煜郑金鑫林志伟邓向斌徐广健孙翔白冰邓名贵李多云余治健邓启文
- 关键词：肺炎克雷伯菌细菌耐药性
- 双歧杆菌肠道内调控表达肠道病毒71型VP1蛋白的实验研究被引量：3
- 2014年
- 目的构建重组肠道病毒71VP1基因双歧杆菌,制成口服疫苗,用于EV71感染预防。方法扩增EV71病毒VP1基因并将其插入到大肠埃希菌-双歧杆菌穿梭表达载体pBBAD/Xs中,构建VP1表达载体(pBBADs-VP1),通过Western blot检测VP1蛋白在pBBADs-VP1转化菌中的表达。选取BALB/c小鼠,分为B-VP1组、VP1组、GFP组和生理盐水组,B-VP1组口服pBBADs-VP1-转化双岐杆菌,VP1组腹腔注射大肠埃希菌表达纯化的重组VP1蛋白,GFP组口服pBBADs-GFP转化双岐杆菌,生理盐水组口服生理盐水,观察pBBADs-VP1-转化双岐杆菌口服免疫对EV71感染的免疫反应:包括病毒的中和抗体滴度、抗EV71-VP1抗体以及诱导脾脏和淋巴集结中Th1免疫反应。结果与GFP组及生理盐水组比较,B-VP1组及VP1组中和抗体滴度及抗EV71-VP1抗体水平,均显著增加;口服表达VP1蛋白长双歧杆菌和注射VP1蛋白都会诱导Th1细胞因子免疫反应(P<0.05),表达VP1蛋白长双歧杆菌较易诱导局部肠道的Th1模式,而注射VP1蛋白较易诱导全身性免疫。攻毒试验显示,VPI和B-VP1组新生鼠攻击后第15d(剂量1 000LD50)存活率分别为20.00%和16.67%,对照组无小鼠存活。结论利用长双歧杆菌表达VP1蛋白的口服疫苗可能成功激发针对EV71病毒感染的特异性免疫应答。用表达VP1的重组双歧杆菌免疫母鼠,可以赋予新生小鼠以保护。
- 李多云刘晓军程航陈重邓名贵郑金鑫邓丽丽徐俊余治健曾位森邓启文
- 关键词：肠道病毒71型VP1蛋白长双歧杆菌口服免疫
