陈亮
- 作品数：5 被引量：3H指数：1
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 极端嗜热古菌—硫矿硫化叶菌拓扑异构酶Ⅲ单链DNA切割与再连接反应的研究
- 极端嗜热古菌－硫矿硫化叶菌属于古菌域泉古菌界，最适生长温度为70-85℃，最适生长pH约为3。本论文对硫矿硫化叶菌拓扑异构酶III(Sso topo III)催化的DNA负超螺旋松弛反应的步骤进行了研究，获得了以下主要结...
- 陈亮
- 关键词：拓扑异构酶极端嗜热古菌
- 从复杂样本中富集真菌的方法及其在真菌研究中的应用
- 本发明涉及微生物领域，具体涉及一种从复杂样本中富集真菌的方法及其在真菌研究中的应用。该方法包括：1)从所述复杂样本去除粒径大于100μm的物质后，通过0.8‑1.0μm的滤膜对其进行浓缩，以得到浓缩样本；2)裂解所述浓缩...
- 王军鲁晶晶陈亮赵娜
- 文献传递
- 肠道微生物菌群共存网络的构建与分析被引量：3
- 2018年
- 【目的】将网络分析应用到肠道微生物的分析之中,探究肠道微生物共存网络拓扑结构等相关网络系数的分析,从而展现肠道微生物共存网络的特性。【方法】将之前研究中的肠道微生物数据根据雌马酚代谢能力划分成雌马酚产生者和非产生者两组,计算两组微生物相对丰度,得出菌种之间的相关系数,构建肠道微生物的共存网络,分析两组间共存网络参数的差异;运用随机网络检验现实网络拓扑结构的特异性,分析两组网络中菌种间的差异。【结果】共存网络中两组节点数分别为45个和47个,即分别有45个和47个不同菌种。比较两组网络结构的差异,发现雌马酚产生者组中的共存网络菌群具有更复杂的连接,且两组之间的其他网络参数存在一定的差异。通过将现实网络与随机网络对比可知,现实网络的拓扑结构具有一定的特异性。将具有代谢雌马酚相关物质能力的菌种在两组网络中标出,发现它们在雌马酚产生者组共存网络中更趋向与来自不同门的菌种产生相互联系。【结论】将网络分析应用于肠道微生物分析之中,可以发掘菌种之间的相互作用和网络拓扑结构的复杂性与差异性,展现肠道菌群结构中之前较少被认识到的一些特征。因而,网络分析的方法可以为未来肠道微生物的研究提供新的视角。
- 马越王军胡永飞陈亮李晶律娜刘飞王黎明封雨晴朱宝利
- 关键词：肠道微生物网络分析随机网络雌马酚
- 基于Nanopore测序技术的多组学测序及分析方法
- 本发明提供一种基于Nanopore测序技术的多组学测序及分析方法，包括：A、将采集的样本同时进行DNA和RNA提取；B、提取的RNA 3′端添加Poly U尾巴；C、将带有Poly U尾巴的RNA反转录成cDNA，并在其...
- 王军赵娜陈亮徐嘉悦于莹李亦嘉徐西占许亚昆
- 文献传递
- 从复杂样本中富集真菌的方法及其在真菌研究中的应用
- 本发明涉及微生物领域，具体涉及一种从复杂样本中富集真菌的方法及其在真菌研究中的应用。该方法包括：1)从所述复杂样本去除粒径大于100μm的物质后，通过0.8‑1.0μm的滤膜对其进行浓缩，以得到浓缩样本；2)裂解所述浓缩...
- 王军鲁晶晶陈亮赵娜
