何柳
- 作品数：14 被引量：88H指数：6
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 金银花中表达基因密码子偏好性分析被引量：3
- 2013年
- 密码子是生物体中重要的遗传信息载体,经过长期进化,不同的生物体对同一密码子形成了一定程度的使用偏好性。本研究对已获得的金银花转录组进行基因预测,利用CodonW程序对所有含有完整阅读框的预测基因,以及参与绿原酸合成的羟基化肉桂酰转移酶(HQT)基因进行密码子偏好性分析。并将HQT基因与大肠杆菌、酵母和拟南芥全基因组的密码子使用频率进行比较,为在细菌、真菌和植物中表达金银花中HQT基因,或通过合成生物学手段异源合成绿原酸奠定了前期研究基础。
- 何柳朱英杰孙超
- 关键词：密码子转录组金银花绿原酸
- 雷公藤药材真伪鉴别及质量评价研究被引量：6
- 2018年
- 随着雷公藤药材在临床应用比较广泛,其市场上的伪品较多,传统技术不能有效的鉴别该中药的真伪。该实验拟基于DNA条形码和化学指纹图谱方法对雷公藤属药材进行准确的鉴定及质量评价。采用DNA条形码技术、隐马尔可夫模型的HMMer注释方法和K2P模型进行遗传距离分析,并结合最近距离法、相似性搜索法、构建NJ树等方法对雷公藤的DNA序列进行鉴定和评估;采用UPLC-PDA方法建立雷公藤药材指纹图谱,评价不同来源的药材指纹图谱的相似度;采用LC-MS/MS方法检测雷公藤主要成分的含量。结果表明：药材基原物种雷公藤的ITS2序列种内最大K2P遗传距离均远小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离;应用相似性搜索法分析结果表明ITS2序列初步鉴定雷公藤药材及其混伪品;在NJ聚类树上雷公藤药材及其混伪品聚类较为清晰,初步分析27份样品中有12种为雷公藤正品。化学指纹谱研究表明特征1区可以较为直观的区分雷公藤伪品;LC-MS/MS,HCA-热图分析表明不同产地雷公藤药材6种有效成分的含量差异显著,可评价雷公藤药材的质量。该实验对雷公藤属的药材准确鉴定及质量评价具有指导意义。
- 段亚萍骆骄阳豆小文何柳李坤伦杨世海杨美华
- 关键词：雷公藤DNA条形码UPLCLC-MS/MS
- 金银花莽草酸/奎宁酸香豆酰转移酶(LjHCT)基因克隆与序列分析被引量：7
- 2014年
- 莽草酸/奎宁酸香豆酰转移酶(HCT)是金银花中绿原酸合成途径的关键酶。本研究利用已经获得的金银花(Lonicera japonica Thunb.)大量表达序列标签(EST)数据,通过cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得8条可能的HCT基因cDNA全长序列。通过序列相似性比较、蛋白质理化性质和保守结构域分析确定其中1个基因为金银花HCT(LjHCT)基因。该基因全长1 275个碱基,蛋白质分子量约为47kDa,为进一步研究HCT在绿原酸合成过程中的功能奠定基础。
- 何柳徐晓兰王振中毕宇安萧伟罗红梅孙超
- 关键词：金银花绿原酸
- 蛇足石杉1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(HsDXR1)基因克隆与表达分析被引量：6
- 2013年
- 基于本实验室已获得的蛇足石杉转录组数据,获得一个编码1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase,DXR)的转录本,分析其开放阅读框序列,发现该转录本编码全长为1 440 bp的蛇足石杉DXR基因(HsDXR1),含有479个氨基酸残基。采用RT-PCR方法获得了HsDXR1全长,并对HsDXR1编码蛋白的理化性质、结构域及三维结构进行预测分析。结果显示HsDXR1编码蛋白的预测分子量为51.496 1 kDa,等电点为6.44;不含信号肽和跨膜区;亚细胞定位预测表明该蛋白最可能定位于叶绿体;具有DXR蛋白典型的结构域。实时荧光定量PCR检测HsDXR1基因在蛇足石杉的茎中表达量最高,其次为根,在叶中表达量最低。本研究获得了蛇足石杉HsDXR1基因的编码区序列,为进一步研究HsDXR1在蛇足石杉萜类化合物生物合成途径中的功能奠定基础。
- 罗红梅李标林余霖宋经元何柳孙超李榕涛胡志刚
- 关键词：蛇足石杉基因克隆
- 本草基因组方法学研究被引量：14
- 2010年
- 本草基因组计划(HerbGP)是针对具有典型代谢途径和重大经济价值的药用植物进行的全基因组测序和后基因组研究的系列计划。本文全面介绍物种基因组大小、染色体数目测定方法和第二代高通量测序方法,以及全基因组组装和基因组注释、基因组比较等生物信息学分析手段,并简要阐述重测序在药用植物全基因组研究中的应用方法。本草基因组计划的实施,将促进现代科学最新技术和方法在中药研究中的应用,使中药学研究位于生命科学的最前沿。
- 陈士林何柳刘明珠钱俊闫海霞程翔林钱忠直
- 关键词：基因组大小染色体数目高通量测序
- 本草基因组计划研究策略被引量：42
- 2010年
- 本草基因组计划(HerbGP)是针对具有重大经济价值和典型次生代谢途径的药用植物进行的全基因组测序和后基因组学研究的系列计划。本文从物种选择,全基因组测序、组装和生物信息学分析,后基因组研究等方面系统阐述了本草基因组计划的研究策略。该计划将推动一批具有典型次生代谢途径的模式植物研究平台的建立,促进各种"组学"研究方法在药用植物研究领域中的应用,推动中国传统药学进入生命科学研究前沿领域。本草基因组计划为占领中药基础研究领域的科技制高点提供了难得的机遇,还将通过对药用植物有效成分生物合成路径的解析和药用植物优良品种的选育对我国天然药物的研发和中药农业的发展产生巨大而深远的影响。
- 陈士林孙永珍徐江罗红梅孙超何柳程翔林张伯礼肖培根
- 关键词：药用植物全基因组测序后基因组学次生代谢
- 脉冲场凝胶电泳技术在本草基因组计划中的应用
- 2010年
- 本文着重介绍了脉冲场凝胶电泳(PFGE)在本草基因组测序中的应用,包括测定药用真菌染色体数目和基因组大小、构建基因组文库及绘制物理图谱,并对PFGE使用中一些待解决的问题做了简要介绍。
- 刘明珠白志川陈士林孙超何柳张进
- 关键词：PFGE基因组大小基因组文库物理图谱
- 金银花中表达基因密码子偏好性分析
- 密码子是生物体中重要的遗传信息载体,经过长期进化,不同的生物体对同一密码子形成了一定程度的使用偏好性。这与DNA和蛋白质功能相关联,具有重要的生物学意义。本研究对已获得的金银花(Lonicera japonica Thu...
- 何柳朱英杰孙超
- 关键词：密码子转录组金银花绿原酸
- 植物中绿原酸合成途径研究进展被引量：15
- 2013年
- 绿原酸是植物中常见的多酚类有机酸,可以清除细胞中的自由基,保护组织免受氧化胁迫,阻止细胞发生癌变。另外它还具有抗病毒作用,常被应用到抗菌消炎的药物中。目前,随着对天然抗氧化剂需求量的增加,从植物中提取的绿原酸供不应求。因此对绿原酸生物合成途径的研究备受关注。该文对绿原酸的生物活性、药理作用以及3种可能的生物合成途径进行了阐述,总结概述了关于绿原酸生物合成途径在分子生物学方面的最新研究进展。这将为利用生物技术方法大量生产绿原酸提供理论依据。
- 何柳陈士林
- 关键词：绿原酸抗病毒生物合成
- 药用植物种植模式的变迁被引量：1
- 2023年
- 药用植物种植模式对提升中药材质量和数量,推动药用植物资源保护和可持续利用,促进中医药产业传承和创新发展具有决定性的作用。本文综述了部分药用植物种植的传统模式和现代模式,重点介绍了“拟境栽培”、“立体栽培”、“有机种植”和“精准调控”的种植模式,并对如何选择合适的药用植物种植模式进行了分析,以期为药用植物种植研究提供理论参考,同时也为中医药现代化发展提供依据。
- 丁自勉马艺沔罗红梅何柳武晓丽石凤敏曾其国
- 关键词：药用植物栽培
