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四膜虫基因表达数据库:四膜虫全基因组基因表达芯片和协同表达分析的数据资源被引量：2: 2010年; 嗜热四膜虫是一种优良的真核模式生物,对其功能基因组学的分析将为研究细胞和分子生物学的基础性重大问题提供新的机遇.四膜虫基因表达数据库(TGED)是原生动物纤毛虫中第一个基因表达数据库,整个数据库包括了四膜虫3个重要的生理和发育阶段20个时间点的全基因组基因表达数据,提供了友好的网页界面(http://tged.ihb.ac.cn)供用户获取这些数据.通过基因的标识号或描述信息,用户可以获取基因表达谱信息和协同表达基因.此外,TGED同时提供了制备四膜虫基因表达芯片的样品制备方法.欢迎研究者上传和分享其所有的基因芯片数据,以期为四膜虫或纤毛虫研究提供重要的功能基因组学资源.; 熊杰陆星亦陆钰明曾宏辉袁冬霞冯立芳畅悦BOWEN JosephineGOROVSKY Martin傅诚杰缪炜; 关键词：嗜热四膜虫

嗜热四膜虫五个hsp70基因的表达分析被引量：3: 2011年; 鉴定得到嗜热四膜虫13个含有完整保守结构域的hsp70基因,对其中5个高度相似且无内含子的hsp70基因进行表达分析。在37、39和41℃热激条件下,实时荧光定量PCR结果表明,hsp70-2基因对热激响应最敏感。在四膜虫生长、饥饿和接合生殖这3种生理或发育状态下,Microarray结果显示,hsp70-4基因恒定且高表达;在热激条件下,hsp70-4基因的表达水平随着温度的升高而略微增加,证实hsp70-4基因为热休克相关蛋白hsc70基因;克隆的hsp70-4基因全长2208bp,开放阅读框长1959bp,编码653个氨基酸。Microarray结果提示,hsp70-3可能参与四膜虫饥饿早期(0～12h)的耐受和接合生殖后期(6～10h)的新大小核形成,老大核凋亡等事件;hsp70-5可能参与四膜虫饥饿晚期(12～15h)的耐受和接合生殖早期(0～6h)的小核减数分裂、小核交换和原核(pronuclear)融合事件。Blast2GO分析表明,与hsp70-3和hsp70-5共表达的基因分别参与不同的生物学过程,进一步反映了hsp70-3和hsp70-5这两个基因在功能上是存在差异的。; 冯立芳畅悦袁冬霞缪炜; 关键词：嗜热四膜虫 HSP70基因实时荧光定量PCR MICROARRAY RACE

嗜热四膜虫金属硫蛋白基因MMT2和MTT4的表达规律比较与进化模式分析被引量：3: 2011年; 多个金属硫蛋白基因异构型已在四膜虫中被鉴定,这些异构型可分为7a和7b两个亚家族。该文利用实时荧光定量PCR技术检测了嗜热四膜虫金属硫蛋白基因MTT2和MTT4在Hg、Cu、Cd、Zn、H2O2暴露下的表达水平,结果显示两者表达规律相似,均为:Cu暴露下上调最高(>200倍),Hg次之,Cd、Zn上调倍数不大,H2O2有下调趋势。此表达规律明显有别于7a亚家族,具有7b亚家族的表达特征。同种诱导物暴露下MTT4的上调表达幅度比MTT2高出数倍,结合生物信息学分析结果,推测可能与MTT2和MTT4上游调控元件(如AP-1、MRE等)的数量差异有关。基于MTT2和MTT4在结构和功能上的高度相似性,推测两者可能是经近期基因复制事件产生,并遵循基因剂量模型进化而来。; 畅悦冯立芳熊杰缪炜; 关键词：嗜热四膜虫金属硫蛋白基因实时荧光定量PCR 基因复制

水环境微生物、模式原生动物——嗜热四膜虫的毒理基因组学研究: 水环境微生物主要包括原核微生物(如细菌等)，真菌(如霉菌、酵母等)，藻类和原生动物(如鞭毛虫，纤毛虫等)。用于环境污染物的监测评价和生物治理的环境微生物学原理和技术随着80年代后分子生物学方法的迅猛发展而成为环境微生物学...; 缪炜冯立芳畅悦; 关键词：嗜热四膜虫毒理基因组学; 文献传递

有污染物二氯二苯三氯乙烷、三丁锡和2,3,7,8-四氯二苯并二噁英暴露下的四膜虫毒理因组学研究被引量：3: 2011年; 有污染物二氯二三氯乙烷(DDT)、三丁锡(TBT)和2,3,7,8-四氯二并二噁英(TCDD)因对水生生态系统的害以对人体健康造成的重伤害而受到重视.实验以生物原生动物嗜热四虫为究对象,利用microarray技筛选了在上3种污染物下分别露24h后差异表达2倍以上的因,并在gene ontology功能注释的础上,通过富分析考察了这些因涉的主要功能,其中许多功能和多细胞生物中的道相一致.随后,以TCDD中富功能注释的因为核心,通过CLR算法构建了TCDD相关因的相互作用网络,依照功能将其划分为2个亚网络,并在此础上推测了TCDD在四虫中的作用制型.结果显,四虫有成为在因组水平究毒物作用制的单细胞生物型的大潜力.; 畅悦冯立芳缪炜; 关键词：微阵列污染物

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畅悦