宋云龙 作品数:99 被引量:269 H指数:10 供职机构: 第二军医大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 理学 化学工程 文化科学 更多>>
基于药物数据报道数据库的虚拟组合片段库构建 被引量:1 2007年 对药物数据报道数据库中142553个药物分子进行统计分析,提取得到了这些药物分子的共同结构特征.根据药物分子的结构特征将其拆分为环结构、侧链和连接子,共整理得到32017个片段结构,其中环结构13642个、侧链10076个、连接子8299个.为更好地指导全新药物设计,利用拆分片段构建了三个虚拟组合片段数据库:用环结构和侧链组合方式构建了药效基团库,含有34244个片段;用环结构的刚性特点构建了基本骨架库,含有片段13574个;直接利用连接子构建了连接片段库,含有连接片段8051个.库中所有片段都经过能量优化,均具有合理的构型和构象,可以用于虚拟组合库的构建和全新药物设计. 张珉 盛春泉 徐辉 宋云龙 张万年关键词:药物设计 片段 统计分析 药物分子 异噁唑类新型顶体酶抑制剂及其制备方法 本发明涉及一类新型的顶体酶抑制剂、其制备方法及其在制备男性抗生育药物中的应用。具体的,本发明涉及一类如式Ⅰ所示的新型的顶体酶抑制剂,其中各取代基的定义如说明书中所述。本发明还涉及所述顶体酶抑制剂的制备方法及其在制备男性抗... 吕加国 赵军涛 苏定冯 朱驹 周有骏 刘建国 盛春泉 吕狄亚 陈倩倩 田巍 郑灿辉 宋云龙 章玲 李唯 陈莎娜文献传递 2-吲哚酮类VEGF受体2抑制剂的分子对接和三维定量构效关系 2007年 目的:研究VEGFR2抑制剂与靶酶的作用机制,为设计新型抑制剂建立理论模型。方法:应用AutoDock3.05对接2-吲哚酮类抑制剂到靶酶的活性腔,然后以抑制剂的对接构象为基础,在Sybyl6.9中建立抑制剂的比较分子力场分析法(comparative of molecular field analysis,Co MFA)和比较分子相似性指数分析法(comparative of molecular si milarity indexanalysis,Co MSIA)三维定量构效关系模型。结果:对接构象与文献报道结果一致,三维定量构效关系统计指标Q2均大于0.5。结论:所得结果具有较好的可靠性,对于设计新型化合物具有指导意义。 陈军 吕加国 张万年 宋云龙 郑灿辉 李耀武 盛春泉 朱驹 周有骏关键词:血管内皮生长因子受体2 分子对接 新型三唑类化合物的合成及抗真菌活性 被引量:13 2004年 目的 寻找广谱、高效、低毒的新一代三唑类抗真菌药物。方法 根据靶酶活性位点的空间特征、各种力 场和关键残基分布,设计并合成了21个1 (1,2,4 三唑 1H 1 基) 2 (2,4 二氟苯基) 3 (4 取代 1 哌嗪基) 2 丙醇类 化合物,并测定了体外抑菌活性。结果 体外抑菌测试结果表明,所有化合物对8种致病真菌均有一定程度的抗真 菌活性,对深部真菌的活性明显优于浅部真菌。在哌嗪的各种取代基中,苯基和杂环取代的抗真菌活性明显优于苯 甲酰基取代。结论 有多个化合物的体外抗真菌活性明显高于氟康唑和特比萘芬,其中化合物VIII 1,4,5和IX 3 具有广谱、高活性的优点,值得进一步研究。 盛春泉 朱杰 张万年 宋云龙 张珉 季海涛 余建鑫 姚建忠 杨松 缪震元关键词:三唑类 抗真菌活性 构效关系 异噁唑衍生物及其应用 本发明公开了一种吡唑、异噁唑衍生物及其制备方法和应用,本发明公开的吡唑、异噁唑衍生物,存活性较高、特异性较强,为临床提供新的男性避孕后选药物,有较大的应用价值。所述吡唑、异噁唑衍生物,为具有结构通式I所示化合物:<Ima... 吕加国 祁晶晶 朱驹 周有骏 盛春泉 郑灿辉 宋云龙 章玲 刘雪飞 丁莉莉 韩广乾 赵军涛 陈倩倩 田巍文献传递 一种小分子有机化合物JFD-03554在制备抗肿瘤药物中的用途 本发明涉及一种基于生物信息学和计算机技术相结合的药物虚拟筛选平台发现的一类以JFD-03554为代表的有机小分子化合物在制备抗肿瘤药物中的新用途。该化合物较现有的Top1抑制剂,结构新颖,水溶性好,而且对非小细胞肺癌A5... 宋云龙 章玲 亓云鹏 付小旦 张万年 盛春泉 姚建忠 余建鑫 缪震元 周有骏 朱驹 吕加国 郑灿辉 刘娜文献传递 药学专业综合化学科研训练课程体系的建设与实践 被引量:2 2016年 针对药学专业本科生在课内教学中进行科研训练存在的相关问题,依托综合化学实验课程,从课程设置、训练目标、训练内容和训练指导编写等几个方面,阐述了药学专业综合化学科研训练课程体系的建设方法和实践成效。 王小燕 章玲 姚建忠 宋云龙 郑灿辉 俞世冲 柳润辉 沈颂章关键词:药学专业 课程体系 6-甲氧基靛红的合成工艺改进 2015年 目的探索6-甲氧基靛红的合成工艺改进方法。方法以3-甲氧基苯胺为起始原料,经Sandmeyer方法首先生成中间体1-肟基-N-(3-甲氧基苯基)乙酰胺,在甲磺酸催化下关环得到6-甲氧基靛红。结果在关环反应中,催化剂采用甲磺酸,替代文献中常用的浓硫酸,温度80℃,反应30min,收率达81.24%。结论提出了一条操作简单、条件温和、收率高的6-甲氧基靛红的合成工艺,适合大量制备。 王鸿玉 宋云龙 章玲 曾强 朱驹 张辉关键词:合成工艺 甲磺酸 喜树碱药效构象及分子内氢键对抗肿瘤活性的影响 被引量:3 2001年 喜树碱类抗肿瘤药物是临床广泛使用的DNA拓扑异构酶Ⅰ (topoisomeraseⅠ ,TopoⅠ )的特异性抑制剂。为从原子水平阐明喜树碱的作用模式 ,设计结构新颖、活性更高、毒性更低的TopoⅠ抑制剂 ,本研究采用abinitio方法RHF/ 3 2 1G对喜树碱分子构象空间进行了系统研究 ,并与半经验量化AM1、PM 3方法比较 ,所得构象均采用密度泛函方法B3LYP/ 6 31G(d)计算单点能 ,并进行频率检查验证。结果发现 ,A型构象可形成分子内氢键 ,较B型构象能量更低 ,为喜树碱药效构象。喜树碱E环形成分子内氢键 ,能量约为 2 9 31kJ/mol,这是该分子发挥药效的结构基础 ,同时使得它易于受溶剂水影响而裂解 ,生成无活性的羧酸盐形式。本研究还表明 ,喜树碱与TopoⅠ DNA复合物作用 ,需破坏分子内氢键 ,能量补偿较大 。 宋云龙 张万年 季海涛 周有骏 朱驹 吕加国关键词:喜树碱 INITIO 分子构象 分子内氢键 抗肿瘤活性 白色念珠菌N-肉豆蔻酰基转移酶中药物结合位点的MCSS分析 被引量:1 2008年 采用多拷贝同时搜寻方法(MCSS)分析得到了CaNMT活性位点的疏水区域、氢键结合位点和负电性区域.MCSS计算结果显示,CaNMT活性位点有两个疏水性比较强的区域:一个由Tyr107,Tyr109,Val108,Phe117,Phe123,Ala127,Phe176和Leu337等残基组成;另一个由Phe115,Phe240和Phe339组成.CaNMT活性位点发现有两个氢键作用区域,其中Tyr119,His227,Asn392和Leu451是与已有抑制剂的氢键结合位点,Tyr107,Asn175,Thr211和Asp412是新发现的氢键结合位点,而且在NMT家族中高度稳定,它们对设计新结构类型的CaNMT抑制剂具有重要作用.Leu451是负电性兼氢键作用位点,是抑制剂设计时所必需考虑的位点. 盛春泉 朱杰 张万年 徐辉 宋云龙 张珉 姚建忠 缪震元关键词:抗真菌 药物设计